吴启航
- 作品数：4 被引量：1H指数：1
- 供职机构：武汉轻工大学更多>>
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- Rv1635c基因及其编码蛋白质基本特性及抗原表位的生物信息学分析被引量：1
- 2017年
- 对基因Rv1635c进行生物信息学分析,并对其T、B细胞的抗原表位性进行预测和筛选。用软件ProtParam、SingnalP、TMHMM分别对该基因编码蛋白质的理化性质、信号肽区进行分析预测。以NetMHC、Bimas、NetCTL和SYFPEITHI四个软件来预测分析Rv1635c的T细胞表位。采用IEDB和Bcepred来预测该基因的B细胞表位。分析结果为该基因编码的蛋白质原子总数8573,氨基酸数目556,分子质量60035.23,理论等电点9.84,理论分子式C_(2772)H_(4323)N_(747)O_(717)S_(14),估计半衰期30 h,不稳定指数39;由SignalP分析得到其不含信号肽;根据TMHMM分析可知Rv1635c为跨膜蛋白;T、B细胞表位预测显示该基因至少含有一个潜在的T、B细胞表位,可为未来疾病的预防、诊断和治疗提供理论基础。
- 赵隆麒李海波吴启航王心倩孙妍占卫红余晓丽
- 关键词：生物信息学
- Rv3457c基因及其编码蛋白基本特性及抗原表位的生物信息学分析
- 2016年
- 运用生物信息学对Rv3457c基因编码蛋白的主要特征进行分析,同时预测并筛选其T/B细胞表位。运用Prot Param、Singnal P、TMHMM来分析基因编码蛋白的理化性质、信号肽区、跨膜区;运用Net MHC、Bimas、Net CTL和SYFPEITHI对其T、B细胞进行细胞表位分析预测。得到该基因编码蛋白由1 044个氨基酸组成,原子数为10 498,理论分子式为C2980H4918N1044O1216S340,分子质量为85.7284 KD,等电点的理论值为4.99,半衰期估计值4.4 h,不稳定系数52.31,平均亲水性0.938,脂肪系数20.11;含有潜在T细胞表位和B细胞表位。得出至少含有一个T细胞和一个B细胞表位,可作为疫苗的研制提供基础。
- 赵隆麒王心倩孙妍占卫红吴启航李海波余晓丽
- 关键词：生物信息学
- 结核分枝杆菌Rv2181T、B细胞表位预测及分析被引量：1
- 2017年
- 预测和分析结核分枝杆菌Rv2181抗原的T细胞表位和B淋巴抗原表位的分布状况。首先从NCBI中得到蛋白的氨基酸序列,接着通过BLAST将人类蛋白和得到的序列进行同源性分析,使用SYFPEITHI对MTB中Rv2181蛋白的T淋巴细胞抗原表位,取得分在前2%的多肽作为优势抗原,然后用NETCTL、Net MHC和BIMAS等数据库预测抗原CD8^+T和CD4^+T细胞表位,综合结果筛选出优势肽段。利用Protean预测到的B细胞抗原表位,再根据IEDB、ABCpred、Bcepred等数据库预测,排除α-螺旋、β-折叠内不易形成表位的序列,将位于β-转角、无规则卷曲处的表位确定为优势表位。通过预测、分析,筛选出Rv2181抗原CD4^+T细胞表位中强结合表位120个,弱结合表位495个,综合CD4、8+T的预测,最终筛选出1个优势表位肽段,确定7条优势的B细胞抗原表位区域。预测T、B细胞候选表位为结核病诊断和治疗有重要价值。
- 占卫红吴启航赵隆麒王心倩孙妍余晓丽
- 关键词：结核分枝杆菌T细胞B细胞表位分析
- 北京基因型结核杆菌脂聚糖对T淋巴细胞分化的调节作用研究
- 目的:本研究以北京基因型结核分枝杆菌临床株的脂阿拉伯甘露聚糖（BJLAM）为研究对象,通过BJ-LAM与人外周血单个核细胞体外共培养,然后检测上清液中的细胞因子。探讨BJ-LAM对T淋巴细胞分化的调控作用,也为BJ-LA...
- 吴启航
- 关键词：结核分枝杆菌北京基因型脂阿拉伯甘露聚糖外周血单个核细胞
- 文献传递
