杨金伟
- 作品数：2 被引量：3H指数：1
- 供职机构：国防科学技术大学计算机学院更多>>
- 发文基金：湖南省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学化学工程自动化与计算机技术更多>>
- 含伪结的RNA二级结构预测算法的研究
- RNA二级结构预测是近年来RNA研究的热点问题,研究者提出了多种预测算法,并取得了丰富的成果。但对于含伪结的二级结构,现有算法无法得到很好的预测结果:要么无法预测,要么算法复杂度过高、预测精度比较低。本文针对这一问题,分...
- 杨金伟
- 关键词：RNA二级结构预测
- 基于堆积协变信息与最小自由能预测含伪结的RNA二级结构被引量：3
- 2008年
- RNA伪结预测是RNA研究的一个难点问题。文中提出一种基于堆积协变信息与最小自由能的RNA伪结预测方法。该方法使用已知结构的RNA比对序列(ClustalW比对和结构比对)测试此方法,侧重考虑相邻碱基对之间相互作用形成的堆积协变信息,并结合最小自由能方法对碱基配对综合评分,通过逐步迭代求得含伪结的RNA二级结构。结果表明,此方法能正确预测伪结,其平均敏感性和特异性优于参考算法,并且结构比对的预测性能比ClustalW比对的预测性能更加稳定。文中同时讨论了不同协变信息权重因子对预测性能的影响,发现权重因子比值在λ1:λ2=5:1时,预测性能达到最优。
- 杨金伟骆志刚方小永王金华唐可成
- 关键词：RNA二级结构
