孙成飞 作品数:68 被引量:226 H指数:9 供职机构: 中国水产科学研究院珠江水产研究所 更多>> 发文基金: 国家现代农业产业技术体系建设项目 国家自然科学基金 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 经济管理 自动化与计算机技术 更多>>
大口黑鲈3个养殖群体的遗传多样性分析 被引量:14 2019年 该研究通过毛细管电泳法筛选微卫星引物,从GenBank的51对微卫星引物中共筛选出12对具有特异性和多态性的引物,并合成荧光标记引物,对广东大口黑鲈(Micropterus salmoides)主养区3个养殖群体进行STR分型,以分析其遗传多样性。结果显示所检测的12个微卫星位点中,3个位点呈现高多态性,4个具有中度多态性,其余5个位点为低多态性。3个群体的遗传多样性水平偏低,期望杂合度(He)分别为0.312 5、0.360 6和0.328 4。群体间遗传分化指数及AMOVA分析显示,群体间遗传分化属于低水平,遗传变异有85.83%是由群体内不同个体间的差异造成的。群体间遗传距离分析显示,3个养殖群体间的遗传距离和遗传相似度比较接近。遗传结构分析表明3个养殖群体来自于同一个亚群。研究结果提示现阶段中国大口黑鲈养殖群体的遗传多样性已显著下降,因此在选育种过程应高度重视提高与维持种群遗传多样性的问题。 孙成飞 谢汶峰 胡婕 董浚键 田园园 吴灶和 叶星关键词:大口黑鲈 微卫星 毛细管电泳 一种ENU诱导草鱼基因组DNA中基因突变的化学方法 本发明涉及一种ENU在草鱼基因组DNA中诱发基因突变的化学方法,所述的ENU作为诱导剂诱变草鱼胚胎处理浓度为0.1~0.5mM;精子诱导处理浓度为0.5~10mM本发明还提供了ENU工作液在诱导草鱼基因DNA突变中的应用... 邹曙明 蒋霞云 孙成飞 林思彤文献传递 尼罗罗非鱼γ-干扰素基因的克隆、结构分析及组织表达 被引量:6 2017年 γ-干扰素(interferon,IFN)是调控天然免疫与细胞免疫的一种重要细胞因子,在抵抗病毒入侵和细菌感染中发挥重要作用。该研究从尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)脾脏组织中扩增到γ-干扰素基因的c DNA,大小为621 bp,编码206个氨基酸。生物信息学分析表明,尼罗罗非鱼γ-干扰素分子(On IFNγ)具有信号肽、IFN特征序列及核定位信号。预测的三级结构与人类IFNγ晶体结构最相似。q PCR检测显示,IFNγ在正常鱼体内的脾脏中表达量最高,其次是肠、鳃和肾脏。感染无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)后,On IFNγ在脾脏、肾和鳃中的表达均显著上调(P<0.05)。On IFNγ在相关免疫器官中的高表达、受感染后的表达上调,说明其在罗非鱼免疫防御中可能具有重要作用。该研究为进一步开展On IFNγ基因的功能研究、探讨其在抗病转基因及抗病选育中的开发应用奠定了基础。 余嘉欣 吴芳 孙成飞 董浚键 田园园 叶星关键词:尼罗罗非鱼 Γ-干扰素 生物信息学 大口黑鲈源维氏气单胞菌的分离鉴定 被引量:16 2021年 为查明2020年春季广东省佛山市某养殖场人工养殖大口黑鲈(Micropterus salmoides)鱼苗出现暴发性死亡的病因,该研究对患病大口黑鲈鱼苗肝脏组织中分离的一株细菌GZXR2020进行了分子鉴定,PCR扩增获得该菌株的16S rRNA基因和gyrB基因全长序列,BLAST显示其与维氏气单胞菌(Aeromonas veronii)的相应序列高度同源,同源性分别高于99.5%和98.3%。根据VITEK2全自动细菌鉴定系统45个理化项目的鉴定结果、羊血琼脂平板溶血实验呈β-溶血的结果,进一步通过毒力基因检测并结合补充理化鉴定结果,可判断此分离菌株为维氏气单胞菌温和生物型(A.veronii bv.sobria)。人工回归感染实验采用低、中、高3种菌液浓度(3×10^(7)、1.5×10^(8)和3×10^(8)CFU·mL^(−1))进行腹腔注射攻毒,可分别导致7%、40%和100%的死亡率,证实维氏气单胞菌温和生物型是引起此次大口黑鲈暴发性死亡的致病原。药物敏感性实验显示,在所检测的17种抗菌药物中,该菌株对大观霉素、氟罗沙星、氟苯尼考等7种药物敏感。 杨超 董浚键 刘志刚 孙成飞 赵飞 叶星关键词:大口黑鲈 耐药分析 结合线粒体D-loop序列和SSR标记对宝石鲈养殖群体遗传多样性的分析 被引量:3 2019年 采用线粒体D-loop序列及SSR标记分析广东4个宝石鲈(Scortum barcoo)养殖群体的遗传多样性。D-loop序列分析显示,长度为598bp的D-loop片段上有14个多态性位点,共定义8个单倍型。4个群体单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数分别为0.0000~0.5435、0.00000~0.00176,表明4个群体遗传多样性水平均较低。利用11个SSR位点分析显示,4个群体期望杂合度(He)=0.396~0.516、PIC=0.320~0.420,说明各群体遗传多样性处于中低水平。虽然二种方法获得的遗传分化指数FST上存在差异,分别为0.4035(D-loop)和0.0445(SSR),但二种分析结果均显示4个广东群体的遗传多样性较低、亲缘关系较近,因此有必要引进原种以丰富国内养殖群体的遗传多样性。 赵立祥 董浚键 董浚键 孙成飞 田园园 卢迈新 卢迈新关键词:D-LOOP 微卫星 草鱼两个肌肉生长抑制素cDNA克隆、表达及过量表达对胚胎发育的影响 被引量:20 2011年 肌肉生长抑制素(MSTN)是抑制肌肉生长和发育的重要生长调控因子。通过cDNA末端快速扩增法(RACE)克隆草鱼MSTN-1型和MSTN-2型全长cDNA。RT-PCR分析结果表明,MSTN-1在草鱼肌肉、脑和眼中的转录量较高,在肝胰脏、脾脏和心的转录量较低,在肠、腮、性腺和肾中无表达;MSTN-2只在脑和肌肉中有表达。在草鱼胚胎发育的0-36 hpf期间,MSTN-1的转录量较低;在胚胎发育的36-48 hpf期间,其转录量呈逐渐升高的趋势;MSTN-2各时相均无表达,可能因为该基因在草鱼胚胎发育过程中不起重要作用。通过分别显微注射MSTN-1型和MSTN-2型mRNA至斑马鱼1-2细胞期胚胎。结果显示,注射MSTN-1型mRNA过表达可导致斑马鱼体节发生期胚胎的前-后轴拉长,背-腹轴变短,脊索轻微扭曲,以及体节发育受到强烈抑制而不分化等现象。注射MSTN-2型mRNA胚胎早期发育有所延迟并未发生明显变化,但发育至60 h之后尾部明显发生严重弯曲。 濮剑威 孙成飞 蒋霞云 邹曙明关键词:草鱼 肌肉生长抑制素 克隆 过表达 温度对摄食配合饲料翘嘴鳜胃排空速率的影响 2023年 为研究温度对不同规格翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)摄食配合饲料后胃排空速率(gastric evacuation rate,GER)的影响,设定3种不同养殖温度(18、25、30℃),采用胃含物分析法分别对两种规格翘嘴鳜(89.50 g±10.21 g和246.65 g±11.34 g)胃排空特征进行分析,共测定饱食后9个不同时间点翘嘴鳜胃含物的水分含量、相对湿质量和相对干质量,并采用3种数学模型进行拟合,筛选最佳胃排空模型,以确定养殖翘嘴鳜的最适投喂频率。结果表明:不同养殖温度下,两种规格翘嘴鳜胃含物的水分含量均呈先快速后慢速上升至稳定的趋势,而胃含物的相对干质量则均为持续下降,且下降趋势呈先快速后慢速;同一规格鱼胃含物的相对干质量、相对湿质量与温度呈负相关(18℃组>25℃组>30℃组);不同养殖温度下,除小规格鱼30℃组胃含物排空时间为30 h外,其余各组鱼胃含物接近排空或完全排空时间均为48 h;鱼规格对胃含物的相对干质量和相对湿质量有极显著性影响(P<0.01),温度对胃含物水分及相对干质量和相对湿质量也均有极显著性影响(P<0.01);利用胃含物相对干质量进行胃排空模式拟合效果较好,其中指数模型更适合描述翘嘴鳜的胃排空规律;拟合模型计算显示,在18、25、30℃温度下,小规格鱼80%干质量的胃排空时间分别为17.43、12.70、9.71 h,大规格鱼则分别为20.40、15.74、13.19 h。研究表明,温度与鱼规格影响翘嘴鳜饱食配合饲料后的胃排空时间,胃排空时间随温度升高而缩短,随鱼规格增大而延长;在实际生产中冬季水温降低,投喂配合饲料的次数应减少至1次/d甚至更低,夏季可适当提高至2~3次/d;相同温度下适当增加小规格鱼投喂次数、减少大规格鱼投喂次数,可获得更好的养殖效果。 汪福保 董浚键 孙成飞 王淼 程光兆 卢迈新 叶星关键词:翘嘴鳜 胃排空时间 温度 数学模型 饵料鱼和配合饲料两种模式下广东养殖鳜鱼成本与收益分析 被引量:6 2022年 翘嘴鳜是我国传统的名贵淡水鱼,俗称“桂花鱼”(以下简称鳜鱼),肉质丰腴细嫩,味道鲜美可口,无肌间刺,营养价值高。据《2021年中国渔业统计年鉴》数据,2020年全国养殖鳜鱼产量37.7万吨,比2019年增长近4万吨,其中广东省产量14.3万吨,占比38%;2020年广东贡献了全国93%的鳜鱼增量。 汪福保 程光兆 孙成飞 董浚键 可小丽 王淼 卢迈新 叶星关键词:成本与收益分析 配合饲料 桂花鱼 饵料鱼 翘嘴鳜 鳜鱼 基于转录组测序对翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)2种肌球蛋白重链基因的克隆与分析 被引量:11 2017年 肌球蛋白重链(Myosin heavy chain,MYH)是骨骼肌粗肌丝的重要组成单位,其表达量高低影响肌纤维的组成和肌肉生长。为了解其在翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)早期生长过程中的作用,本研究从前期生长差异显著的2组(快长组和慢长组)翘嘴鳜幼鱼转录组差异表达Unigene中筛选出2个MYH基因,RACE(Rapid amplification of c DNA ends)克隆到其全长c DNA(MYH-7a,MYH-7b)。MYH-7a全长为6071 bp,开放阅读框为5820 bp;MYH-7b全长为5896 bp,开放阅读框为5745 bp。序列分析显示,2个MYH均有Loop1、Loop2环、ATP结合位点等关键结构域;进化树聚类分析显示,MYH-7a与MYH-7b均属于慢肌球蛋白。实时荧光定量PCR验证发现,其在快长组样本中表达量显著高于慢长组,与转录组测序结果一致;检测其在翘嘴鳜心肌、红白肌和皮肤等14种组织的表达水平,结果显示,MYH-7a主要在心肌中表达,而MYH-7b主要在红肌中表达;在胚胎发育不同阶段,二者随着胚胎发育的进行,表达量不断增加;在幼鱼早期生长过程(孵化出膜后15 dph、30 dph和60 dph)的翘嘴鳜白肌中,在15 dph和30 dph快长组的表达量显著高于慢长组,而到60 dph时快长组的表达量均显著低于慢长组。翘嘴鳜MYH-7a、MYH-7b在快长组与慢长组鱼中的差异表达提示它们在翘嘴鳜胚胎及其早期生长发育过程中发挥重要作用。 陈之航 董浚键 孙成飞 田园园 叶星关键词:翘嘴鳜 转录组测序 肌球蛋白重链 CDNA克隆 一种鱼卵孵化装置 本实用新型公开了一种鱼卵孵化装置,包括支架、循环水系统、一个以上的孵化系统、水质处理监控系统;循环水系统包括储水槽、潜水泵、高位水槽、集水槽、进水管和出水管;储水槽设于支架底部,潜水泵设置于储水槽内,高位水槽设于支架的顶... 叶星 姜鹏 孙成飞 刘海涌 卢迈新文献传递