王英明
- 作品数：11 被引量：40H指数：4
- 供职机构：西南民族大学生命科学与技术学院更多>>
- 发文基金：四川省科技支撑计划中央高校基本科研业务费专项资金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生更多>>
- 藏鸡POU1F1基因的克隆测序及生物信息学分析被引量：1
- 2018年
- 为研究青藏高原特有鸡种,藏鸡的生物学特性,从藏鸡垂体组织的RNA中克隆POU1F1基因,并利用生物信息学对其进行分析.结果显示,藏鸡POU1F1基因开放阅读框(ORF)长为984bp,编码327个氨基酸.编码序列中有13个丝氨酸(Ser)、2个酪氨酸(Tyr)、6个苏氨酸(Thr)磷酸化位点;1个N糖基化位点;二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲构成;藏鸡POU1F1氨基酸序列与红色原鸡POU1F1氨基酸序列的亲缘关系最近.藏鸡POU1F1基因氨基酸序列可能与藏鸡生长速度慢的特性相关.这一研究结果为今后的藏鸡育种工作提供重要的靶点和参考.
- 徐亚欧梅寒徐珑洋王志敏王英明
- 关键词：藏鸡POU1F1基因生物信息学分析
- 5-羟色胺2C受体基因多态性与特发性癫痫关联研究被引量：4
- 2018年
- 目的研究5-羟色胺(5-hydroxytryptamin)2C受体基因多态性与特发性癫痫(epilepsy)的关联性。方法采用PCR-SSCP(polymerase chain reaction-single-strand conformation polymorphism)结合测序方法检测癫痫患者(病例组,n=220)与正常人(对照组n=200)5-HTR2C基因单核苷酸多态性(SNP),并利用统计学方法分析其多态性与特发性癫痫的相关性。结果 5-HTR2C基因在染色体rs113961355、rs114141491,没有发现单核苷酸多态性位点,rs113817908位发生A/C变异,其多态性位点的基因型频率差异显著(P<0.025),且分布不符合Hardy-Weinberg遗传平衡。结论 5-HTR2C基因rs113817908位点SNP多态性与特发性癫痫具有关联性。
- 徐珑洋伍雪英林旭何进宇张林王志敏王英明徐亚欧
- 关键词：特发性癫痫PCR-SSCPSNP
- 藏鸡KLF15基因克隆、组织表达谱及其表达与肌内脂肪含量相关性的研究被引量：4
- 2019年
- 旨在获得藏鸡KLF15基因序列,阐明其组织和时序表达谱,并分析该基因表达与肌内脂肪(IMF)含量的关系。本研究选取1、81、119、154、210日龄健康公母藏鸡各5只为试验动物,利用RT-PCR技术克隆KLF15基因,利用生物信息学软件分析基因生物学特征,利用实时荧光定量PCR(fluorescence quantitative PCR,qPCR)检测KLF15基因在藏鸡不同组织、不同发育阶段的表达谱,并分析其表达水平与肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)含量的相关性。结果显示,克隆得到藏鸡KLF15基因序列长度为1 288bp(GenBank登录号:KY747450),开放阅读框为1 212bp,编码403个氨基酸,是具有3个锌指结构的亲水不稳定碱性蛋白质。藏鸡KLF15基因与原鸡的核苷酸和氨基酸的同源性均为99%。KLF15mRNA在藏鸡各个组织中广泛表达,但在肺组织中表达水平最高,极显著高于其他组织(P<0.01)。KLF15mRNA在1日龄藏鸡胸肌组织中的表达水平高于其他各日龄段,并随着日龄的增长呈下降趋势;在119日龄腿肌组织中的表达水平最高,且整体表达水平的变化都呈先下降后上升再下降的趋势。藏鸡公鸡154日龄前KLF15基因的表达水平与其对应的IMF含量呈正相关,154日龄以后则呈负相关;藏鸡母鸡在各个日龄段则主要表现为微弱的负相关。上述结果为进一步揭示KLF15基因在藏鸡IMF沉积中的作用提供重要数据。
- 王英明徐亚欧王志敏徐珑洋杨磊林亚秋
- 关键词：藏鸡肌内脂肪
- 藏鸡垂体GH基因克隆、时序表达及与屠宰性能的关联研究被引量：1
- 2018年
- 【目的】为研究垂体GH基因对藏鸡屠宰性能的影响。【方法】以藏鸡为研究对象,利用RT-PCR技术克隆藏鸡GH基因,并进行生物信息学分析,利用荧光定量PCR检测GH基因在藏鸡不同发育阶段脑垂体中的表达谱,并与119日龄藏鸡屠宰性能进行关联分析。【结果】藏鸡GH基因长1029 bp,开放阅读框651 bp,编码216个氨基酸。与原鸡比较,核苷酸同源性为99%,存在7个核苷酸突变位点,不存在氨基酸变异;与火鸡比较,核苷酸同源性为94%,存在25个核苷酸突变位点,有7个氨基酸的差异,且在物种间进化上具有较高的保守性。GH基因在藏鸡81、119、154、210 d 4个发育时期的脑垂体中均存在表达,在81 d时表达量最高,极显著高于其他发育时期(P <0. 01),其余3个时期之间无显著差异,且不存在明显的性别差异。相关分析发现,垂体GH基因的表达与119日龄公藏鸡的活体重、屠体重、半净膛、全净膛等性状均呈正相关,其中与屠体重和半净膛的相关性达到了显著水平(P <0. 05),与腿肌重、腿肌率及胸肌率均呈负相关;与119日龄母藏鸡活体重、屠体重、半净膛、全净膛等屠宰性状均呈正相关,与屠宰率、半净膛率、胸肌率及腿肌率均呈负相关。【结论】本研究结果表明垂体GH基因的表达水平可能直接影响藏鸡早期生长发育。
- 王英明梅寒王志敏徐珑洋徐亚欧
- 关键词：屠宰性能
- 乌金猪mtDNA D-Loop区的遗传多样性被引量：5
- 2018年
- 为揭示乌金猪3个地方类群遗传多样性及其分布情况.以乌金猪的3个地方类群凉山猪、大河猪和柯乐猪为对象,研究了线粒体DNA D环高变区(mtDNA D-loop HVI)的序列多态性.研究表明,在全长290bp的核苷酸序列中共检测到46个突变位点,其中简约信息位点为5个,单一多态位点为37个,其中以A/G突变为主.凉山猪的3个类群(昭觉、美姑、西昌)首先聚为一类,然后凉山猪与大河猪聚为一类,最后凉山猪与柯乐猪聚类.3个地区的乌金猪有2个母系起源,大河猪与凉山猪为一个母系起源,柯乐猪为另一个母系起源.就总体而言,乌金猪的各地方类群凉山猪与大河猪遗传亲缘关系最近,其次是柯乐猪,有2个母系起源.
- 王志敏徐亚欧孙艳杨磊徐珑洋王英明黄卫平
- 关键词：乌金猪MTDNAD-LOOP
- 泸宁鸡和白羽肉鸡GHRHR基因克隆及mRNA表达模式的研究被引量：1
- 2018年
- 为研究生长激素释放激素受体(GHRHR)基因在泸宁鸡和罗斯白羽肉鸡各个组织中的表达分布特性,采用RT-PCR技术获取42日龄两个鸡种GHRHR基因序列,并进行序列分析;通过qPCR技术检测GHRHR基因在下丘脑、垂体、心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胸肌以及腿肌9个组织中的表达情况,并构建表达谱进行分析。结果表明:泸宁鸡和罗斯白羽肉鸡的GHRHR基因序列均长为1 279 bp,包括长为1 260 bp的CDs区,编码419个氨基酸;与原鸡和藏鸡具有较近的亲缘性;与原鸡相比,均存在碱基差异,其中泸宁鸡中1处碱基突变致使氨基酸发生改变。GHRHR基因主要在垂体组织中表达,在其他组织中极少表达或基本不表达。同时发现该基因的表达不存在性别差异,但存在物种差异。研究为进一步了解GHRHR基因的功能及物种多样性提供了一定的理论基础。
- 王英明王志敏王志敏李志雄林亚秋
- 关键词：克隆
- 藏鸡、泸宁鸡POU1F1基因外显子2多态性与生长性能的关联研究被引量：1
- 2018年
- 为研究POU1F1基因的多态性对鸡生长发育的影响,试验以藏鸡和泸宁鸡为研究对象,采用PCR-SSCP及测序方法对POU1F1基因的外显子2的多态性进行检测,并与其生长性能进行关联分析。结果表明：在藏鸡和泸宁鸡POU1F1基因外显子2处检测到1个多态位点（C/T）变异,呈现出CC、CT、TT三种基因型,其中C基因为优势基因,CC基因型为优势基因型;两个鸡群在该位点基因杂合度均较低,PIC〈0.25,属低度多态性;经卡方检验,在该位点藏鸡不处于Hardy-Weinberg平衡状态（P〈0.05）;泸宁鸡则处于Hardy-Weinberg平衡状态（P〉0.05）;泸宁鸡6周龄时,CC基因型个体体重显著高于CT型（P〈0.05）,其他周龄之间无显著差异;藏鸡和泸宁鸡均表现出CT基因型的生长态势较纯合子好;泸宁鸡6~7周龄和10~11周龄CT型个体极显著高于CC基因型个体的周增重率（P〈0.01）;9~10周龄CT基因型个体的周增重率显著高于CC型个体（P〈0.05）;藏鸡和泸宁鸡POU1F1基因外显子2多态位点（C/T）中,C基因为优势基因,而CT基因型是控制泸宁鸡早期生长速度的优势基因型。说明POU1F1基因的多态性是鸡早期生长速度的一个潜在分子标记。
- 徐珑洋梅寒王志敏王英明杨磊徐亚欧
- 关键词：藏鸡POU1F1基因PCR-SSCP
- 不同海拔地区藏鸡生理生化指标的研究被引量：20
- 2018年
- 为了探究藏鸡对高海拔生态环境的遗传适应性,通过测定血液生理、生化指标比较高海拔藏鸡与低海拔藏鸡的差别。以西藏(海拔3 800 m)藏鸡、四川省甘孜州康定县姑咱镇(海拔2 700 m)藏鸡(以下称甘孜州藏鸡)、成都彭州美丽田园农业有限公司养殖的藏鸡(是由生长于海拔高度为3 800 m处的西藏藏鸡经过9年的选育而来,以下称低海拔藏鸡)血液生理、生化指标进行检测对比,并对结果进行统计分析。结果表明:西藏藏鸡红细胞数(RBC)、血液中血红蛋白浓度(HGB)及平均红细胞体积(MCV)均高于甘孜州藏鸡,甘孜州藏鸡又高于低海拔藏鸡,该3种指标呈现出随海拔高度升高而升高的趋势。西藏藏鸡平均血红蛋白量(MCH)及红细胞平均血红蛋白浓度(MCHC)低于甘孜州藏鸡,甘孜州藏鸡又低于低海拔藏鸡,该2种指标呈现出随海拔高度升高而降低的趋势。红细胞分布宽度标准差(RDW-SD)呈现出随海拔高度升高而加大的趋势。西藏藏鸡的血液总蛋白、白蛋白、球蛋白、葡萄糖和总胆固醇含量均高于甘孜州藏鸡和低海拔藏鸡,且差异极显著(P<0.01)。甘孜州藏鸡血液中甘油三酯(TG)、总胆固醇(TC)和碱性磷酸酶(ALP)均极显著高于低海拔藏鸡(P<0.01)。同时该研究结果显示,由于海拔高度的变化,生长于3 800 m处的西藏藏鸡在1 000 m海拔的环境条件下经过9年的选育与培育其红细胞数(RBC)、血液中血红蛋白浓度(HGB)、平均红细胞体积(MCV)、红细胞分布宽度标准差(RDW-SD)及平均血红蛋白量(MCH)、红细胞平均血红蛋白浓度(MCHC)等生理指标以及总蛋白(TP)、白蛋白(ALB)、球蛋白(GLO)、葡萄糖(GLU)和总胆固醇(TC)等生化指标均发生了极显著(P<0.01)的变化,说明这些指标与藏鸡在高海拔缺氧条件下的适应性密切相关。
- 王志敏王志敏杨磊徐亚欧杨磊
- 关键词：血液指标适应性海拔藏鸡
- 藏鸡FST基因组织表达谱及时序表达谱的研究被引量：1
- 2019年
- 研究旨在揭示卵泡抑素(FST)基因在藏鸡不同组织及发育阶段中的表达特性。选取1、42、70、120、150日龄藏鸡公母各5只,分别采集垂体、下丘脑、胸肌、腿肌组织样本,利用qRT-PCR技术,对FST基因在所选组织中的表达水平进行测定,构建组织表达谱及时序表达谱并进行分析。结果显示:FST基因主要在藏鸡垂体组织中表达,发育前期公鸡中的表达水平较高,发育后期母鸡中的表达水平高于公鸡;与下丘脑、胸肌以及腿肌时序表达特性不同,FST基因在藏鸡垂体组织中的时序表达特性具有性别差异。研究结果为进一步了解FST基因的功能及物种多样性提供了参考,也为藏鸡的遗传育种提供了一定的理论基础。
- 王英明林亚秋李志雄何世明徐亚欧
- 关键词：藏鸡
- 藏鸡GHRHR-v1基因克隆及组织表达谱研究被引量：3
- 2017年
- 为分析生长激素释放激素受体剪接突变体(GHRHR-v1)基因结构及在各个组织中表达水平在藏鸡生长发育中的特性,以150日龄藏鸡为研究对象,利用RT-PCR技术克隆藏鸡GHRHR-v1基因并进行序列测定,采用q PCR技术检测GHRHR-v1基因在藏鸡不同组织中的表达水平,从而构建该基因的组织表达谱。结果表明:GHRHR-v1基因序列长度为1 279 bp,其中开放阅读框长度为1 260 bp,编码419个氨基酸,藏鸡与鸡GHRHR-v1基因(登录号为DQ230840)核苷酸的同源性为99.76%,预测的氨基酸序列同源性为100%,两者亲缘关系最近。组织表达谱结果表明,GHRHR-v1基因在藏鸡心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胸肌、腿肌、下丘脑和垂体中均有表达,在垂体中表达水平最高,高表达组织为心脏、肝脏、脾脏和肺脏,低表达组织为肾脏、胸肌、腿肌和下丘脑,说明GHRHR-v1基因的表达主要集中于垂体。该结果为进一步研究藏鸡下丘脑-垂体生长轴上相关候选基因对生长发育的调控及藏鸡的选育提供一定的理论依据。
- 王志敏徐亚欧林亚秋杨磊徐珑洋王英明
- 关键词：藏鸡基因克隆组织表达谱
