郑杰
- 作品数:6 被引量:4H指数:2
- 供职机构:广西大学农学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金广西研究生教育创新计划广西壮族自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 红麻线粒体基因NAD3和COB的RNA编辑与表达分析被引量:2
- 2016年
- 以红麻细胞质线粒体近等基因系UG93A(不育系)、UG93B(保持系)及UG93A×福红992(恢复系)的F1代为材料,研究花药线粒体基因NAD3和COB的转录与表达。结果发现,在3种供试材料中,基因NAD3的CDS区在DNA水平和RNA编辑水平上均无差异;不育系与保持系的COB基因DNA编码序列无差异,但在RNA水平上发生了编辑,8个位点的编辑均发生于密码子的第一或第二位碱基,且导致氨基酸种类变化,主要为亲水性氨基酸转变为疏水性氨基酸;COB基因在UG93A中的RNA编辑频率低于UG93B;NAD3和COB基因在3种材料中的转录本大小基本相同,但在表达水平上表现为不育系显著低于保持系和F1代。由此推测NAD3和COB基因在红麻花药发育过程中有着重要的作用。
- 刁勇廖小芳郑杰孔祥军陈鹏赵艳红周瑞阳
- 关键词:红麻RNA编辑COB
- 基于红麻HcPDIL5-2a基因诱导的棉花雄性不育种质创新研究进展
- 2019年
- 本项目是在前期采用花粉管通道法转红麻HcPDIL5-2a基因,创造出海岛棉雄性不育种质H276S的基础上进行的。在国家自然科学基金项目资助下,取得了如下重要进展:克隆了陆地棉GhPDIL5-2a、GhMS5及GhZIP1基因,并采用花粉管通道法成功创造出了陆地棉、水稻和红麻CMS种质资源;明确了H276S为无花粉型细胞质雄性不育种质,育性稳定,具有极高的杂种优势利用价值;开发出了雄性不育细胞质的分子标签,为雄性不育种质资源的鉴定和筛选提供了简便有效的方法:分子基尿研究表明,cox3可能是雄性不育关键基因,为阐明H276S雄性不育的分子机理奠定了基础。
- 刘冬梅孔祥军陈平李敏金刚郑杰李斌周瑞阳
- 关键词:棉花红麻雄性不育
- 棉花细胞质雄性不育系‘07-113A’与其保持系线粒体差异基因发掘与表达分析
- 2019年
- 为发掘棉花细胞质雄性不育相关基因,采用RFLP分子标记、Northern blot、同源克隆及RT-qPCR的方法,对离核木棉细胞质雄性不育系‘07-113A’及其保持系‘07-113B’进行线粒体差异基因发掘和表达分析。结果表明:1)以12个线粒体基因为探针,结合EcoRⅠ和HindⅢ2种限制性内切酶对不育系和保持系进行RFLP分析,发现atpA/EcoRⅠ及ccmB/EcoRⅠ2个基因/酶组合存在RFLP多态性;2)以atpA和ccmB为探针,对‘07-113A’和‘07-113B’进行Northern blot分析,检测到atpA、ccmB在不育系和保持系中转录本大小均相同;3)获得atpA的CDS全长及其部分侧翼序列,比对结果表明,不育系和保持系的atpA编码序列相同;与保持系相比,不育系5′端侧翼序列有2个碱基的变异,3′端侧翼序列有4个碱基的变异;4)RT-qPCR分析发现,不育系中atpA在败育后的表达量是保持系的0.44倍,极显著低于保持系。推测‘07-113A’花粉败育可能与atpA的异常表达相关。
- 李斌郑杰郑杰李敏孔祥军周步进李敏周瑞阳
- 关键词:棉花细胞质雄性不育RFLPATPA
- 牛角瓜大孢子与小孢子的发生发育观察
- 2016年
- 【目的】明确牛角瓜[Calotropis gigantea(Linn.)W.T.Aition]大孢子与小孢子的发生发育情况,为其耕作栽培学及植物学研究提供基础资料,也为其遗传育种研究及品种改良打下基础。【方法】于盛花期采集不同发育时期的牛角瓜花蕾,运用石蜡切片技术观察其大孢子与小孢子的发生发育特征。【结果】牛角瓜大孢子与小孢子的发育时期与其花器官外部形态特征存在对应关系,雄蕊的发生发育早于雌蕊。牛角瓜小孢子黏连成块状结构,与普通植物的分散型小孢子形成鲜明对比,其小孢子母细胞发育为连续型,绒毡层细胞有3~4层,为腺质绒毡层,单核期绒毡层细胞壁开始降解,花粉成熟后绒毡层细胞自溶。胚囊发育类型为蓼型,胚珠横生,无珠被;四分体呈线型排列,成熟胚囊有次生核。【结论】牛角瓜大、小孢子发生及雌、雄配子体发育与花器官外部形态大小密切相关,其结实率低并非雌性或雄性败育所致。
- 宾珍兰汤丹峰郑杰刘一丁陈励虹周瑞阳
- 关键词:大孢子小孢子
- 海岛棉H268 PPR蛋白家族基因鉴定及SNP/InDel分析被引量:2
- 2020年
- 【目的】通过对海岛棉不育系H276A及其育性恢复材料H268进行三角状五肽重复蛋白(PPR)家族基因鉴定及比对分析,获得序列存在差异的PPR基因,为后续育性恢复基因(Rf)的发掘提供理论基础。【方法】通过生物信息学分析海岛棉PPR基因,并对其进行亚细胞定位预测与功能注释分析;采用Illumina HiSeq 4000高通量测序技术对海岛棉H276A及H268对PPR蛋白家族基因进行转录组测序,将筛选获得的PPR蛋白与其他植物具有育性恢复的PPR蛋白进行氨基酸序列同源比对并构建系统发育进化树。【结果】鉴定获得912个PPR基因,其中有846个在海岛棉H276A和H268间存在序列差异,且分别存在7226个SNP差异位点和301个InDel差异位点,其中作用于线粒体的PPR基因有2143个SNP差异位点和134个InDel差异位点。转录组测序结果显示,共检测到表达基因数量为68197个,其中已知基因56311个、新基因11886个,可满足后续数据分析。GO功能注释结果显示,PPR基因主要富集于生物学过程,富集于分子功能的PPR基因最少。50.0%PPR蛋白定位于线粒体,29.0%PPR蛋白定位于叶绿体,0.9%PPR蛋白定位于细胞核,20.0%PPR蛋白定位于胞外,0.1%PPR蛋白定位于细胞质膜。xp_016708712(LOC107923023)和xp_016710013(LOC107924193)与多个具有育性恢复功能的PPR蛋白氨基酸序列相似性达33%,说明二者亲缘关系较近,且亚细胞定位于线粒体。【结论】xp_016708712和xp_016710013 2个PPR蛋白可能与海岛棉不育系H276A育性恢复相关,可用于发掘海岛棉CMS的Rf基因。
- 李枝玲孔祥军郑杰韦美玲李斌周瑞阳
- 关键词:海岛棉转录组测序SNPINDEL
- 红麻线粒体基因atp6过表达载体的构建与转化
- 2019年
- 【目的】构建红麻线粒体基因atp6过表达载体遗传转化体系,为红麻线粒体基因的遗传转化及功能研究打下基础。【方法】以红麻UG93A花药cDNA为模板,通过同源克隆技术克隆atp6基因编码区(CDS)的全长序列;利用In-Fusion基因融合技术构建植物过表达载体,通过农杆菌介导法转化野生型烟草,并对转基因阳性烟草植株进行抗性筛选和PCR验证。【结果】红麻UG93A的atp6基因CDS全长为1182 bp,成功构建红麻atp6基因全长过表达载体pBI121-atp6-EGFP,并获得4株转基因烟草植株(B1、B2、B3和B4),使用过表达载体上3对不同位点的引物组合对转基因植株进行PCR验证,发现有2株转基因烟草植株在3对不同引物中稳定表达,即获得2株含pBI121-atp6-EGFP的T0代转基因阳性植株(B1和B2)。【结论】构建的红麻线粒体基因atp6过表达载体遗传转化体系,可用于指导后续atp6基因调控红麻细胞质雄性不育(CMS)分子机理研究。
- 韦美玲廖小芳李枝玲周步进郑杰孔祥军刘一丁李宏伟周瑞阳
- 关键词:红麻