王建
- 作品数：1 被引量：1H指数：1
- 供职机构：青岛农业大学农学与植物保护学院更多>>
- 发文基金：国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 马铃薯纺锤块茎类病毒内蒙古分离株的克隆及序列分析被引量：1
- 2016年
- 采用内蒙古自治区采集的感染马铃薯纺锤块茎类病毒(Potato spindle tuber viroid,PSTVd)的马铃薯材料,克隆了PSTVd的全长基因,命名为内蒙古分离株(PSTVd-IM),对其序列进行分析。结果表明,该序列大小为359 bp,其与俄罗斯的PSTVd分离株(EF044305.1)序列吻合。将该分离物与国内外已经报道的PSTVd株系进行了比较,构建了系统进化树,确定了其分类地位;通过序列比对和二级结构分析,发现PSTVd-IM与已报道的PSTVd三类致病类型株系:强株系(U23058.1)、中间株系(AY937179.1)和弱株系(M14814.1)的同源性分别为97.78%,98.61%和99.44%;且与这三种类型株系在中央保守区、致病区和可变区结构域存在差异,说明这些结构域可能与其致病性相关。PSTVd-IM的序列与二级结构分析有利于明确其来源及致病性的差异位点,对于PSTVd的致病机制的研究具有重要意义。
- 王建迟胜起韩磊张剑峰梁文星
- 关键词：马铃薯纺锤块茎类病毒反转录-聚合酶链式反应
