赵晓辉
- 作品数：4 被引量：7H指数：1
- 供职机构：中国科学院沈阳应用生态研究所更多>>
- 发文基金：辽宁省自然科学基金国家自然科学基金国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 一种改进的亚硫酸盐测序方法
- 本发明涉及生物DNA甲基化技术，具体地说是一种改进的亚硫酸盐测序方法。将基因组DNA经酶切纯化，纯化后加入亚硫酸盐修饰液进行解链与修饰；修饰后纯化回收测序，即实现基因组DNA的测序；所述亚硫酸盐修饰液为500-550ul...
- 马珊珊赵晓辉孙晓霞刘宛孙梨宗李照令巩宗强贾春云
- 文献传递
- 改进亚硫酸盐测序技术研究拟南芥DNA甲基化水平被引量：1
- 2013年
- DNA胞嘧啶甲基化是一种重要的表观遗传修饰形式,在细胞增殖、分化、发育、基因组印迹、基因表达调控等过程中起着重要作用。随着对DNA甲基化研究的深入,各种DNA甲基化检测方法被开发出来满足不同类型的研究需求。通过实验建立的一种改进亚硫酸盐测序技术,将拟南芥基因组DNA经酶切纯化后,用亚硫酸盐修饰液修饰,将PCR产物克隆到pEASY-T1载体上,每个样品随机挑取15个阳性克隆,测序分析,研究拟南芥错配修复基因MutL-homologue 1(MLH1)启动子区域的甲基化水平。结果表明:与传统亚硫酸盐测序法相比,改进方法有利于DNA完全修饰,既减少了修饰时间,又提高了PCR目的片段的特异性、稳定性和重复性;MLH1基因启动子区域甲基化比率为27.3%,而不是45.6%,避免了非甲基化位点的错认。为植物DNA甲基化分析提供了一种更为理想的研究手段。
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- 关键词：DNA甲基化MLH1
- 一种改进的亚硫酸盐测序方法
- 本发明涉及生物DNA甲基化技术，具体地说是一种改进的亚硫酸盐测序方法。将基因组DNA经酶切纯化，纯化后加入亚硫酸盐修饰液进行解链与修饰；修饰后纯化回收测序，即实现基因组DNA的测序；所述亚硫酸盐修饰液为500-550ul...
- 马珊珊赵晓辉孙晓霞刘宛孙梨宗李照令巩宗强贾春云
- 文献传递
- 镉、铜胁迫下拟南芥基因组DNA甲基化的MSAP分析被引量：6
- 2013年
- [目的]研究不同浓度Cd、Cu胁迫下拟南芥幼苗基因组DNA的甲基化水平和状态变化。[方法]以0、0.5和5.0 mg/L Cd2+、0.5和5.0 mg/L Cu2+处理21 d的拟南芥为材料,提取基因组DNA,进行甲基化敏感扩增多态性(methylation sensitive amplification polymor-phism,MSAP)分析。[结果]0、0.5 mg/L Cd2+、5.0 mg/L Cd2+、0.5 mg/L Cu2+和5.0 mg/L Cu2+处理组DNA的MSAP比率分别为30.2%、34.7%、41.0%、33.9%、39.2%。0.5 mg/L Cd2+、5.0 mg/L Cd2+、0.5 mg/L Cu2+、5.0 mg/L Cu2+处理组的DNA甲基化多态性比例分别为2.6%、13.2%、2.4%、11.2%。[结论]Cd、Cu胁迫下拟南芥基因组DNA甲基化水平的增加及DNA甲基化多态性的提高与Cd、Cu处理浓度呈显著正相关,且Cd对DNA甲基化水平和多态性改变的作用大于Cu。
- 赵晓辉徐正进刘宛王鹤潼李照令马珊珊孙晓霞
- 关键词：拟南芥DNA甲基化镉胁迫铜胁迫MSAP
