刘国栋 作品数:11 被引量:52 H指数:5 供职机构: 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 更多>> 发文基金: 国家科技支撑计划 艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
基于胃黏膜多重Real time PCR的幽门螺杆菌根除药物选择技术的建立与评价 幽门螺杆菌(Helicobacter pylroi,简称H. pylori或HP),能够引起慢性胃炎、胃溃疡等消化道相关疾病,是WHO癌症协会规定的细菌中唯一的Ⅰ类致癌因子。以质子泵抑制剂(proton pump inh... 刘国栋关键词:幽门螺杆菌 胃粘膜 文献传递 标本运输状态对幽门螺杆菌检出率的影响 被引量:8 2011年 目的比较胃黏膜标本运输状态对幽门螺杆菌(Hp)检出率的影响,为Hp分离前胃黏膜标本的保存、运输方法的选择提供科学依据。方法随机抽取快速尿素酶检测阳性胃黏膜标本72份,分别保存于含有20%甘油的脑心浸液中。根据标本到达实验室的状态分为3组:完全溶解液体状态组(20份),部分冻融状态组(32份)和冰冻状态组(20份)。所有标本都来源于13C呼气试验(13C UBT)阳性患者。标本经研磨后接种于哥伦比亚和Karmali 5%脱纤维羊血琼脂培养基,置37℃微需氧环境(5.0%O2,10.0%CO2,85.0%N2)培养3~11 d。挑取单菌落,进行革兰染色检查及生化和PCR鉴定,比较3组标本Hp检出率差异。结果冰冻状态组标本Hp检出率95.0%(19/20),完全溶解液体状态组Hp检出率为15.0%(3/20),部分溶解状态组Hp检出阳性率59.4%(19/32),三组Hp检出率差异有统计学意义(P〈0.05)。结论冻融胃黏膜标本Hp检出率显著降低。 何利华 刘国栋 李芳 乔博 张建中关键词:胃黏膜标本 冻融 幽门螺杆菌 检出率 幽门螺杆菌致病因子研究进展 被引量:6 2010年 本文从粘附、定植、毒力等三个方面简述了幽门螺杆菌的致病因子,对于理解幽门螺杆菌的致病性和致病机理具有重要意义。 刘国栋 张建中关键词:幽门螺杆菌 致病因子 针对不同基因靶点的胃黏膜标本幽门螺杆菌PCR检测敏感性分析 被引量:3 2011年 目的分析针对3种不同基因靶点的胃黏膜标本幽门螺杆菌PCR检测的敏感性,评价PCR方法从胃黏膜标本中检测幽门螺杆菌用于临床诊断的价值。方法采集320例13C呼气试验阳性患者的胃黏膜标本,用针对ureA、ca-gA和vacA基因的3对引物进行PCR检测,同时进行幽门螺杆菌分离培养。分别对3对引物的PCR结果相互进行Kappa一致性检验,并比较组合PCR与培养结果。结果幽门螺杆菌培养的阳性率为81.88%(262/320);ureA、cagA和vacA PCR扩增阳性率分别为56.25%(180/320)、58.13%(186/320)和81.56%(261/320),组合PCR阳性率为90.94%。ureA、cagA和vacA PCR结果经一致性检验,Kappa值分别为0.209、0.137、0.129,检测结果具有互补性。结论单一基因PCR扩增的敏感性较低且不同基因扩增效果间的一致性较差。3对引物组合使用可提高PCR方法的敏感性,幽门螺杆菌检出率高于培养法,具有一定的实际应用价值。 刘国栋 何利华 顾一心 杨宁敏 张建中关键词:PCR 胃黏膜标本 幽门螺杆菌 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌MLVA分型研究 被引量:10 2010年 目的对部分2000~2005年北京分离株耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)进行多位点串联重复序列分析(MLVA),为探索易行的分型方法提供依据。方法对49株MRSA进行MLVA分型,并与PFGE分型结果进行比较,观察MLVA方法的分型效率和特征。结果49株MRSA在分析时的MLVA分辨系数为0.820,共产生12种条带类型,C、G、I为主要型别,分别占24.49%(12/49)、18.37%(9/49)和30.61%(15/49)。MLVA方法与PFGE方法cutoff值分别为80%与85%时的符合率为93.87%,cutoff值分别为90%与89%时的符合率有所下降。结论MLVA方法具有较高的分型效率,与PFGE方法有较好的符合率,该方法在MRSA流行株初筛研究中具有推广价值。 陶晓霞 崔志刚 刘国栋 闫笑梅 张建中关键词:耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 基因分型 结肠弯曲菌Real-time PCR检测方法的建立 被引量:8 2012年 目的建立结肠弯曲菌实时PCR检测方法并评价该方法的可行性。方法BLAST与Vector NTI Suite 6.0筛选出结肠弯曲菌的特异基因ceuE作为检测靶基因,Primer 5.0和Oligo6.0设计引物和探针,优化实时PCR反应体系并评价其最低检测限、特异性、可重复性。结果与结论在结肠弯曲菌的ceuE特异基因上设计引物和探针,经优化了的实时PCR反应体系最低检测限为5.62CFU,特异度为100%,变异系数为0.15%~1.30%,本研究为结肠弯曲菌的快速检测提供了一种参考方法。 乔博 许学斌 顾一心 刘国栋 赵飞 何利华 张建中 张茂俊关键词:实时PCR 检测幽门螺杆菌克拉霉素耐药基因的试剂盒 本发明提供了用于检测幽门螺杆菌克拉霉素耐药基因的试剂盒。通过对我国克拉霉素耐药幽门螺杆菌中23SrDNA基因测序的对比,提供了用于检测幽门螺杆菌克拉霉素耐药的遗传标记的多重实时荧光定量PCR引物和探针,其核苷酸序列分别如... 张建中 刘国栋 何利华 张慧芳 顾一心 孟凡亮 赵飞 刘杰文献传递 2008-2014年间北京地区幽门螺杆菌耐药变迁分析 被引量:14 2018年 目的分析北京地区2008-2014年幽门螺杆菌(HP)耐药的变化情况。方法分别收集2008年5月至2010年10月和2013年3月至2014年1月北京地区接受胃镜检查的HP感染者的胃黏膜标本,对分离获得的HP菌株经系统鉴定后,采用E-test方法进行甲硝唑(MZ)、阿莫西林(AC)、克拉霉素(CH)、左氧氟沙星(LE)、莫西沙星(MX)、利福平(RI)、四环素(TC)、庆大霉素(GM)8种抗菌药物的耐药性检测,并进行对比分析。结果分别收集到461份(A组)和1 848份(B组)胃黏膜标本,标本进行培养后获得412和1 483株HP菌株,菌株分离率分别为89.37%和80.25%。对A组中的412株和B组中随机选择的607株HP菌株进行耐药性检测的结果显示,2013年后HP对CH、LE、MX和RI耐药率明显上升,MZ耐药率略下降,AC、TC和GM耐药率仍保持较低水平。对CH、LE、MX和RI的菌株最低抑菌浓度(MIC)分布特征进行比较发现,2013年后HP的MIC水平不论是敏感菌株还是耐药菌株,都有明显升高。结论 2013年后北京地区HP菌株对CH、LE、MX和RI的耐药率呈上升趋势,同时表现为敏感菌株和耐药菌株MIC的明显增高,是造成HP根除率显著下降的关键因素,对HP耐药判断折点的调整势在必行。 何利华 周丽雅 刘国栋 宋志强 顾一心 林三仁 张建中关键词:幽门螺杆菌 最低抑菌浓度 耐药 空肠弯曲菌外膜蛋白rOMP18的克隆表达及抗原性分析 被引量:2 2011年 目的构建空肠弯曲菌omp18基因的重组表达质粒、克隆表达rOMP18重组蛋白、对表达产物进行鉴定并评价其抗原性。方法 PCR扩增空肠弯曲菌的omp18基因片段,将其连接到表达载体pET32a(+)中并转化至大肠杆菌(E.co-liBL21(DE3)),诱导表达后SDS-PAGE分析其表达产物并纯化目的蛋白。应用空肠弯曲菌感染免疫血清,利用Western-blot方法分析其抗原性。结果与结论单、双酶鉴定结果显示已成功构建rOMP18的重组表达载体pET32a-omp18,IPTG诱导表达产物的相对分子质量与理论相符34kD(HIS16kD)。Western-blot检测结果表明重组蛋白rOMP18具有抗原性,为空肠弯曲菌感染的特异抗体的检测提供候选抗原。 乔博 孟凡亮 顾一心 何利华 张姝 肖迪 刘国栋 曹芳芳 张建中 张茂俊关键词:空肠弯曲菌 克隆 抗原性 检测幽门螺杆菌的靶序列、引物和探针及其试剂盒 本发明通过对幽门螺杆菌基因测序和对比,提供了用于检测幽门螺杆菌的遗传标记的实时荧光定量PCR引物和探针,其核苷酸序列分别如SEQ ID NO:1,SEQ ID NO:2,SEQ ID NO:3,SEQ ID NO:4所示... 刘国栋 张建中 何利华 张慧芳 顾一心 孟凡亮 尤元海 刘杰文献传递