费春红
- 作品数:5 被引量:12H指数:2
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- 牦牛CAPN1和CAST基因克隆及其序列分析
- 钙激活蛋白酶(Calpains)是一类特异性依钙激活的中性半胱氨酸内肽酶,其广泛地分布于绝大多数动物细胞中。其中μ-calpain是在体内由微摩尔钙激活的无组织特异性的钙蛋白酶,其大亚基蛋白编码基因为CAPN1基因。钙蛋...
- 费春红
- 关键词:牦牛CAPN1基因基因序列
- 文献传递
- 山羊、绵羊MT-IV分子特性研究被引量:2
- 2008年
- 金属硫蛋白(MTs)是一类低分子量、金属和半胱氨酸含量高的细胞质蛋白,哺乳动物的MTs包括MT-I、MT-Ⅱ、MT-Ⅲ和MT-Ⅳ4种亚型,其中MT-Ⅳ只在磷状复层扁平上皮细胞中表达,相关研究报道较少。本研究根据GenBank已公布的动物MT-Ⅳ基因序列,设计出扩增山羊和绵羊MT-Ⅳ基因的特异性PCR引物MT-IVSP1和MT-ⅣSP2,利用RT-PCR的方法,分别从山羊和绵羊的瘤胃组织mRNA中,克隆出山羊和绵羊的MT-IV基因编码区序列(均为189bp),序列登录GenBank,获得序列号EF470251和EF624067。通过序列分析,表明山羊和绵羊两个物种MT-Ⅳ基因编码区全编码均为189bp、编码62个氨基酸,其中绵羊的MT-Ⅳ含有20个半胱氨酸,而山羊第6l位保守的半胱氨酸被色氨酸所代替。两个物种的MT-IV均不含芳香族氨基酸,含有MTs特有的C—X—C、C—X—X—C、C—C—X-C.C结构,无明显的跨膜结构域,无信号肽,是一种细胞质蛋白。二级结构分析表明两个物种的MT-Ⅳ二级结构大多数为无规则卷曲结构,分别在第7-9和第49~51氨基酸残基性存在折叠结构,不存在螺旋结构。三级结构预测结果表明两个物种MT-Ⅳ的三级结构由0c和D两个结构域组成,其中β结构域相同,仪结构域山羊少一个半胱氨酸残基,其结构与绵问存在明显差异,这一差异可能对山羊MT-Ⅳ的生理功能产生一定影响,有必要深入研究。
- 王佳张利平杨联费春红王磊谢超吴建平
- 关键词:绵羊山羊CDNA蛋白质结构
- 牦牛钙激活蛋白酶抑制蛋白CAST基因克隆及其测序分析
- <正>引言牦牛是生存于青藏高原,海拔3000米以上的特有畜种,牦牛肉符合天然食品标准,具有广阔的市场前景。牛肉嫩度被认为是影响消费者满意程度与口感要求的最重要因素之一,牦牛肉嫩度较差,Barner-Bratzler剪切
- 王建华吴建平费春红杨联张利平
- 关键词:牦牛基因克隆
- 文献传递
- 牦牛CAPN1基因的克隆与序列分析被引量:8
- 2007年
- CAPN1是影响肌肉嫩度的数量性状位点(QTL)的候选基因。根据GenBank发表的普通牛CAPN1基因序列设计特异性引物,以天祝白牦牛cDNA为模板,分段进行PCR扩增,克隆,测序。应用生物软件BioEdit对各测序结果进行序列拼接共获得牦牛CAPN1cDNA片段2267bp,其中包含一个2151bp的完整的开放阅读框(ORF),以及3′和5′末端非编码区的部分序列(77bp和166bp)。分析表明:牦牛CAPN1基因编码区全长2151bp,共编码716个氨基酸。与已报道的牛,猪,人小鼠的序列进行比较,核苷酸同源性分别为99.3%,93.9%,90.0%,85.5%。预测氨基酸的同源性分别为99.4%,96.1%,94.6%,89.0%,并且对牦牛CAPN14个结构域分别进行NCBIBLAST发现4个结构域在以上4个物种中都显示出很好的保守性,最为保守的在结构域Ⅳ(>96%)。牦牛与牛产生的14个核苷酸突变中,有3个产生了氨基酸突变,均发生在结构域Ⅲ。构建分子系统进化树表明:聚类结果与传统分类学相符。
- 费春红吴建平杨联张利平王佳
- 关键词:牦牛克隆
- 牦牛钙激活酶系统(Calpains)基因克隆与SNP研究
- 吴建平张利平雒林通万红玲汪晓娟雷赵民王欣荣成述儒赵生国王建福费春红吴孝杰王建华
- 本项目主要研究了不同年龄牦牛宰后背最长肌成熟过程的肉质特性;对牦牛钙蛋白酶系统基因进行了克隆及SNPs位点检测,寻找到牦牛肉品质分子标记辅助选择的有效标记位点;进一步检测了牦牛背最长肌CAPN1基因和CAST基因mRNA...
- 关键词:
- 关键词:牦牛肉品质钙蛋白酶系统基因克隆