本研究采用cDNA-AFLP技术建立了水稻与稻瘟病菌互作的基因表达图谱,对差异表达基因功能进行分析。利用64对引物进行筛选,共获得了960个转录衍生片段(transcript-derived fragment TDF)。回收测序200条片段,获得134条可读序列,通过BLAST比对分析,得到74个不重复的差异TDFs。对74个TDFs对应的聚丙烯酰胺凝胶上表达变化情况进行统计,接种稻瘟病菌后基因诱导表达上调多余下调表达,早期上调表达基因有6个,晚期上调表达基因有11个,其他形式上调表达基因32个,各种下调表达基因25个。
利用8个代表性菌株从153对引物组合中筛选出多态性高且稳定性好的10对引物组合,对来自黑龙江省各水稻主要产区的214个稻瘟病菌菌株进行RSAP(Restriction site amplified polymorphism)分析,得到134条多态性条带,经聚丙烯酰胺凝胶电泳,得到196个不同单元型(带型)的代表性菌株的指纹图谱。用UPGMA进行聚类分析,以相似系数0.83为界,将214个菌株196个单元型划分为10个遗传宗谱,10个遗传宗谱在黑龙江省的分布存在明显地域差异。
