李嫣
- 作品数:21 被引量:3H指数:1
- 供职机构:中国科学院上海有机化学研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划上海市科学技术委员会资助项目更多>>
- 相关领域:医药卫生理学自动化与计算机技术化学工程更多>>
- 建立蛋白-蛋白分子对接打分函数的评价体系
- 蛋白质-蛋白质相互作用是生命活动中许多重要进程的基础。在模拟蛋白-蛋白相互作用的计算方法中,分子对接由于具有精度良好、适用性强、方便快速等优点而得以广泛的应用。
- 韩莉刘志海李嫣王任小
- 关键词:蛋白-蛋白相互作用分子对接打分函数
- 2-芳基-6-芳基'-葡萄糖苷类化合物及其制备方法与应用
- 本发明公开了一类2-芳基-6-芳基′-葡萄糖苷化合物及其制备方法与应用,具有如下的结构式:<Image file="D2008100419081A00011.GIF" he="91" imgContent="undefi...
- 王任小俞飚史合方李勋周炳城李嫣石志敏张兴龙朱翠侠李雯雯
- 文献传递
- 一种苯基噻吩磺酰胺类化合物、药物组合物、其制备方法和应用
- 本发明公开了一种苯基噻吩磺酰胺类化合物、药物组合物、其制备方法和应用。本发明化合物能够在分子水平上有效地、选择性地抑制细胞凋亡过程中的关键蛋白Bcl‑2家族中的Bcl‑xL、Bcl‑2或Mcl‑1,尤其是Mcl‑1。同时...
- 王任小洪然樊文杰田杰李嫣周宓李晴孔文娜李杨峰李婕
- 文献传递
- 药物研发领域中的开放访问数据库被引量:1
- 2015年
- 开放访问数据库的发展极大推动了各领域的科学研究.本文以药物研发的几个代表性阶段为主线,介绍了该领域涉及的一批主流开放数据库,旨在为读者描绘药物研发领域值得关注的信息资源.另外,本文介绍了本课题组开发的PDBbind-CN数据库的构建过程和基本内容,这是一个致力于收集生物大分子复合物结构和亲合性数据的开放访问数据库,在药物分子设计领域中得到了国内外同行的广泛应用.
- 刘志海李婕韩莉李嫣刘杰聂伟刘宇晨王任小
- 关键词:药物研发
- 应用化学基因组信息预测小分子化合物的潜在生物靶标的理论方法被引量:1
- 2009年
- 在后基因组时代,化学基因组技术在药物作用靶点的确认、小分子化合物对通路的作用,以及小分子先导化合物的识别等方面都有着广泛的应用,为新药研发提供了新的技术方法。本文主要介绍了当前几种基于化学基因组信息来预测小分子化合物潜在生物靶标的理论方法(包括化学相似性搜索方法、反向分子对接方法、数据挖掘方法以及生物活性谱图分析方法),并分析了这些方法的优缺点以及应用前景。
- 李嫣王任小
- 关键词:数据挖掘
- 完善评价蛋白-配体打分函数性能的CASF方法体系
- 亲合性打分函数由于其具有计算消耗小,计算结果准确性尚可等优点而得到了广泛的应用。一个标准的评价体系可以帮助研究者客观了解打分函数的性能及其局限性,为打分函数的发展奠定一个扎实的基础。本课题组致力于发展一个高质量的打分函数...
- 苏敏仪李嫣刘志海王任小
- 关键词:打分函数性能评价
- 一种噻唑酰胺类化合物、其制备方法、药物组合物及应用
- 本发明公开了一种噻唑酰胺类化合物、其制备方法、药物组合物及应用。本发明提供了一种如式I所示的噻唑酰胺类及其药学上可接受的盐,该类化合物能够在分子水平上有效地、选择性地抑制细胞凋亡过程中的关键蛋白Bcl‑X<Sub>L</...
- 王任小郭春俞飚李杨峰李嫣安然徐耀春周宓李晴孔文娜李婕
- 文献传递
- 一种计算水溶解度的经验加合模型的适用范围与局限(英文)
- 2012年
- 我们发展了一种用于预测有机小分子化合物水溶解度(logS)的经验方法XLOGS.它本质上是一种加合模型,采用83种原子/基团类型和3个校正因子作为模型的描述符.该方法还可以根据一个合适的参照分子的logS实验值来计算未知化合物的logS值.我们将XLOGS模型在由4171个化合物组成的训练集上进行了参数化,多元线性回归获得的相关系数(R2)和标准偏差(SD)分别为0.82和0.96单位.将该训练集进一步分为仅含液体化合物和仅含固体化合物的两个子集.XLOGS模型在这两个子集上的回归结果显示前者优于后者(标准偏差分别为0.65单位和0.94单位).还利用log1/S和logP(脂水分配系数)之间的差值来研究XLOGS方法在液体和固体化合物数据集上的表现.研究结果表明:XLOGS等加合法模型更适合应用于这两者差值接近于0的化合物.还将XLOGS和其它三种流行的logS计算模型(包括Qikprop,MOE-logS和ALOGPS)在一个含有132个类药化合物的独立测试集上进行了比较.总体而言,我们的研究结果为加合法模型在水溶解度预测方面的合理应用提供了指导.
- 段宝根李嫣李婕程铁军王任小
- 关键词:水溶解度
- AutoT&T v2:一种高效多功能的先导结构生成与优化工具
- 我们发展了一种全新药物设计方法AutoT&T,它能够有效利用虚拟筛选结果来优化先导化合物。AutoT&T通过检测虚筛分子中的合适片段,并将其移植到先导化合物上,产生具有更高亲合性的新化学结构。它克服了传统的基于片段堆积的...
- 李嫣赵志雄刘志海王任小
- 文献传递
- 一种噻唑酰胺类化合物、其制备方法、药物组合物及应用
- 本发明公开了一种噻唑酰胺类化合物、其制备方法、药物组合物及应用。本发明提供了一种一种如式I所示的噻唑酰胺类及其药学上可接受的盐,该类化合物能够在分子水平上有效地、选择性地抑制细胞凋亡过程中的关键蛋白Bcl‑X<Sub>L...
- 王任小郭春俞飚李杨峰李嫣安然徐耀春周宓李晴孔文娜李婕