赵蕴杰
- 作品数：15 被引量：9H指数：2
- 供职机构：江汉大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术理学医药卫生更多>>
- 阻止菜豆凝集素聚合并抑制凝血毒性的多肽及其基因和用途
- 本发明公开了一种阻止菜豆凝集素聚合并抑制凝血毒性的多肽及其基因和应用，所述多肽的氨基酸序列如SEQ ID NO：1所示。本发明通过计算机模拟实验和生化实验定量研究菜豆凝集素凝血毒性的强弱，并利用Fmoc固相合成的方法合成...
- 赵蕴杰刘琴喻艳华陈禅友曾辰
- 文献传递
- 蛋白质-RNA相互作用界面预测与设计
- 2012年
- 蛋白质-RNA之间的相互作用是蛋白质在细胞里面行使功能的重要方式之一.结构生物学家利用实验手段可以得到蛋白质-RNA复合物的三维结构,通过原子水平的晶体结构来解释蛋白质与RNA的识别过程.但实验取得蛋白质-RNA的复合物结构非常困难,耗钱、耗时,同时受限于其相互作用强度.因而利用理论的方法对蛋白质-RNA相互作用界面进行预测与设计在生物医学研究中十分重要.本文主要综述了近期蛋白质-RNA相互作用界面预测与设计方面的进展,包括以下几个方面:(1)蛋白质-RNA分子对接算法以及对接前后存在的构象变化的处理;(2)蛋白质-RNA识别机制的研究;(3)基于蛋白质-RNA相互作用界面的分子设计.蛋白质-RNA分子对接算法逐步完善将有助于我们对大量未知功能的蛋白质与RNA进行功能注释,而基于生物大分子相互作用界面的分子设计将在药物设计领域中有广阔的应用前景.
- 黄阳玉阳秀凤李昊田纪晓峰程洪礼赵蕴杰郭大川李林刘士勇
- 关键词：分子对接
- 非编码RNA结构预测研究
- 非编码RNA具有十分重要的生物学功能,研究它们的三级结构具有重要意义。构建或预测非编码RNA的三级结构是近年来研究的热点问题之一,已经取得了很大的进展,但是仍然局限于简单拓扑和短RNA分子。因此,预测非编码RNA三级结构...
- 赵蕴杰
- 关键词：分子动力学
- 文献传递
- RNA分子动力学模拟中不同AMBER分子力场与溶剂模型匹配的研究
- 2009年
- 自1984年,分子动力学模拟方法首次应用于研究酵母丙氨酸转运RNA的动力学特征以来。分子动力学方法在研究RNA分子的折叠机制,动力学特性。
- 龚洲赵蕴杰肖奕
- 关键词：RNA分子动力学
- RNA分子动力学模拟中不同AMBER分子力场与溶剂模型匹配的研究
- 龚洲赵蕴杰肖奕
- 关键词：RNA分子动力学
- 基于二级结构的RNA三级结构预测
- 赵蕴杰龚洲肖奕
- 关键词：RNA
- 基于复杂动态网络的药物筛选与药物设计
- 生物病毒防御是全球公共卫生防控的重要对象，例如人类免疫缺陷病毒、禽流感、中东呼吸综合症、塞卡病毒等的肆虐严重危害公众健康。药物筛选或药物设计的方法是在已知疾病靶标蛋白的情况下从药物分子库中高通量筛选，或利用分子建模和对接...
- 赵蕴杰
- 关键词：动态网络动力学模拟药物筛选药物设计
- 植物凝集素结构多样性与药物设计
- 2015年
- 植物凝集素蛋白最早发现于19世纪,可特异性结合碳水化合物与糖分子。植物凝集素蛋白结合碳水化合物的高度特异性使我们可以将其作为生物工具应用到不同领域。例如,植物凝集素的重要特征之一就是可以特异性结合昆虫消化道表面的糖分子,从而起到抗虫的作用。植物凝集素也可以特异性结合癌细胞膜表面的糖分子,从而导致细胞凋亡或抑制肿瘤的生长。研究表明,仅豆科植物的凝集素分子表面就有大约40万个潜在的结合位点可以特异性结合不同的糖分子。因此,研究植物凝集素的结构特征信息对更好地理解植物凝集素的结构功能关系与应用有重要的意义。近年来,计算生物学的飞速发展使我们可以在分子层次上研究植物凝集素。本文主要从计算生物学角度综述植物凝集素的结构,序列保守性与动力学等研究现状,并以菜豆凝集素为例讨论植物凝集素的药物设计和医学应用。
- 赵蕴杰刘志超刘琴陈高陈禅友曾辰
- 关键词：植物凝集素进化药物设计
- 阻止菜豆凝集素聚合并抑制凝血毒性的多肽及其基因和用途
- 本发明公开了一种阻止菜豆凝集素聚合并抑制凝血毒性的多肽及其基因和应用，所述多肽的氨基酸序列如SEQ？ID？NO：1所示。本发明通过计算机模拟实验和生化实验定量研究菜豆凝集素凝血毒性的强弱，并利用Fmoc固相合成的方法合成...
- 赵蕴杰刘琴喻艳华陈禅友曾辰
- 文献传递
- RNA分子动力学模拟中不同AMBER分子力场与溶剂模型匹配的研究
- ＜正＞自1984年,分子动力学模拟方法首次应用于研究酵母丙氨酸转运RNA的动力学特征以来。分子动力学方法在研究RNA分子的折叠机制,动力学特性,热稳定性等方面
- 龚洲赵蕴杰肖奕
- 关键词：RNA分子动力学
- 文献传递
