宋琴琴
- 作品数：4 被引量：12H指数：2
- 供职机构：唐山工人医院更多>>
- 发文基金：河北省杰出青年科学基金国家自然科学基金高等学校全国优秀博士学位论文作者专项资金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 环氧化酶2基因Gly587Arg多态与原发性肝癌发病风险的相关性
- 2014年
- 目的 探讨中国汉族人群环氧化酶2 （COX-2）基因Gly587Arg多态与原发性肝癌发病风险的关系.方法 选取原发性肝癌患者270例及健康对照者540名,提取外周血淋巴细胞DNA,利用PCR-限制性片段长度多态性方法进行基因分型,以多变量Logistic回归分析比值比（OR）及其95％ CI.结果 在肝癌组及对照组只发现587Gly/Gly和Gly/Arg两种基因型,未发现587Arg/Arg基因型.肝癌组587Gly/Gly和Gly/Arg的基因型频率分别为91.5％ （247/270）、8.5％ （23/270）,对照组分别为96.5％（521/540）、3.5％ （19/540）,多变量Logistic回归分析显示,587Gly/Arg基因型携带者原发性肝癌发病风险是587Gly/Gly基因型携带者的2.56倍,其95％ CI为1.37 ～4.79（P =0.003）.结论 中国汉族人群中COX-2基因Gly587Arg多态与原发性肝癌的发病风险相关.
- 王光霞付占昭邵莎莎宋琴琴饶娟刘英文张志
- 关键词：原发性肝癌环氧化酶2单核苷酸多态基因分型
- 基于生物信息学分析CD59在胰腺癌中的表达及预后影响
- 2023年
- 目的 通过生物信息学方法分析CD59在胰腺癌中的表达及预后意义。方法 利用基因表达谱交互分析2(gene expression profiling interactive analysis 2,GEPIA2)和人类蛋白组图谱(human protein atlas,HPA)数据库比较CD59在胰腺癌组织与癌旁组织中的表达差异;利用卡普兰麦尔(Kaplan-Meier plotter)数据库评价CD59表达水平对患者预后的影响;利用String和Cytoscape3.9.1软件分析CD59蛋白互作网络;利用DAVID6.8对CD59及关键的互作基因进行基因富集和通路富集分析。结果 与正常组织相比,CD59在胰腺癌组织中的表达显著上调(P<0.05),CD59高表达患者的总体生存时间(HR=2.3,95%CI:1.52~3.50)和无复发生存时间(HR=4.31,95%CI:1.57~11.83)较CD59低表达患者短。蛋白互作网络分析揭示CD59与CD55、GOLGA2、LMAN1、TMED2和SERPINA1等多个分子关系密切。基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析表明CD59主要参与补体激活、先天免疫反应和冠状病毒-COVID-19等通路。结论 CD59在胰腺癌组织中高表达,受免疫相关基因的影响,且与患者预后较差相关,可作为胰腺癌早期诊断及预测预后的标志物之一。
- 刘佳伟刘春玲仵红娇宋琴琴刘冲董静吕澜张雪梅张志
- 关键词：CD59胰腺癌基因表达预后生物标志物
- 环氧化酶2遗传变异与吸烟交互作用影响肺癌易感性被引量：9
- 2013年
- 目的探讨环氧化酶2（COX2）启动子区-1195G〉A遗传变异与肺癌遗传易感性的关系以及与吸烟的交互作用。方法以2000年1月至2008年12月在中国医学科学院肿瘤医院就诊的956例肺癌患者作为病例组；健康对照来自同期北京市健康体检个体，以无肿瘤病史和体征者作为对照组，共994名。研究对象均为汉族，无年龄、性别限制。对照组与病例组相匹配。经知情同意，每名研究对象均采集2ml外周血，以PCR-限制性片断长度多态性方法对研究对象进行基因分型，并且调查了对象的吸烟情况。以logistic回归法计算COX2-1195G〉A变异各基因型影响肺癌发病风险的OR值及95％CI。结果对照组、病例组基因分型为COX2—1195AA者分别占24．9％（247／994）、28．3％（271／956）。与-1195GG基因型携带者相比，-1195AA基因型携带者肺癌的发病风险增加1．36倍（95％CI：1．03～1．79）。以吸烟进行分层分析，在吸烟人群中，携带COX2—1195AA基因型者，肺癌的发病风险明显增高，其OR（95％C1）为1．56（1．08～2．25）；在非吸烟组，未发现肺癌发病风险在不同基因型之间的差异（OR=1．17；95％C1：0．77～1．61）。在重度吸烟者（〉20包／年）中，-1195AA和-1195AG基因型携带者发生肺癌风险分别是-1195GG携带者的1．85倍（95％C1：1．16～2．95）和1．62倍（95％CI：1．08—2．43）；在轻度吸烟者（≤20包／年）中，-1195AG和AA基因型携带者发生肺癌风险的OR（95％CI）分别为0．78（0．47～1．30）和1．08（0．60～1．94）。结论COX2启动子区遗传变异对肺癌发病风险的相关性和环境因素密切相关。
- 张志刘睿杨照环王光霞邵莎莎宋琴琴张雪梅
- 关键词：环氧化酶2肺肿瘤
- 肿瘤坏死因子-β遗传变异与非小细胞肺癌发病风险遗传易感性的关系被引量：3
- 2015年
- 目的探讨肿瘤坏死因子-β（TNF—β）252A／G遗传变异与非小细胞肺癌（NSCLC）遗传易感性的关系。方法以2000年1月至2008年12月在中国医学科学院肿瘤医院就诊的956例NSCLC病例作为病例组；以来自同期北京市健康体检个体，无肿瘤病史和体征者作为对照组，共994名。研究对象均为汉族，对照组与病例组相匹配。经知情同意，每名研究对象均采集3ml外周血，以PCR．限制性片段长度多态性方法对研究对象进行基因分型，并且调查了对象的吸烟情况。以logistic回归法计算TNF—β252A／G变异各基因型影响NSCLC发病风险的0R及95％CI值。结果在对照组中，TNF-β252AA、AG和GG基因型分别占30．9％（307／994）、47．4％（471／994）和21．7％（216／994）；在病例组中，分别占35．7％（341／956）、48．1％（460／956）和16．2％（155／956）。logistic回归分析结果显示，与TNF-β252AA基因型携带者相比，GG基因型携带者具有较低的NSCLC发病风险，其OR（95％CI）值为0．64（0．49～0．83）。以携带AA基因型的非吸烟者作为参照，携带AA基因型的吸烟者发生NSCLC风险的OR（95％CI）值为2．88（1．91—2．24），高于GG基因型吸烟者发生NSCLC的风险（OR=1．54；95％CI：1．00—2．39）。进一步以累计吸烟量分层，携带AA基因型的重度吸烟者（〉20包／年）发生NSCLC的OR（95％CI）值为4．62（2．88—7．41），高于携带GG基因型的重度吸烟者（OR=2．24，95％CI：1．33～3．74）。结论TNF-β遗传变异对NSCLC发病风险有影响并与吸烟情况相关。
- 刘睿宋琴琴张志杨照环刘英文张雪梅
- 关键词：肿瘤坏死因子类多态性单核苷酸
