李妍
- 作品数：87 被引量：240H指数：8
- 供职机构：南方医科大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广东省自然科学基金国家科技攻关计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学文化科学自动化与计算机技术更多>>
- 基于Mimox工具分析幽门螺杆菌Catalase模拟表位
- 2012年
- 目的利用Mimox软件分析幽门螺杆菌Catalase蛋白模拟表位的性质，并与手工比对结果进行比较。方法将源于噬菌体随机肽库筛选技术获得的5个Catalase模拟表位输入Mimox网站，参数设定为默认值，进行模拟表位的比对，寻找共同序列并分析其性质。结果从ClustalW界面比对结果看，氨基酸P、T、S、L、A出现频率较高，通过统计学的方法推导出的共同序列为-[HST]X[DST]FRPXA[TNQ][LV][Fw]T-，其中氨基酸P（80％）和A（60％）的出现频率较高。通过JalView界面推导出的共同序列为-H—DFRP—AT—T-，保守性上氨基酸T（分值8）、P（分值6）、D（分值5）比较高；特性上氨基酸T（分值2．4595077）、P（分值2．235784）、R（分值2．1615076）比较高；共同性（consensus）上氨基酸P（80％）、A（60％）、T（60％）比较高，与先前手工比对得出的结论基本相符。结论结合噬菌体筛选技术和生物信息学Mimox工具对模拟表位进行分析，可以获得较全面的表位信息。
- 李妍曾爽宁云山
- 关键词：模拟表位幽门螺杆菌CATALASE
- 幽门螺旋杆菌免疫优势表位肽L<Sub>79-96</Sub>及其应用
- 本发明涉及一种幽门螺旋杆菌Lpp20的HLA限制性CD4+T细胞表位免疫优势肽和核心肽，其组成如SEQ ID NO.10和SEQ ID NO.30所示。本发明所涉及的合适的CD4<Sup>+</Sup>T细胞表位(SEQ...
- 李妍宁云山
- 文献传递
- 幽门螺杆菌标准株NCTC11639 CagA基因的克隆表达及其抗原性的鉴定被引量：3
- 2006年
- 幽门螺杆菌（Helicobacter pylori，Hp）是慢性消化道疾病的主要致病菌。本研究利用基因工程技术构建CagA基因并进行了表达，为CagA疫苗和诊断抗原的研究奠定基础。
一、材料和方法
1．菌株来源和质粒：Hp标准株NCTC11639由本校微生物教研室保存；E．coli DH5α和TOP10及表达载体pGEX-4T-1由本室保存。
- 宁云山李妍龙敏董文其李明
- 关键词：CAGA基因幽门螺杆菌标准株抗原性慢性消化道疾病
- 疟疾研究的最新进展被引量：2
- 2004年
- 迄今疟疾仍然是严重威胁人类健康的寄生虫病,每年约有300万人死于疟疾,其中90%发生在贫穷的非洲撒哈拉以南地区;进入21世纪,人类在疟疾的研究领域中取得了一系列重要的研究成果.2002年塞莱拉公司绘制的恶性疟原虫及其冈比亚按蚊的基因组序列图谱,被称之为疟疾研究领域的"里程碑".人类基因组草图的绘制,恶性疟原虫及其主要传播媒介--冈比亚按蚊的基因密码的破译,意味着人类获得了完整研究疟疾传播周期的所有遗传信息,这无疑将为人类战胜疟疾提供了前所未有的机遇.
- 李妍宁云山李明
- 关键词：疟疾寄生虫病身体健康蛋白质组学
- 鱼的摄入与肾癌发病风险关系的Meta分析
- 2013年
- 目的应用meta分析的方法对各项研究进行系统分析以研究鱼的摄入与肾癌发病风险关系。方法在PubMed,Embase,CNKI,CA中检索有关鱼及其产品的摄入与肾癌关系的病例对照研究以及队列研究的文献。通过meta分析方法研究鱼的摄入与肾癌的关系。运用I^2检验各项研究的异质性,并使用漏斗图检验发表偏倚。结果共纳入17篇文献,采用随机效应模型合并分析后的结果未发现鱼的摄入与肾癌的发病风险相关(RR=0.90;95%CI,0.78～1.02)且异质性明显(P=0.003,I^2=52.3%),针对研究类型、研究地区以及发表时间进行亚组分析,同样没有明显的证据证明两者相关,但在性别亚组的分析中发现,男性增加鱼的摄入可降低肾癌的发病率,而在女性中则没有关系。结论 meta分析结果提示增加鱼的摄入未发现有预防肾癌发病的作用。
- 万沛李妍李飞马天骏蓝开健陈炜陈三三何成武谭万龙
- 关键词：肾癌META分析
- 恶性疟原虫谷氨酸脱氢酶在大肠埃希菌中的可溶性表达、纯化和鉴定
- 2004年
- 目的 在大肠埃希菌 (E .coli)中尝试非融合蛋白技术可溶性表达恶性疟原虫谷氨酸脱氢酶 (GDH) ,以获得具有相对完整空间表位的重组非融合GDH。 方法 将恶性疟原虫GDH基因克隆到pET 2 3 (a)表达载体中 ,转化E .coliBL2 1菌株 ,异丙基 β D 硫代半乳糖苷诱导表达 ,菌体反复冻融后 ,通过十二烷基硫酸钠 聚丙烯酰胺凝胶电泳 (SDS PAGE)分析表达产物的存在形式 ,可溶性表达产物经Source Q及Source S层析纯化并用SDS PAGE分析纯度。通过蛋白质印迹试验鉴定表达和纯化产物的免疫学活性。 结果 可溶性重组GDH分子占宿主蛋白 15 %左右 ,相对分子质量为 5 2 0 0 0。经过阴离子和阳离子交换层析纯化后 ,GDH纯度达 90 %以上。该蛋白质具有良好的抗原性。 结论 通过E .coli表达系统和柱层析分离技术可获得高纯度。
- 李妍宁云山董文其李明
- 关键词：恶性疟原虫谷氨酸脱氢酶基因表达大肠埃希菌
- 抗新冠病毒中和抗体VJ基因偏好性分析、预测方法及设备
- 本发明属于生物信息学分析技术领域，公开了一种抗新冠病毒中和抗体VJ基因偏好性分析方法，包括抗体数据库获取数据、数据的筛选、选择频率统计、选择偏好性分析、选择频率和偏好性可视化、配对频率统计、配对偏好性分析、配对频率和偏好...
- 宁云山洪梓鑫李佳钰李钦鹏李妍
- 一组用于头颈部鳞状细胞癌分子分型的基因及其应用
- 本发明提供一组用于HNSCC分子分型的基因，包括TP53基因、CDKN2A基因、FAT1基因、CASP8基因、AJUBA基因、PIK3CA基因、NOTCH1基因、KMT2D基因、NSD1基因、HLA-A基因、HRAS基因...
- 宁云山李妍
- 文献传递
- 幽门螺杆菌5种候选疫苗抗原基因的克隆、表达及抗原性的鉴定被引量：4
- 2006年
- 目的:构建含人Hpylori5种候选疫苗抗原Lpp20,HspA,UreaseA,CagA,UreaseB的编码基因的重组质粒并研究其抗原性.方法:应用PCR技术从Hpylori染色体中扩增编码Lpp20,HspA,UreaseA,CagA,UreaseB的基因片段,将其T-A克隆和测序,并与GenBank公布的其他Hpylori菌株基因序列比较,再将目的基因克隆至融合表达载体pGEX-4T-1上中进行表达,用GST亲和层析对其进行纯化,纯化产物用于对29株小鼠抗Hpylori-全菌单克隆抗体(mAb)的鉴定及与Hpylori感染患者血清进行Westernblot分析.结果:扩增的Lpp20,HspA,UreaseA,CagA,UreaseB基因全长分别为528bp,351bp,675bp,855bp,1704bp(GenBank登录号分别为DQ106902,DQ141574,DQ141577,DQ141575,DQ141576),与GenBank公布的其他菌株的核酸序列的同源性在95%-99%,表达Lpp20,HspA,UreaseA,CagA,UreaseB融合蛋白的相对分子质量分别约为48000,41000,52000,60000,91000Da,29株小鼠抗Hpylori全菌mAb中针对Lpp20,HspA,UreaseA,CagA,UreaseB抗原的分别为4,5,5,1,6株,5种抗原的纯化产物均可被Hpylori感染患者血清特异性识别.结论:重组表达的Lpp20,HspA,UreaseA,CagA,UreaseB均具有较好的抗原性.
- 宁云山李妍龙敏董文其李明
- 关键词：幽门螺杆菌克隆基因表达抗原性
- 应用噬菌体随机肽库技术筛选幽门螺杆菌中性粒细胞激活蛋白的抗原表位
- 2008年
- 目的筛选和鉴定幽门螺杆菌（Helicobacter pylori，Hp）中性粒细胞激活蛋白（neutro-phil-activating protein，NAP）的有效抗原表位，为坳疫苗的研制提供基础。方法以抗NAP的单克隆抗体作为固相筛选分子，经3轮吸附．洗脱．扩增免疫，筛选噬菌体随机7肽库，随机挑选噬菌体克隆，经噬菌体酶联免疫吸附试验（ELISA）、交叉反应试验及竞争抑制试验鉴定阳性克隆，测定阳性克隆所携带DNA序列并进行计算机辅助分析。以制备的阳性噬菌体克隆短肽液免疫小鼠，免疫血清与NAP经Western blot分析，以验证NAP的模拟表位。结果经3轮免疫筛选后挑选到45个阳性克隆，经ELISA鉴定有12个阳性克隆，测序结果显示5种表位，其中P17噬菌体展示肽FAHLATQ与NAP氨基酸序列（137-143）高度同源，位于NAP高抗原区域（118-140），免疫血清可识别NAP。结论用噬菌体随机7肽库成功筛选到了NAP的模拟表位，为基于NAP的诊断和疫苗的研制提供了基础。
- 罗军李妍赖建平龙敏张文炳龙北国
- 关键词：幽门螺杆菌中性粒细胞激活蛋白表位噬菌体肽库
