冯献礼
- 作品数:3 被引量:3H指数:1
- 供职机构:吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:理学生物学更多>>
- 几种蛋白结构和功能的研究
- 近年来,随着信息技术的快速发展,分子动力学模拟成为研究生物大分子结构、功能、性质的重要方法之一。它可以从原子水平,相当长的时间尺度对生物大分子以及复杂生物体系进行分子动力学模拟,为实验提供更加深入的阐释和指导。本论文用分...
- 冯献礼
- 关键词:分子动力学模拟
- 分子动力学模拟研究点突变(Met108→Leu108)对树胶醛糖结合蛋白与配体作用的影响被引量:1
- 2014年
- 为了研究点突变(Met108→Leu108)对树胶醛糖结合蛋白(ABP)与配体结合能力的影响,对ABP、ABP结合树胶醛糖复合物及ABP结合半乳糖复合物以及它们各自的突变体分别进行60 ns的分子动力学模拟.模拟结果表明,108号残基突变前后,电子等排体的两个氨基酸残基,使蛋白与配体间的范德华相互作用发生明显变化,同时导致蛋白的内部运动也发生变化,进而影响蛋白与配体的相互作用.进一步分析表明,突变前后的蛋白构象变化都趋向于两个结构域张开,而与配体的结合可减缓张开程度.
- 冯献礼李卓赵熹于辉刘慧玲黄旭日
- 关键词:分子动力学
- 分子动力学模拟极端嗜热核糖结合蛋白的热力学稳定性被引量:1
- 2012年
- 采用分子动力学模拟方法研究极端嗜热性核糖结合蛋白(tteRBP)的嗜热机理.在常温(300 K)和最佳活性温度(375 K)时,分别对tteRBP分子进行动力学模拟,结果表明,整体分子均保持结构稳定,但分子内部的协调运动不同.在375 K时蛋白整体柔性显著提高,使分子能够局部调整构象以适应极端高温.蛋白结构变化的分析也确认了高温时构象局部微调对蛋白极端高温稳定性的关键作用.
- 冯献礼赵熹于辉王乙博孙铁东黄旭日
- 关键词:RIBOSEBINDING