吕明
- 作品数：7 被引量：15H指数：3
- 供职机构：西南民族大学生命科学与技术学院更多>>
- 发文基金：四川省畜禽育种攻关项目四川省应用基础研究计划项目国家级大学生创新创业训练计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 藏鸡PPARα基因克隆与生物信息学分析被引量：4
- 2015年
- 为阐明藏鸡PPARα基因的结构及功能,利用RT-PCR方法对PPARα基因进行克隆,并进行生物信息学分析.结果表明:克隆获得包括完整开放阅读框的藏鸡PPARα基因序列1430 bp,开放阅读框1404 bp,编码468个氨基酸;藏鸡PPARα蛋白分子量为52.23 ku,等电点为5.85,为不稳定酸性蛋白,存在27个磷酸化位点和4个糖基化位点,无信号肽和跨膜螺旋结构.预测其二级结构中α-螺旋占37.61%,β-折叠占16.67%,无规则卷曲比例占45.73%.该研究结果为揭示PPARα在藏鸡脂代谢中的作用奠定了基础.
- 林森徐亚欧林亚秋吕明廖红海李倩朱江江郑玉才王永
- 关键词：藏鸡PPARΑ克隆生物信息学分析
- 泸宁鸡MyoG基因的克隆及组织表达差异分析被引量：4
- 2015年
- 为了研究MyoG基因在鸡生长发育与肉质形成中的作用,试验以泸宁鸡为研究对象,采用RT-PCR技术克隆MyoG基因序列,并利用生物信息学的方法对其理化性质、氨基酸同源性等进行预测和分析,同时采用半定量方法检测MyoG基因在泸宁鸡不同组织中的表达水平。结果表明：泸宁鸡MyoG基因序列长度为741bp,其中开放阅读框（ORF）长度为684 bp,编码227个氨基酸,具有碱性螺旋-环-螺旋结构（bHLH）,与哺乳动物的同源性为70%~71%,与原鸡、火鸡、绿头鸭、游隼的同源性为91%~99%。组织表达谱结果表明,MyoG基因在泸宁鸡腿肌、胸肌、肝脏、肾脏、脑、脾脏、心脏中均有表达,在腿肌、胸肌、心脏中表达水平较高,在肝脏、肾脏和脑中表达水平较低,说明Myo G基因的表达主要集中于肌肉组织。
- 梅寒徐亚欧吕明张明刘红丽左斌石浩聂晓庆林亚秋
- 关键词：MYOG基因基因克隆
- 藏鸡THRSP基因的克隆及生物信息学分析被引量：1
- 2015年
- 对藏鸡THRSP基因进行克隆、序列测定及生物信息学分析.结果表明:获得的藏鸡THRSP基因核苷酸序列为428 bp(Gen Bank登陆号:KT153607),在50-258 bp处存在1个Cp G岛,ORF长度为390 bp,编码129个氨基酸,其中Leu所占比例为10.9%.THRSP蛋白分子量为14.18 ku,等电点(p I)为4.61,属于不稳定酸性核蛋白,存在8个磷酸化位点和5个O糖基化位点.预测其二级结构中α螺旋占51.2%,β折叠占3.1%,无规则卷曲占45.7%.同源性分析结果表明:藏鸡与原鸡THRSP基因核苷酸及预测的氨基酸序列同源性为100%,两者亲缘关系最近.
- 聂晓庆徐亚欧吕明左璐璐李想林亚秋
- 关键词：藏鸡基因克隆生物信息学分析
- 藏鸡磷酸酪氨酸互作结构域1(PID1)的克隆及组织表达谱研究被引量：5
- 2016年
- 本研究旨在阐明藏鸡PID1基因在不同组织与时序表达谱,并研究PID1基因表达与肌内脂肪含量(IMF)的关系。利用RT-PCR技术克隆藏鸡PID1基因,用相关软件预测PID1蛋白的结构和功能,采用荧光定量PCR研究PID1基因在藏鸡不同组织、不同日龄的表达谱,并分析其与IMF的相关性。结果显示,克隆得到藏鸡PID1基因序列长度为654bp(GenBank登录号:KT000001),共编码217个氨基酸,是具有PTB结构域的不稳定亲水酸性蛋白质;有14个磷酸化位点、4个O-糖基化位点、1个N-糖基化位点、7种保守特异性蛋白激酶结合位点、3个二硫键;预测其二级结构中α-螺旋占26.73%,β折叠占20.74%,无规则卷曲占52.53%,属于混合型蛋白且主要存在于细胞质中。荧光定量PCR结果显示,PID1基因在藏鸡的不同组织中均存在表达,且在脂肪组织中表达水平最高(P<0.01);时序表达谱结果显示,PID1基因在1日龄公藏鸡胸肌中表达水平最高。在210日龄的公鸡腿肌的表达量极显著高于其他日龄的表达水平(P<0.01),在119日龄母鸡腿肌的表达量极显著高于其他日龄表达水平(P<0.01)。在119和154日龄公鸡脂肪组织中表达水平较高,在210日龄母鸡脂肪组织中的表达量最高(P<0.01)。相关性分析结果显示,PID1mRNA的表达量与藏鸡胸肌的IMF含量存在显著相关(P<0.05)。结果提示,PID1基因可能是影响藏鸡IMF沉积的候选基因。
- 聂晓庆林亚秋徐亚欧赵燕英吕明左璐璐张小玉李想
- 关键词：藏鸡克隆肌内脂肪
- 藏山羊PID1基因克隆及组织表达分析
- 2016年
- 研究旨在获得藏山羊磷酸酪氨酸互作结构域(phosphotyrosine interaction domain containing l,PID1)基因序列,并进一步分析该基因的生物学特性以及揭示其组织表达规律。以藏山羊为材料,利用RT-PCR技术克隆PID1基因,利用荧光定量PCR检测其组织表达特性。结果表明,藏山羊PID1基因CDS区为654bp,编码217个氨基酸,为无跨膜结构的酸性不溶类蛋白。同源性分析表明,藏山羊与山羊的同源性较高为99%,且处在进化树的同一个分支上。PID1在藏山羊的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、脂肪、背最长肌、股二头肌和臂三头肌等组织中均检测到表达,但在脂肪组织中表达水平最高(P<0.01)。研究获得了藏山羊PID1基因序列,其在脂肪组织中的表达水平最高。
- 吕明林森朱江江王永梅寒廖红海李倩林亚秋
- 关键词：藏山羊基因克隆
- 藏鸡A-FABP基因和H-FABP基因的克隆及生物学信息分析
- 2015年
- 以藏鸡为研究对象,根据NCBI上登录的原鸡A-FABP和H-FABP基因序列设计引物,利用RT-PCR方法克隆藏鸡A-FABP和H-FABP基因的CDS区,并进行生物信息学分析.结果表明:藏鸡A-FABP和H-FABP基因的ORF分别为399 bp、402 bp,编码132、133个氨基酸;A-FABP和H-FABP分子量分别为14.91ku、14.84ku,等电点分别为6.34、5.92,均为亲水蛋白,无信号肽和跨膜结构.磷酸化位点分别有9、6个,O糖基化位点分别有10、5个;藏鸡A-FABP和H-FABP的氨基酸序列与原鸡的同源性最高,分别为99%、100%,在鸟类动物中序列比较保守.
- 梅寒王强徐亚欧吕明左璐璐聂晓庆林亚秋
- 关键词：藏鸡A-FABP基因H-FABP基因克隆
- MRFs家族基因在鲤鱼红肌和白肌中的表达差异被引量：1
- 2015年
- 为探索生肌调节因子(myogenic regulator factors,MRFs)家族基因在鲤鱼肌纤维形成中的基本作用,利用荧光定量PCR技术分别检测MRFs家族各成员在鲤鱼红肌、白肌中的表达差异,并与红肌纤维的标志基因My HCⅠ及白肌纤维的标志基因My HCⅡ的表达水平进行关联分析。结果表明,Myo D基因在鲤红肌中的表达极显著高于在白肌中的表达,并与My HCⅠ基因的表达呈显著正相关,Myf6在鲤鱼白肌中的表达极显著高于其在红肌中的表达水平,并与My HCⅡ基因的表达呈显著正相关,Myf5、Myo G在鲤鱼红肌、白肌中的表达水平差异不显著。
- 张明吕明李瑞文徐梓钧邬杨楠左璐璐林亚秋
- 关键词：腹肌
