王佳
- 作品数:6 被引量:14H指数:2
- 供职机构:甘肃农业大学更多>>
- 发文基金:国家教育部博士点基金教育部科学技术研究重点项目更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 牦牛MT-IV基因克隆与序列分析被引量:4
- 2008年
- 采用RT-PCR方法,利用特异性引物YMT-IVSP1和YMT-IVSP2先克隆出牦牛Bos grunniens MT-IV的编码区序列全长,将其与人MT-IV基因全序列比对,设计2对引物分别克隆内含子1和内含子2,将获得序列拼接后得到了牦牛MT-IV外显子与内含子全长为2 099 bp(GenBank Accession No.:EU665491),编码区序列长189 bp,编码62个氨基酸,20个半胱氨酸残基,不含芳香族氨基酸,2个内含子的长度分别为1 392和518 bp。将牦牛MT-IV基因编码区序列和氨基酸序列BLAST搜索结果表明,MT-IV在物种间高度保守。牦牛MT-IV氨基酸序列与牛、绵羊、山羊、狗、家鼠、人和马的比对表明,MT-IV包含有金属硫蛋白(MTs)特有的C-X-C、C-C-X-C-C、C-X-X-C结构域,构建的系统发育树与比较生理学和形态学相同,表明牦牛MT-IV具有与其他哺乳动物相同的分子特性,有必要进行牦牛MT-IV在上皮细胞中表达量水平的研究。
- 杨联张利平王磊王佳吴建平
- 关键词:牦牛基因克隆生物信息学分析
- 反刍家畜MT-Ⅳ基因表达部位研究及克隆、序列分析
- 金属硫蛋白(MTs)是一类低分子量、富含半胱氨酸的金属结合蛋白,广泛存在于细菌、真菌、植物、无脊椎动物和脊椎动物中,因其功能独特,近年来对MT各方面的研究也日益受到重视。它能够清除体内自由基防治衰老,增强机体对不良环境的...
- 王佳
- 关键词:反刍家畜金属硫蛋白基因克隆DNA文库
- 文献传递
- 一种环保型林业绿化灌溉装置
- 本实用新型涉及环境保护领域,具体是一种环保型林业绿化灌溉装置,包括箱体,所述箱体设置在地面下方,箱体下端连接有总水管,总水管下端伸出箱体之外,总水管上端连接有升降管,升降管下端连接有弹簧,弹簧末端与箱体相连接,升降管下端...
- 王佳田青王理德何洪盛宋达成马兴存陈珍新
- 文献传递
- 反刍家畜MT-IV基因表达部位研究及克隆、序列分析
- 金属硫蛋白(MTs)是一类低分子量、富含半胱氨酸的金属结合蛋白,广泛存在于细菌、真菌、植物、无脊椎动物和脊椎动物中,因其功能独特,近年来对MT各方面的研究也日益受到重视。它能够清除体内自由基防治衰老,增强机体对不良环境的...
- 王佳
- 关键词:金属硫蛋白分子克隆
- 文献传递
- 山羊、绵羊MT-IV分子特性研究被引量:2
- 2008年
- 金属硫蛋白(MTs)是一类低分子量、金属和半胱氨酸含量高的细胞质蛋白,哺乳动物的MTs包括MT-I、MT-Ⅱ、MT-Ⅲ和MT-Ⅳ4种亚型,其中MT-Ⅳ只在磷状复层扁平上皮细胞中表达,相关研究报道较少。本研究根据GenBank已公布的动物MT-Ⅳ基因序列,设计出扩增山羊和绵羊MT-Ⅳ基因的特异性PCR引物MT-IVSP1和MT-ⅣSP2,利用RT-PCR的方法,分别从山羊和绵羊的瘤胃组织mRNA中,克隆出山羊和绵羊的MT-IV基因编码区序列(均为189bp),序列登录GenBank,获得序列号EF470251和EF624067。通过序列分析,表明山羊和绵羊两个物种MT-Ⅳ基因编码区全编码均为189bp、编码62个氨基酸,其中绵羊的MT-Ⅳ含有20个半胱氨酸,而山羊第6l位保守的半胱氨酸被色氨酸所代替。两个物种的MT-IV均不含芳香族氨基酸,含有MTs特有的C—X—C、C—X—X—C、C—C—X-C.C结构,无明显的跨膜结构域,无信号肽,是一种细胞质蛋白。二级结构分析表明两个物种的MT-Ⅳ二级结构大多数为无规则卷曲结构,分别在第7-9和第49~51氨基酸残基性存在折叠结构,不存在螺旋结构。三级结构预测结果表明两个物种MT-Ⅳ的三级结构由0c和D两个结构域组成,其中β结构域相同,仪结构域山羊少一个半胱氨酸残基,其结构与绵问存在明显差异,这一差异可能对山羊MT-Ⅳ的生理功能产生一定影响,有必要深入研究。
- 王佳张利平杨联费春红王磊谢超吴建平
- 关键词:绵羊山羊CDNA蛋白质结构
- 牦牛CAPN1基因的克隆与序列分析被引量:8
- 2007年
- CAPN1是影响肌肉嫩度的数量性状位点(QTL)的候选基因。根据GenBank发表的普通牛CAPN1基因序列设计特异性引物,以天祝白牦牛cDNA为模板,分段进行PCR扩增,克隆,测序。应用生物软件BioEdit对各测序结果进行序列拼接共获得牦牛CAPN1cDNA片段2267bp,其中包含一个2151bp的完整的开放阅读框(ORF),以及3′和5′末端非编码区的部分序列(77bp和166bp)。分析表明:牦牛CAPN1基因编码区全长2151bp,共编码716个氨基酸。与已报道的牛,猪,人小鼠的序列进行比较,核苷酸同源性分别为99.3%,93.9%,90.0%,85.5%。预测氨基酸的同源性分别为99.4%,96.1%,94.6%,89.0%,并且对牦牛CAPN14个结构域分别进行NCBIBLAST发现4个结构域在以上4个物种中都显示出很好的保守性,最为保守的在结构域Ⅳ(>96%)。牦牛与牛产生的14个核苷酸突变中,有3个产生了氨基酸突变,均发生在结构域Ⅲ。构建分子系统进化树表明:聚类结果与传统分类学相符。
- 费春红吴建平杨联张利平王佳
- 关键词:牦牛克隆