张小玉
- 作品数:8 被引量:34H指数:4
- 供职机构:西南民族大学生命科学与技术学院更多>>
- 发文基金:四川省科技创新产业链示范工程中央高校基本科研业务费专项资金四川省教育厅资助科研项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 藏鸡磷酸酪氨酸互作结构域1(PID1)的克隆及组织表达谱研究被引量:5
- 2016年
- 本研究旨在阐明藏鸡PID1基因在不同组织与时序表达谱,并研究PID1基因表达与肌内脂肪含量(IMF)的关系。利用RT-PCR技术克隆藏鸡PID1基因,用相关软件预测PID1蛋白的结构和功能,采用荧光定量PCR研究PID1基因在藏鸡不同组织、不同日龄的表达谱,并分析其与IMF的相关性。结果显示,克隆得到藏鸡PID1基因序列长度为654bp(GenBank登录号:KT000001),共编码217个氨基酸,是具有PTB结构域的不稳定亲水酸性蛋白质;有14个磷酸化位点、4个O-糖基化位点、1个N-糖基化位点、7种保守特异性蛋白激酶结合位点、3个二硫键;预测其二级结构中α-螺旋占26.73%,β折叠占20.74%,无规则卷曲占52.53%,属于混合型蛋白且主要存在于细胞质中。荧光定量PCR结果显示,PID1基因在藏鸡的不同组织中均存在表达,且在脂肪组织中表达水平最高(P<0.01);时序表达谱结果显示,PID1基因在1日龄公藏鸡胸肌中表达水平最高。在210日龄的公鸡腿肌的表达量极显著高于其他日龄的表达水平(P<0.01),在119日龄母鸡腿肌的表达量极显著高于其他日龄表达水平(P<0.01)。在119和154日龄公鸡脂肪组织中表达水平较高,在210日龄母鸡脂肪组织中的表达量最高(P<0.01)。相关性分析结果显示,PID1mRNA的表达量与藏鸡胸肌的IMF含量存在显著相关(P<0.05)。结果提示,PID1基因可能是影响藏鸡IMF沉积的候选基因。
- 聂晓庆林亚秋徐亚欧赵燕英吕明左璐璐张小玉李想
- 关键词:藏鸡克隆肌内脂肪
- 山羊CCRL2基因的分子克隆和表达分析
- 2017年
- 本研究旨在克隆山羊趋化因子(C-C基序)受体2(chemokine(C C motif)receptor-like 2,CCRL2)基因序列,并研究其组织和时序表达谱。以简州大耳羊为试验材料,应用RT-PCR方法克隆CCRL2基因并进行生物信息学分析,qPCR方法构建该基因在山羊不同组织表达谱和不同月龄背最长肌、股二头肌和臂三头肌中的表达水平,并将基因表达与IMF含量进行相关分析。结果显示:克隆得到山羊CCRL2基因(GenBank登录号:KT165378)长度为1 143bp,编码区长度为1 047bp;qPCR分析表明,CCRL2mRNA在24月龄山羊心、肝、脾、肺、肾、脂肪、背最长肌、股二头肌和臂三头肌中均有不同程度的表达,其中脾表达量最高(P<0.01);时序表达中,CCRL2基因在股二头肌和臂三头肌中的表达量均在8~10月龄极显著高于1~3和24月龄(P<0.01),在背最长肌中则为24月龄极显著高于1~3和8~10月龄(P<0.01);相关分析显示,股二头肌中CCRL2基因mRNA表达量与IMF含量呈极显著负相关(P<0.01)。CCRL2基因可能参与山羊IMF沉积作用。
- 廖红海林亚秋朱江江李倩李倩张小玉林森王永
- 关键词:山羊克隆表达谱肌内脂肪
- 藏山羊FGF21基因克隆及生物信息学分析被引量:3
- 2016年
- 为探讨藏山羊FGF21基因的分子结构特征,利用RT-PCR技术对该基因进行克隆、测序及相关生物信息学分析。结果表明:获得藏山羊FGF21基因序列650 bp,ORF长度为634 bp,编码209个氨基酸。氨基酸序列分析显示,藏山羊FGF21编码蛋白属于不稳定酸性蛋白,分子式为C1 022H1 596N276O296S5,分子质量为22.65 ku。预测该蛋白含有13个磷酸化位点,并与多种蛋白存在相互作用;无跨膜结构域,有信号肽结构。在47~164位氨基酸残基存在FGF结构域。亚细胞定位显示,FGF21蛋白大部分位于细胞质内。同源性分析指出山羊FGF21氨基酸序列保守性较高,与Gen Bank中藏羚羊、牛、印度水牛及猪等的同源性在90%~99%。本研究结果为阐明FGF21基因在藏山羊中的作用提供重要的基础数据。
- 沈阅林亚秋梅寒李想张小玉
- 关键词:藏山羊克隆生物信息学分析
- 山羊GPR1基因的克隆及表达特征分析被引量:5
- 2016年
- 本文旨在克隆山羊GPR1基因,对其进行序列分析,并研究组织表达。以简州大耳羊为试验材料,应用RT-PCR方法克隆山羊GPR1基因并进行生物信息学分析,利用实时荧光定量PCR构建组织表达谱。结果表明:山羊GPR1基因编码区长度为987 bp(Gen Bank登录号:KT347601),编码蛋白为稳定疏水蛋白;存在7个跨膜结构域,在69~304氨基酸序列属于G蛋白偶联受体家族保守结构域(Pfam:7tm-1);荧光定量PCR分析表明,GPR1在24月龄山羊心、肝、脾、肺、肾、脂肪、背最长肌、股二头肌和臂三头肌中均有不同程度的表达,其中肺脏中表达量最高且极显著高于其他组织(P〈0.01),脂肪、脾、肝和心次之,股二头肌中表达量最低;GPR1基因在1~3月龄与24月龄表达变化趋势相同,由背最长肌、股二头肌和臂三头肌呈现逐渐上升的趋势,而8~10月龄则呈现相反的变化趋势。该实验结果为进一步研究GPR基因提供理论基础。
- 廖红海林亚秋朱江江李倩王永林森张小玉
- 关键词:山羊克隆生物信息学分析
- 山羊FGF21基因克隆及其在肌内脂肪细胞中的表达模式研究被引量:13
- 2017年
- 本研究旨在获得山羊FGF21基因序列,阐明其组织表达特性,同时检测FGF21基因与FGF受体(FGFR)在山羊肌内前体脂肪细胞分化过程中的表达水平。以简州大耳羊为试验动物,采用II型胶原酶消化获得山羊原代肌内前体脂肪细胞,采用RT-PCR技术克隆山羊FGF21基因,利用荧光定量PCR(qPCR)技术检测FGF21基因在成年山羊不同组织中的表达特性及FGF21与FGF受体在山羊肌内前体脂肪细胞分化过程中的表达差异。结果,克隆获得山羊FGF21基因(GenBank登录号:KT288195)全长序列666bp,其中开放阅读框630bp,编码209个氨基酸。FGF21mRNA在山羊心、肝、脾、肺、肾、脂肪和背最长肌中均检测到表达,且在肝和脂肪中存在较高水平表达。FGF21基因与FGFR1、FGFR2表达模式相同,均是在诱导分化第2天的肌内脂肪细胞中表达水平最高,极显著高于其他天数(P<0.01)。FGF21基因在山羊脂肪组织中存在较高水平的表达,并且在诱导分化的肌内前体脂肪细胞成脂分化第2天表达水平最高,推测其可能通过受体FGFR1或FGFR2在山羊肌内前体脂肪细胞分化早期发挥调控作用,此研究结果为进一步揭示FGF21基因在山羊肌内脂肪沉积中的作用机制提供了数据支持。
- 李倩林亚秋朱江江林森张小玉王永
- 关键词:FGFR山羊克隆
- 藏系绵羊BMP2基因克隆及组织表达分析被引量:2
- 2018年
- 本研究旨在克隆藏系绵羊BMP2基因序列,并获得其生物学特征,同时阐明其组织表达规律。提取藏系绵羊皮肤组织的总RNA,利用RT-PCR技术克隆BMP2基因序列,同时利用荧光定量PCR技术检测该基因在不同组织中的表达情况。结果表明,获得藏系绵羊BMP2基因序列1 217 bp,其中CDS区长度为1 188 bp,编码395个氨基酸。BMP2蛋白有36个磷酸化位、6个糖基化位点和1个跨膜结构,属于不稳定不溶性碱性蛋白,主要在细胞核和线粒体中发挥生物学作用。藏系绵羊BMP2氨基酸序列与山羊、绵羊和牛等的氨基酸同源性很高。BMP2基因在藏系绵羊肺脏组织中表达水平最高,极显著高于其他组织(p〈0.01)。本研究结果将为进一步研究藏系绵羊BMP2基因的结构和功能提供参考资料。
- 张津闽张小玉林森黄林郑玉才林亚秋
- 关键词:藏系绵羊BMP2克隆
- 牦牛KLF10基因克隆及组织表达分析被引量:1
- 2017年
- 为了获得牦牛KLF10基因序列及分析其序列生物学特征,并阐明其组织表达规律,试验采用RT-PCR方法克隆麦洼牦牛KLF10基因序列,荧光定量PCR(Quantitativereal-time PCR,q PCR)方法检测该基因在几种器官组织中的表达情况。结果表明:获得牦牛KLF10基因序列(Gen Bank登录号为KX395177),长度为1 460 bp,其中CDS为1 452 bp,编码483个氨基酸。KLF10基因在牦牛的肝脏和肺脏中存在高水平表达,极显著高于其他器官组织(P<0.01)。
- 田苗左璐璐张小玉柏雪江明锋林亚秋
- 关键词:牦牛克隆