李晓峰
- 作品数：2 被引量：4H指数：1
- 供职机构：病原微生物生物安全国家重点实验室更多>>
- 发文基金：北京市自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 宿主microRNA靶向介导的减毒活疫苗研究进展被引量：1
- 2014年
- 疫苗是预防病毒性传染病的最有效手段,包括减毒活疫苗、灭活疫苗、核酸疫苗和基因工程疫苗等。减毒活疫苗模拟了病毒的感染过程,能有效诱导机体产生体液和细胞免疫应答,在临床上得到广泛应用。传统的减毒活疫苗一般通过连续传代获得,研发成本高。微小RNA(microRNA,miRNA)靶向调节是新近发现的宿主调控基因表达的重要手段,具有明确的组织特异性和种属特异性。通过反向遗传学技术能够将特异的宿主miRNA靶向序列有效整合入病毒基因组,从而实现对病毒生物学特征的有效调节,在减毒活疫苗设计与研发领域有着良好的应用前景。该文综述了miRNA靶向介导的减毒策略及其在疫苗设计中的研究进展。
- 刘龙李晓峰马洁秦成峰
- 关键词：减毒活疫苗MICRORNA靶序列基因沉默
- 恩替卡韦耐药乙型肝炎病毒稳定复制细胞系的转录组学分析被引量：3
- 2021年
- 目的分析恩替卡韦耐药乙型肝炎病毒(ETV-r HBV)稳定转染前后宿主细胞转录组水平的基因差异表达,为后续开展HBV感染相关机制研究提供基础数据和参考。方法对ETV-r HBV稳定转染细胞株(HepG2.A64)及其原始背景细胞株(HepG2)进行转录组测序(n=3),利用DESeq2软件以|log2 Fold Change|>2、padj<0.05为差异基因筛选条件对测序结果进行差异基因筛选;利用clusterProfiler软件对差异基因进行GO功能富集分析和KEGG功能富集分析。采用RT-qPCR及Western blotting分别检测HBV稳定转染前后宿主细胞DNA修复相关基因mRNA及蛋白的表达水平。结果转录组测序结果显示,与HepG2细胞系相比,ETV-r HBV稳定转染的HepG2.A64细胞系共有613个基因存在差异表达,其中401个上调,212个下调(padj<0.05),GO和KEGG富集分析结果显示,差异表达基因主要参与炎症反应、PI3K/Akt信号通路、PPAR信号通路、NF-κB信号通路以及免疫相关的生物学过程。RT-qPCR及Western blotting检测结果显示,与HepG2细胞系相比,HepG2.A64细胞系中RAD52和XRCC2 mRNA表达量分别下降68.96%±7.59%、69.58%±6.32%,RAD52和XRCC2蛋白表达量分别下降69.93%±3.88%、26.47%±12.7%,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论与原始细胞系HepG2相比,ETV-r HBV稳定转染的HepG2.A64细胞系在转录水平出现大量差异表达基因,同时HepG2.A64细胞系中DNA修复相关基因表达量出现下调。
- 张孝璐杨兰孙岩松徐东平李晓峰刘妍李浩
- 关键词：乙型肝炎病毒DNA修复计算生物学转录组测序
