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石磊: 作品数：248 被引量：851H指数：15; 供职机构：暨南大学更多>>; 发文基金：国家自然科学基金广东省自然科学基金广州市科技计划项目更多>>; 相关领域：医药卫生轻工技术与工程农业科学生物学更多>>

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副猪嗜血杆菌微滴数字PCR定量检测方法的建立被引量：6: 2018年; 根据副猪嗜血杆菌(Haemophilus parasuis,HPS)OMP P2基因的保守序列设计特异性引物和Taq Man探针,通过反应条件优化和特异性、敏感性、重复性试验以及临床样品的检测,建立可对其准确定量的微滴数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)检测方法,并与实时荧光定量PCR(Quantitative real-time PCR,qPCR)检测方法进行比较分析。结果表明,该方法与猪传染性胸膜肺炎放线杆菌、猪链球菌、枯草芽孢杆菌、大肠杆菌、沙门氏菌、金黄色葡萄球菌以及猪圆环病毒2型、猪瘟病毒无交叉反应;其灵敏性优于qPCR,线性相关系数(R2)为0.996,呈良好线性关系,最低可检测到2.647 copies/μL的阳性质粒,变异系数为3.29%。临床样品定量检测结果表明,ddPCR具有敏感性高、特异性好等优点,其检出率稍高于qPCR。本研究建立的ddPCR能够准确定量检测HPS,将为HPS相关研究提供有益参考。; 石磊温雯李丽丽; 关键词：副猪嗜血杆菌

不同地区铜绿假单胞菌第一类整合子和整合子相关基因盒的分布被引量：18: 2006年; 目的对石家庄、昆明两地分离的铜绿假单胞菌临床菌株进行第一类整合子的分布及整合子相关基因盒携带率的比较分析,探讨第一类整合子在两地菌株分布的差别。方法采用PCR方法筛选检测64株石家庄、昆明两地临床分离的铜绿假单胞菌第一类整合子和及其所携带的整合子相关基因盒。结果64株铜绿假单胞菌临床菌中共有43株为第一类整合子阳性菌(阳性率67.2%);其中石家庄菌株和昆明菌株阳性率分别为71.4%和64.3%,两地铜绿假单胞菌第一类整合子阳性率无显著性差异。第一类整合子阳性铜绿假单胞菌中,石家庄菌株和昆明菌株携带一类整合子相关基因盒的阳性率分别为80.0%和38.%,两地第一类整合子阳性菌中整合子相关基因盒的携带率具有显著性差异(P<0.01);两地菌株携带的基因盒大小不同。结论第一类整合子在铜绿假单胞菌临床菌株中广泛分布,环境的选择压力影响细菌整合子相关基因盒的分布。; 杨维青石磊尹晓琳李心晖谢轶程曦曾蔚殷长甫贾文祥; 关键词：铜绿假单胞菌

阪崎肠杆菌核酸提取纯化方法分析比较: 2010年; 阪崎肠杆菌是一种食源性致病菌,目前越来越多的分子检测技术用于该菌的检测,以取代传统的检测技术。针对分子检测技术相应的核酸标准物质的研制势在必行。核酸的提取和纯化是核酸标准物质的研制过程中的重要环节之一,快速高效高质量,低毒低成本已成为核酸提取的重要目标。就现有方法进行分析比较,重点对常用的三种提取微生物基因组DNA的试剂盒进行了全方位比较,获得了阪崎肠杆菌较优的基因组DNA提取方法,并对提取的DNA进行PCR特异性扩增检测,获得较清晰的谱带。为阪崎肠杆菌核酸标准物质的研制奠定了基础。; 刘张岚王晶石磊黄晓蓉张玲; 关键词：阪崎肠杆菌标准物质

多重耐药临床菌株中整合子结构的检测与分析被引量：28: 2007年; 目的研究广州暨南大学附属第一医院2004年部分临床菌株样本的整合子及其基因盒的分布特性。方法多重PCR检测与细菌耐药关系密切的1、2、3类整合酶基因,进一步对阳性样本可变区的基因盒序列鉴定分析。结果随机抽取109株临床菌株,整合酶阳性检出率为97.2%(106/109),其中1类整合酶阳性菌100株(91.7%),2类整合酶阳性菌1株(0.92%),此外有5株(4.6%)同时检出1、2类整合酶,没有检测到3类整合酶;基因盒鉴定结果显示,插入基因盒以dfrA(甲氧苄氨嘧啶耐药相关)和aadA(氨基糖苷类耐药相关)基因家族为主,也在少数菌株中发现了aacA4、cmlA1、catB3以及sat1基因盒。其中又以dfrA12、orfF和aadA2组合最为常见,耐药基因盒PCR扩增片段为1913bp(64.6%);此外,还发现了同时存在两种整合子结构的菌株。结论整合子普遍存在于临床菌株中,可通过基因水平转移在不同菌属间传播,提示各医药单位必须加强耐药监测及合理选择抗菌药物,以减少多重耐药细菌的发生和发展。; 石磊陈洵肖增璜; 关键词：整合子整合酶细菌耐药临床分离株

分离自生肉的单增李斯特菌的血清型及脉冲场凝胶电泳分型研究: 本研究对所分离到的单核细胞增生李斯特菌进行血清分型试验和用脉冲场凝胶电泳方法进行遗传多样性分析。53株单核细胞增生李斯特菌分属5个血清型，以1/2a，1/2b和1/2c血清型为主，分别占54.72[％]、20.75[％]...; 张耀祺石磊; 关键词：单核细胞增生李斯特菌血清分型脉冲场凝胶电泳; 文献传递

1993—2000年霍乱弧菌耐药整合子的分布状况被引量：2: 2007年; 目的检测Ⅰ类、Ⅱ类和Ⅳ类整合子及Ⅰ类整合子携带的耐药基因盒在霍乱弧菌临床菌株中的分布,分析整合子对细菌耐药性的影响。方法纸片扩散法行药物敏感试验,PCR法检测50株临床菌株Ⅰ类、Ⅱ类和Ⅳ类整合酶基因(intⅠ)阳性菌株,并对intⅠ1阳性菌株整合的耐药基因行序列分析。结果全部菌株至少对一种抗生素耐药。3株Ⅰ类整合酶基因阳性菌株的耐药基因盒PCR扩增得到1009 bp的产物。序列分析表明,1009 bp序列与已知的aadA 1c 100%同源,为对壮观霉素、链霉素产生耐药的基因盒;未检测到Ⅱ类整合子阳性菌株;50株临床菌株均含有第Ⅳ类整合酶基因,2株菌株第Ⅳ整合酶基因扩增得到2200bp产物,序列分析表明,在第Ⅳ类整合酶基因序列中含有一个插入片段IS1359转座酶基因。结论第1类整合子存在于孟加拉国的临床致病弧菌中,第Ⅳ类整合子在霍乱弧菌临床菌株中分布广泛,整合子在细菌耐药中发挥作用。; 闫鹤石磊曹以诚杨连生; 关键词：弧菌霍乱整合子类药物耐受性

裂褶菌产纤维素酶条件的研究被引量：2: 2012年; 对一株裂褶菌(Schizorhyllum commune ATCC38548)进行液态发酵生产纤维素酶。通过单因素试验考察发酵时间、碳源、碳源质量浓度和接种量等因素对菌株产酶的影响,用二硝基水杨酸法(DNS法)对羧甲基纤维素酶(CMC)、滤纸酶(FPA)和微晶纤维素酶(AVI)进行酶活测定。结果表明:3种酶的分泌高峰不一致,但在第6天时纤维素酶总酶活达到最高。滤纸是诱导裂褶菌产纤维素酶的良好碳源,且质量浓度为20g/L时产酶效果最佳;接种量为5mL时,总酶活相对最高。不同的培养条件对裂褶菌产CMC、FPA和AVI的影响各异。; 曾亚岚张燕兴许桂红石磊; 关键词：裂褶菌纤维素酶羧甲基纤维素酶

聚合酶链反应-变性梯度凝胶电泳技术在口腔微生物多样性研究中的应用被引量：1: 2011年; 目的应用聚合酶链反应(PCR)-变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术,分析健康人的口腔菌群及其菌种组成的多样性。方法抽取8名健康人唾液样本,分别提取唾液细菌总DNA,PCR扩增16SrDNA并进行DGGE和系统发育树分析。结果 8名健康人唾液样本的DGGE指纹图谱条带差异性较大,仅有65%相似性,表明采用PCR-DGGE对口腔微生物多样性的检测是可行的。结论 PCR-DGGE技术可较灵敏、直观地反映口腔微生物多样性情况。; 沈会平苏健裕彭帅朱啸石磊; 关键词：微生物多样性口腔微生态变性梯度凝胶电泳

基于数字PCR技术检测猪流行性腹泻病毒的引物和探针及其试剂盒与方法: 本发明公开了一种基于数字PCR技术检测猪流行性腹泻病毒的引物和探针及其试剂盒与方法。引物和探针，包括上游引物FP、下游引物BP、探针Probe；检测试剂盒包括引物组、2×RT‑ddPCR Supermix、无RNA酶的蒸...; 叶蕾曹炜伟陈洵常彦磊李丽丽石磊; 文献传递

5株万古霉素敏感性减低耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的graS基因及细胞超微结构分析: 2017年; 目的分析在防耐药变异浓度(mutant prevention concentration,MPC)测定过程中筛选出的对万古霉素敏感性减低的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)在graS基因及细胞超微结构上的变化。方法利用Sau-PCR、脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)对筛选菌株进行分析。扩增graS基因,并利用变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)技术检测在该基因上是否存在突变。通过电子显微镜技术观察细胞壁结构改变。结果万古霉素敏感性减低菌株经Sau-PCR和PFGE分型检测,证实部分筛选菌株电泳条带与原始菌株存在有差异,且电镜结果也显示筛选菌株细胞壁有所增厚。DGGE检测未发现在graS基因上存在突变点。结论试验中的菌株万古霉素敏感性的减低可能不是由graS基因突变造成的,可能存在其他基因位点的突变,或可能存在另外的耐药机制。; 李静刘晓雷强翠欣石磊赵建宏; 关键词：抗菌药

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