尹小丽
- 作品数：5 被引量：7H指数：2
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- 人乳头瘤病毒编码蛋白的进化分析
- 2016年
- 目的构建20种常见高低危型HPV编码蛋白进化树,分析其进化关系。方法从NCBI数据库中获取常见20种高低危型HPV的8种编码蛋白完整氨基酸序列,通过MEGA6.0软件中邻位连接法(neighbor-joining,NJ)构建系统亲缘进化树,进行进化分析。结果低危型HPV6、11和42亚型单独处于一分支上,并与高危型HPV分开。在高危型中,HPV18、39、45、59和68亚型,HPV16、31和35亚型以及HPV33、52和58亚型的HPV基因组8种编码蛋白均分别聚集在同一支上,而高危型HPV73的8种编码蛋白在进化树上的位置均不固定。在构建的E2和E6蛋白进化树中分歧支较多,结果较不可信。结论在蛋白进化树中常见低危型HPV均单独处于一支,且与高危型HPV分开,12个高危型HPV分布于3个不同分支或位置不固定。
- 代运章尹小丽张士娥韩金祥鲁艳芹
- 关键词：人乳头瘤病毒系统进化树亲缘关系结构蛋白
- 大鼠骨髓间充质干细胞向成骨与成脂分化过程中相关基因的表达变化被引量：1
- 2018年
- 目的探讨大鼠骨髓间充质干细胞(bone marrow mesenchymal stem cells,BMSCs)向成骨与成脂分化过程中相关基因表达的变化。方法采用全贴壁法分离培养大鼠BMSCs,并观察其形态学特征的变化,MTT法检测其生长状况,并绘制生长曲线。分别采用成骨和成脂诱导剂对第4代BMSCs进行诱导分化,应用碱性磷酸酶试剂盒、茜素红和油红O染色液检测其ALP活性、成骨和成脂分化能力;RT-QPCR检测诱导0、7、14和21 d的成骨分化相关基因Runt相关转录因子2(Runx2)、骨钙素(osteocalcin,OCN)、碱性磷酸酶(ALP)及成脂分化相关基因过氧化物酶体增殖物激活受体γ(peroxidase proliferator activated receptor gamma,PPARγ)和脂肪酸结合蛋白(FABP4)的表达变化。结果全骨髓贴壁法能成功分离培养BMSCs,传代细胞生长增殖迅速,以长梭形细胞生长为主,细胞生长曲线呈S形。第4代BMSCs分别经成骨和成脂诱导剂诱导后,ALP、茜素红和油红O染色均呈阳性;诱导7、14和21 d后,Runx2、OCN、ALP、PPARγ和FABP4基因mRNA的表达量均显著高于0 d(P<0.05);成骨分化过程中,Runx2和ALP在第7天时表达量最高,之后呈下降趋势,OCN的表达量呈稳定上升趋势;成脂分化过程中,PPARγ在第7天时表达量最高,FABP4始终高表达。结论 BMSCs具有易于体外分离培养、扩增和经诱导后具有多向分化潜能等特点,成骨和成脂分化相关基因的表达量随诱导时间延长而变化,呈明显的时序性表达差异,提示分别在成骨与成脂分化过程中起重要调控作用,为BMSCs在骨、细胞和基因等工程中的机制研究提供了实验依据。
- 尹小丽鲁艳芹刘保岩韩金祥
- 关键词：骨髓间充质干细胞成骨分化成脂分化
- 4例软骨发育不全患者FGFR3基因突变检测被引量：2
- 2018年
- 目的对4例临床诊断为软骨发育不全(ACH)患者进行成纤维细胞因子受体3(FGFR3)基因突变检测。方法提取4例患者及父母外周血DNA,设计FGFR3基因外显子10的引物序列,应用聚合酶链反应(PCR)扩增,并对扩增产物进行测序,通过Mutation Survey软件分析突变位点。结果 4例ACH患者均存在FGFR3基因第10外显子1138位点G>A碱基转换,导致FGFR3的第380位氨基酸由甘氨酸(Gly)变为精氨酸(Arg)。结论 FGFR3基因10号外显子c.1138G>A的杂合突变是造成ACH的主要致病原因,FGFR3基因突变检测为产前基因诊断提供了实验依据。
- 尹小丽尹小丽鲁艳芹张遥张遥马翔
- 关键词：软骨发育不全基因突变
- MiR-4316靶向IFITM5抑制Saos-2细胞矿化的研究
- MicroRNA（miRNA）是一类高度保守的内源性单链非编码小分子RNA，在基因表达调控过程中起着非常重要的作用，它通过结合于靶基因的特定序列，对基因进行转录后调控，使靶基因的mRNA降解或抑制相应蛋白质翻译表达，从而...
- 尹小丽
- 关键词：SAOS-2细胞成骨分化
- 文献传递
- 5种高危型HPVE7蛋白B细胞表位的预测被引量：4
- 2017年
- 目的预测并分析我国人群常见人乳头瘤病毒HPV16、18、33、52与58亚型E7蛋白的线性B细胞表位。方法在NCBI数据库中获取5种高危型HPVE7蛋白氨基酸序列,采用ClustalX2软件进行多序列比对;运用ExPASY服务器SOPMA和GOR4法预测二级结构,采用Kyte-Doolittle方案和Hopp-Wood方案预测亲水性;运用Bepipred和ABCpred软件预测B细胞表位,辅以抗原性指数,综合评判几率较大的B细胞优势表位。结果综合多参数分析,5种HPV亚型的B细胞表位均集中在蛋白质的N端2-50位附近,其中预测的HPV16与52亚型的第16-21位氨基酸序列一致性为100%,均为QPETTD;HPV16型第28-41位(LNDSSEEEDEIDGP)与HPV52型第28-38位(LGDSSDEEDTD)的氨基酸序列一致性为78%;HPV16型第42-50位(AGQADEPRA),HPV33型第31-46位(SSDEDEGLDRP),HPV52型第36-46位(DTDGVDRPDGQ)和HPV58型第73-78位(TTTDVR)为各自的特异B细胞表位。结论生物信息学方法预测5种HPV的B细胞表位均集中在蛋白质的N端2-50位附近,同时具有特异的B细胞表位(18型除外),可为宫颈癌的诊断、预防和新型疫苗的研制提供参考。
- 尹小丽王学政代运章张士娥朱有名鲁艳芹韩金祥
- 关键词：人乳头瘤病毒E7蛋白B细胞表位
