肖奕
- 作品数:43 被引量:39H指数:3
- 供职机构:华中科技大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金内蒙古自治区自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学自动化与计算机技术医药卫生文化科学更多>>
- dRMSD方法再现蛋白质结构对称性
- <正>dRMSD(distance root-mean-square deviation)通常被用来定义两个蛋白质结构之间的距离,从而来评价它们的相似性。基于这种观点,本文将此方法延伸来检验蛋白质局部结构的对称性。我们认...
- 陈寒林肖奕
- 文献传递
- RNA扭转角预测的深度学习方法
- 2023年
- RNA分子三级结构模建是分子生物物理学研究的基本问题之一,对理解RNA的功能和设计新的结构有重要意义.RNA三级结构主要由主链和侧链上的7个扭转角确定,准确预测这些扭转角是RNA分子三级结构模建的基础.目前只有个别采用深度学习模型预测RNA分子扭转角的方法,要用于模建RNA分子的三级结构其预测精度还有待进一步提高.本文提出了一种预测RNA分子扭转角的深度学习方法1dRNA,采用了考虑相邻核苷酸的卷积模型(DRCNN)和考虑全链核苷酸的超长短期记忆模型(DHLSTM)两种不同的深度学习模型.结果显示,与现有方法相比,这两种模型都能提高RNA分子大部分扭转角的预测精度,DRCNN预测精度提高在5%到28%之间,DHLSTM预测精度提高在6%到15%之间.结果还显示,α和g角是最难预测的,环区扭转角比螺旋区的扭转角难预测,模型对预测序列长度的变化不敏感,模型预测角度与decoys的角度偏差可用于模型质量评估.
- 欧秀娟肖奕
- 蛋白质序列的对称性
- <正>蛋白质根据空间结构的形状可以分为不同折叠类型,其中一部分折叠类型的蛋白质的空间结构具有明显的对称性。如果蛋白质的三级结构由一级结构决定,那么氨基酸序列应该编码三级结构的这种对称性,但蛋白质序列的氨基酸排列看起来近似...
- 肖奕
- 文献传递
- 基于二级结构的RNA三级结构预测
- 赵蕴杰龚洲肖奕
- 关键词:RNA
- 西江下游地区民间书院建筑形态研究
- 书院在中国教育历史上曾发挥着重要的作用,而作为具有普及文化教育等重要意义的民间书院,其本身的社会关注度则相对较低,对西江下游地区民间书院更是缺乏深入且系统性地研究。而在书院的学术研究中,学界多是以文史角度关注于书院地研究...
- 肖奕
- 关键词:建筑形态
- 酵母蛋白质相互作用网络的模块进化
- 2009年
- 正如生物大分子的序列分析是基因组和生物信息学中的基本分析工具一样,生物大分子功能相关的网络分析正成为系统生物学研究的重要工具和手段。
- 李立肖奕孙之荣
- 关键词:随机网络蛋白相互作用进化模式蛋白质相互作用
- 论实施人文素质教育的现实意义被引量:1
- 2001年
- 人文素质教育是实施素质教育的关键,在新时期,时代对人文素质教育提出了新的要求,科技的创新,人的创新能力的培养,都离不开人文素质教育.
- 林林卫幸芝肖奕潘卫国
- 关键词:人文素质教育素质教育
- 大麻受体2型和G蛋白的相互作用计算
- 李林郭大川肖奕
- 关键词:蛋白-蛋白相互作用
- 生物分子序列和结构的非线性动力学方法分析
- 肖奕黄延昭
- 主要成果:1、在蛋白质序列关联性分析中,解释了国际上存在的两种矛盾结果,并且发现了蛋白质序列编码结构的一种新的方式。2、在DNA序列非线性关联分析中,发现其中一些序列的长程关联的起因并不是通常大家认为的序列中内含子和重复...
- 关键词:
- 关键词:非线性动力学蛋白质序列关联性分析DNA
- 大麻受体2型和G蛋白的相互作用计算
- <正>大麻受体(Cannabinoid receptor,CB)可分为大麻素1型(CB1)和2型(CB2)受体两种类型。CB1受体在中枢神经系统和外周初级感觉神经元上均有分布,而CB2受体
- 李林郭大川肖奕
- 关键词:蛋白-蛋白相互作用
- 文献传递