陈坤明 作品数:32 被引量:133 H指数:6 供职机构: 西北农林科技大学生命科学学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 中央高校基本科研业务费专项资金 陕西省自然科学基金 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 文化科学 动力工程及工程热物理 更多>>
细胞生物学实验教学模式的反思与重构 被引量:4 2020年 传统的实验教学模式不利于学生分析问题、解决问题能力的培养及创造性思维的启迪。文章从细胞生物学实验教学现状出发,分析传统实验教学模式存在的不足,并提出重构“探索—分析—设计”细胞生物学实验教学模式的策略,在这种实验教学模式下学生的自学能力和创新能力都会得到提高。 李绍军 陈坤明 黄伟伟关键词:实验教学 细胞生物学 教学模式 细胞生物学中Karyoplast与Nuclear body的教学建议 被引量:1 2016年 Karyoplast与Nuclear body是不同的概念,国内细胞生物学教材、部分生物学词典的对应中文翻译存在概念冲突、混乱的现象。大陆名词审定委员会建议"核体"对应Karyoplast的翻译,但这种表达不够准确和贴切,同时缺乏对Nuclear body的收录,容易导致科研和教学使用不规范。文章对相关科学名词进行概念辨析并提出相应教学建议。通过采用问题导入、辨析式、研讨式教学以及BOPPPS教学模式开展这部分内容的教学,实践发现正面面对这些问题有助于培养学生的科学精神。 李绍军 高梅 陈坤明 胡景江关键词:核体 科技名词 教学 水稻OSNADK3基因的克隆及其遗传转化 被引量:1 2011年 从韩国浦项科技大学(Pohang University of Science and Technology,POSTECH)水稻T-DNA插入突变体库PFG_3A-04871.R株系中筛选到一个NADK3(NAD Kinase 3)激酶(LOC_Os05g32210)基因OSNADK3表达缺失的突变杂合体。与其野生型Dongjing(Oryza sativa L.var.japonica cv Dongjing)比较,该OSNADK3基因突变杂合体表现出明显的植株矮小、花发育异常以及不育等特点。为明确水稻NADK3激酶的功能,我们利用RT-PCR的方法克隆了水稻(Dongjing)OSNADK3基因的编码区(CDS),将OSNADK3导入表达载体pCAMBIA1301::35S::GFP(pCG)中,构建了OSNADK3和绿色荧光蛋白(GFP)融合表达载体pCAMBIA1301::35S::NADK3::GFP(pCNG),该融合表达载体能够在拟南芥叶中表达,亚细胞组织定位分析表明,OSNADK3在拟南芥细胞质中表达,表明该酶是细胞质定位的酶类。然后,利用农杆菌介导的方法侵染水稻愈伤组织,获得了24株独立的转基因水稻植株。经PCR初步鉴定,目的片段OSNADK3已经成功整合到水稻基因组中,为进一步深入研究水稻OSNADK3的功能与作用机制奠定了基础。 吴丽丽 周丛义 高永生 丛悦玺 陈坤明 郭万里关键词:水稻 GFP 生物学名词“核体”的规范翻译与使用 2014年 核体这一名词,在大陆生物学科研论文、教材及词典中的使用和中英文翻译中存在混乱的现象,同一个中文名词指向了多个概念。全国科学技术名词审定委员会在官方网站和发布的词典中支持"核体"对应karyoplast的翻译,但不够"信、达、雅",也没有收录nuclear bodies这一重要概念。本文对此现状进行分析并提出该领域相关名词的中译文规范建议:karyoplast应该译为"核质体",而nuclear bodies应该译为"核体"。 李绍军 陈坤明关键词:核体 水稻NAM基因家族的全基因组鉴定及表达分析 被引量:3 2020年 植物特异性转录因子NAM家族从属于NAC转录因子超家族,在植株生长发育、生理代谢以及应对各种胁迫反应中均发挥重要作用。该研究采用生物信息学方法鉴定水稻基因组中的NAM基因,分析其时空表达模式、亚细胞定位以及蛋白相互作用,并采用实时定量qRT-PCR方法分析不同外源激素(如SA、ABA和MeJA)以及非生物胁迫(包括干旱、盐和冷)处理下各NAM基因的表达特征,为进一步探索NAM基因在非生物胁迫中的功能和应激机制以及激素调控途径奠定基础。结果显示:(1)从水稻基因组中共鉴定出48个NAM基因,进化分析将其分为5个亚家族;NAM基因在水稻基因组中存在9对片段复制事件。(2)组织表达分析显示,NAM基因在水稻不同组织及发育时期表现特异性表达,特别是叶鞘、茎和节的生长过程中高表达,且大多数是核定位,并存在多种蛋白互作。(3)实时定量qRT-PCR表达分析显示,10个NAM基因在不同组织中均特异表达;大部分NAM基因在盐和干旱胁迫下表达上调,而在冷胁迫下表达降低;SA、ABA和MeJA处理均可显著改变各NAM基因的表达水平。研究表明,NAM基因在水稻生长发育、激素应答和非生物胁迫响应中具有重要作用。 陈琼琼 Abdullah Shalmani 陈云波 黄洋彬 陈坤明 李文强关键词:水稻 非生物胁迫 基因表达 关于现代细胞生物学专题课程建设的探索 被引量:8 2012年 细胞生物学是现代生命科学研究中最活跃的领域,对农业科学院校的学生来说掌握其基本原理、基本方法和研究前沿是非常必要的。该文从教学理念、课程内容设置、教学方法与考核方式、教学效果等方面介绍了近两年来为该校本科生开设现代细胞生物学专题的经验和思考。通过以专题的形式开展了完善细胞生物学立体化教学体系的探索,在尊重学生个性化的基础上,对引导学生了解这门学科的前沿进展、科研思路,帮助学生拓宽视野、建立科学世界观都产生了重要的意义。 李绍军 陈坤明 江元清 高梅 姚雅琴 胡景江关键词:个性化培养 立体化教学 教学改革 细胞生物学实验教学改革探索 被引量:40 2013年 细胞生物学是当代生命科学的基础学科,也是发展迅猛的前沿学科之一。为了促进学生的实践动手能力和实践创新能力,配合细胞生物学理论课教学改革的不断深化,细胞生物学实验教学改革已是大势所趋。该教研组经过多年的探索,从教学体系、教学内容和教学手段等方面对细胞生物学实验教学进行了改革,旨在充分调动学生学习的主动性和积极性,培养学生的独立思考、综合运用知识和科研创新的能力。 胡鑫 高梅 李绍军 陈坤明 梅莉关键词:细胞生物学 教学改革 青杄类伸展蛋白基因PwELP1的克隆及表达分析 2016年 【目的】克隆青杄类伸展蛋白(extensin-like proteins,ELPs)基因PwELP1并分析该基因的表达特性,为研究ELP基因家族的功能奠定基础。【方法】以青杄cDNA文库为模板,用RACE-PCR方法克隆青杄类伸展蛋白编码基因PwELP1的cDNA全长,利用DNAMAN确定PwELP1的编码框及蛋白氨基酸的翻译,运用clustalx软件与Espript工具进行多序列比对,利用MEGA 5软件的邻位相连法构建系统树,并对编码蛋白进行生物信息学分析;利用RT-qPCR检测PwELP1基因在青杄不同组织中表达的特异性、花粉和种子不同萌发时期及幼苗受到不同逆境处理时的表达差异,分析该基因的组织发育及逆境响应表达特点。【结果】PwELP1基因全长832bp,其编码一个由159个氨基酸组成的蛋白,该蛋白的N端与C端均有比较保守的结构域;此蛋白二级结构由1个α-螺旋、5个β-折叠与3个β-转角结构构成,对其三级结构的预测印证了这一结果,同时发现该蛋白中还存在部分无规则卷曲。其分子质量为17.03ku,理论等电点为5.81。PwELP1在青杄花粉中的表达量较高,且在花粉萌发后期(30-36h)以及种子萌发初期(第2天)表达量高;PwELP1的表达不同程度地受低温、高温、茉莉酸甲酯(MeJA)、H2O2、脱水以及脱落酸(ABA)等非生物逆境胁迫处理的诱导,尤其是H2O2、高温和ABA,处理初期表达量就显著升高。【结论】PwELP1在青杄花粉和种子萌发过程中可能发挥重要功能,并可参与青杄对非生物逆境胁迫的响应过程。 郜银涛 周燕妮 罗朝兵 张凌云 陈坤明关键词:非生物胁迫 “科学幻想与人类未来”公共选修课教学实践策略 被引量:3 2015年 在高校中开设"科学幻想与人类未来"公共选修课,既能够提升大学生的想象力,又能够启发他们进行科学思考。文章从"科学幻想与人类未来"公共选修课开设的目的和意义着眼,从精选教学内容、采用适当的方法培养大学生的科学精神等方面提出了其教学实践策略。 李绍军 肖亮 陈坤明关键词:公共选修课 高校 不产氧光合细菌分离鉴定及其产氢菌株的快速筛选 被引量:2 2016年 为建立产氢不产氧光合菌株的快速筛选方法,从采自陕西、河南、安徽3个省8份不同水样中分离出的不产氧光合细菌,通过菌落形态、革兰氏染色、细菌特征峰及16SrDNA鉴定等方法进行初步鉴定获得不产氧光合细菌,同时利用自制的产氢菌株快速筛选系统对其产氢能力进行检测,并分析菌液终点氧化还原电位与细胞产氢的关系。结果表明:共分离得到31株光合细菌,其中18株沼泽红假单胞菌(Rhodopseudomonas palustris)、5株荚膜红细菌(Rhodobacter capsulatus)、4株球形红细菌(Rhodobacter sphaeroides)和2株固氮红细菌(Rhodobacter azotoformans),此外还有2株菌与Rhodobacter sp.TCRI 14相似。这些光合细菌的产氢能力存在显著差异,其中3株产氢性能较高,2株为沼泽红假单胞菌,1株为球形红细菌。通过菌液终点氧化还原电位与细胞产氢能力对比,发现产氢较高的菌株其菌液的终点氧化还原电位也明显较低。 邓春浩 苟维超 孙良昱 陈坤明关键词:不产氧光合细菌 产氢