张茂俊
- 作品数:101 被引量:319H指数:12
- 供职机构:中国疾病预防控制中心传染病预防控制所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家科技重大专项更多>>
- 相关领域:医药卫生农业科学生物学航空宇航科学技术更多>>
- 一种基于胃液多重实时PCR检测的幽门螺杆菌(HP)个体化治疗辅助诊断方法
- 本发明公开了一种基于胃液多重实时PCR检测的幽门螺杆菌(HP)个体化治疗辅助诊断方法。本发明所述方法能从10-500μl胃液标本中同时检测出HP的特异基因、HP克拉霉素耐药突变位点A2143G和A2142G、以及相应患者...
- 张建中彭贤惠刘杰何利华赵飞闫笑梅张茂俊张慧芳
- 文献传递
- 幽门螺杆菌cagA基因PCR检测方法初探
- 2001年
- 目的 建立敏感性高的幽门螺杆菌菌株cagA基因PCR检测方法 ,为客观评价CagA在我国幽门螺杆菌感染致病中的作用提供基础。方法 通过分析比较GenBank中已知的cagA基因序列 ,设计了一对针对cagA基因保守序列、可扩增 2 97bp片段的PCR引物 ,用PCR方法检测幽门螺杆菌的cagA基因 ,与SDS PAGE检测CagA蛋白的结果进行比较。结果 PCR检测 82株国内幽门螺菌杆菌的cagA基因 ,77株为cagA阳性 ,阳性率为 93 .9% ,SDS PAGE显示包括所有PCR扩增阴性菌株在内的 74株幽门螺杆菌均表达CagA ,阳性率为 1 0 0 %。PCR检测cagA基因的敏感性为 93 .2 %。结论 建立了敏感性高的幽门螺杆菌cagA基因PCR检测方法。
- 周建嫦张建中徐采朴何利华张茂俊盛涛郭浩岩
- 关键词:幽门螺杆菌CAGA基因PCR
- 广西空肠弯曲菌和结肠弯曲菌流行病学调查被引量:10
- 2012年
- 目的了解广西空肠弯曲菌和结肠弯曲菌引起腹泻的流行病学特点以及在健康人群和动物中携带状态。方法在广西崇左市大新县和南宁市对腹泻病例、5岁以下健康人群、养猪场和屠宰厂职工以及养殖场和农贸市场的猪、鸡等进行流行病学调查并采集粪便标本,进行实验室空弯菌和结弯菌的分离培养、PCR鉴定以及脉冲场凝胶电泳分型(PFGE)分析。结果弯曲菌检出率为2.13%(21/985),空肠弯曲菌和结肠弯曲菌检出率分别为1.12%(11/985)和1.02%(10/985)。腹泻病例检出率为0.89%(6/677),以5岁以下年龄组和20~29岁年龄组检出阳性率为高,除冬季外其余季节均检出阳性;人群弯曲菌检出阳性率为8.26%(10/121),2岁以下空肠弯曲菌检出率较高,结肠弯曲菌则在每个年龄段均有检出;鸡、猪检出弯曲菌阳性率为3.23%(5/155),空肠弯曲菌和结肠弯曲菌的检出率分别为1.29%(2/155)和1.94%(3/155),两种动物的阳性率差异无统计学意义。所有生化结果阳性的菌株其PCR复核鉴定结果均为阳性。来自南宁市和大新县的两株空弯菌PFGE型别一致,提示二者可能存在相同的感染源。结论广西地区人群及部分动物中空肠弯曲菌、结肠弯曲菌的流行状况呈现多样化和复杂化态势。
- 林玫周凌云王鸣柳廖和壮黄君农志新农良伟梁大斌权怡方锦嵩张茂俊
- 关键词:弯曲菌流行病学病原学
- NASBA和RPA两种等温扩增技术在病原菌检测中的应用研究被引量:15
- 2019年
- 依赖核酸序列扩增和重组酶聚合酶扩增技术是在PCR基础上发展起来的等温扩增技术。本文介绍了这两个技术的反应原理、引物探针设计原则以及优势,根据其简便、准确性好、灵敏度高、周期短的特点进一步对该技术在病原菌检测中的应用予以综述及展望。
- 岳苑张建中张茂俊
- 关键词:病原菌
- 不同品系养殖鸡弯曲菌感染调查被引量:2
- 2014年
- 目的了解规模化养殖鸡弯曲菌感染现状。方法随机采集北京市某规模化养殖场蛋鸡(养殖时间大于120d)和肉鸡(养殖时间小于42d)肛拭子标本,采用两种分离培养方案(80份蛋鸡和200份肉鸡标本直接经选择性培养基划线培养,150份肉鸡标本经24h增菌后采用选择性培养基划线培养)进行弯曲菌的微需氧(5%O2、10%CO2和85%N2)培养。从肉鸡标本中随机选取50份,提取病原菌DNA,进行弯曲菌荧光定量PCR检测,并对相同培养条件下生长菌落进行质谱鉴定。结果 80份蛋鸡标本中分离到24株空肠弯曲菌,阳性率为30%;350份肉鸡标本未检测到弯曲菌。通过质谱菌落鉴定,205份标本检测到奇异变形杆菌,检出率为58.6%;145份标本检测到大肠埃希菌,检出率为41.4%。50份肉鸡粪便标本弯曲菌荧光定量PCR检测结果均为阴性,与分离培养结果一致。结论北京市规模化养殖蛋鸡弯曲菌感染率较高,饲养时间较短的肉鸡未发现弯曲菌感染。
- 刘夏阳闫革彬顾一心张慧芳何利华肖迪刘红莹张建中张茂俊
- 关键词:肉鸡弯曲菌荧光定量PCR
- 幽门螺杆菌CagA抗原性多态性分析被引量:2
- 2001年
- 目的 了解我国幽门螺杆菌CagA抗原性的多态性 ,为临床血清学诊断CagA阳性菌株感染提供实验依据 ,以及是否存在特定胃十二指肠疾病相关的CagA抗原性型提供线索。方法 采用Westernblots方法 ,比较 38株我国幽门螺杆菌分离株的CagA与 3种不同胃肠疾病分离株兔免疫血清的反应强度。分析不同抗原性类型CagA与疾病的关系。结果 任何一种血清均不能识别所有CagA ,但任一CagA至少可被一种血清识别 ,多数菌株CagA的抗原性与CAPMN6 2接近 ;抗原性与NCTC116 37接近的CagA可能与消化性溃疡相关 ,但不显著。结论 我国不同幽门螺杆菌菌株CagA抗原性存在明显多态性 ,血清学方法诊断CagA阳性菌株感染时应至少使用 3种抗原或抗体 ,不同抗原性类型CagA与胃十二指肠疾病的关系有待进一步研究。
- 周建嫦张建中徐采朴何利华张茂俊盛涛郭浩岩
- 关键词:幽门螺杆菌CAGA抗原多态性胃粘膜萎缩
- 2015-2017年北京市顺义区食源性疾病监测腹泻病例霍乱弧菌感染及病原学特征分析被引量:8
- 2019年
- 目的研究食源性疾病监测腹泻患者霍乱弧菌感染特点及病原学特征,为科学防控和临床治疗提供依据。方法从2015-2017年北京市顺义区腹泻监测病例的粪便标本中分离培养霍乱弧菌,针对分离菌株进行毒力基因聚合酶链式反应(PCR)检测、脉冲场凝胶电泳(PFGE)、基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)图谱分析以及抗生素敏感性分析。结果 2015-2017年,共收集1 105例腹泻患者,霍乱弧菌的检出率为0.54%(6/1 105),霍乱毒素基因ctxAB均为阴性,血清学分型为非O1/O139型,其中5株霍乱弧菌携带Ⅲ型分泌系统毒力基因。菌株PFGE聚类分析结果和MALDI-TOF MS图谱聚类结果具有较好的一致性。结论霍乱弧菌流行强度不高,但其感染和病原学监测工作应在食源性疾病监测体系中得到重视。
- 何牧张爽张彦春王彦波朱美娟张茂俊李颖
- 关键词:霍乱弧菌食源性疾病耐药脉冲场凝胶电泳
- 一起产气荚膜梭菌食物中毒事件的实验室检测分析被引量:7
- 2020年
- 目的应用3种方法对一起食物中毒事件中的可疑样品进行检测和结果分析。方法应用实时荧光PCR、数字PCR和平板计数培养法检测食物中毒事件中的可疑食品盐水猪肝,并对分离菌株用脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分型。应用细菌生化试验、实时荧光PCR鉴定可疑食品中的产气荚膜梭菌;应用数字PCR对毒力基因进行绝对定量。结果可疑食品产气荚膜梭菌平板计数值为4 400 000 CFU/g,并分离到22个产气荚膜梭菌单菌落,实时荧光PCR检测可疑食品样本产气荚膜梭菌plc和cpe基因阳性,其中3个菌落plc+/cpe+,19个菌落plc+/cpe-;数字PCR检测可疑食品样本plc基因绝对定量值为1 064拷贝/μl;22个单菌落分为2种PFGE带型。结论通过3种方法检测可疑食品中产气荚膜梭菌,说明该起食物中毒可能由产气荚膜梭菌导致。
- 冀国强李颖张爽吕金昌张赫马红梅逄波逄波
- 关键词:产气荚膜梭菌食物中毒实时荧光PCR
- 利用基因芯片技术分析空肠弯曲菌的遗传特征被引量:1
- 2016年
- 目的为分析我国弯曲菌遗传特征,本研究根据已发表多株弯曲菌的全基因组测序特征及比对结果自行设计基因芯片,利用芯片对我国不同宿主来源菌株进行遗传特异性分析。方法根据前期基因组水平比对分析的结果,利用Combimatrix tiling Custom ArrayTM90K芯片,设计DNA芯片。芯片包含已测序菌株ICDCCJ07001、269.97、NCTC11168、81-176、81-116和RM1221共3384个CDS的探针序列,以及空肠弯曲菌耐药及致病性相关2个质粒共80个CDS的探针序列,与脂寡糖的合成相关基因簇16种共219个CDS的探针序列、荚膜多糖合成相关基因簇7种共160个CDS的所有序列。对我国不同宿主来源27株分离菌株提取DNA,利用芯片进行杂交,获得杂交信息并分析不同菌株CDS分布特征分析及聚类特点。结果中国菌株的主要变异区域主要存在于与脂寡糖、荚膜多糖合成相关的基因簇、鞭毛修饰相关的基因簇、DNA限制/修饰相关的基因簇以及空肠弯曲菌Mu样噬菌体基因簇。基因组水平不同来源菌株CDS分布的聚类结果没有发现显著的宿主归因特点,但GBS相关菌株脂寡糖合成相关基因组成具有共性特征。结论通过验证以及与过去研究的比较,本次研究中的基因芯片技术结果准确可信,本研究所用基因芯片在分析空肠弯曲菌基因多态性方面具有很好的优势,可用于弯曲菌遗传特征和重要毒力因子的分析和检测。
- 梁昊刘红莹尤元海顾一心张艾煜王敏何利华孟凡亮张建中张茂俊
- 关键词:空肠弯曲菌基因芯片
- 空肠弯曲菌多重聚合酶链反应基因鉴定及其毒力相关基因分析被引量:24
- 2007年
- 目的建立空肠弯曲菌、结肠弯曲菌多重聚合酶链反应(m-PCR)鉴定方法,并对菌株毒力相关基因cadF、virB11、flaA、cdtA、cdtB、cdtC的分布进行初步分析。方法利用m-PCR的方法对经过传统生物化学方法鉴定的65株弯曲菌进行鉴定,并通过空肠弯曲菌特异基因hipO、结肠弯曲菌glyA基因特异片段的PCR扩增对鉴定的结果进一步验证;利用特异引物PCR方法初步分析其毒力、毒素相关基因cadF、virB11、flaA、cdtA、cdtB和cdtC的分布。结果m-PCR扩增结果发现65株不同来源的弯曲菌,42株为空肠弯曲菌,23株为结肠弯曲菌。hipO、glyA基因PCR扩增结果与m-PCR扩增结果一致。16.9%菌株PCR鉴定结果与传统的生物化学鉴定结果不一致。100%(65/ 65)菌株cadF、flaA基因阳性,并且PCR扩增片段大小一致。virB的阳性率为10.8%(7/65),其中空肠弯曲菌阳性率11.9%(5/42),结肠弯曲菌阳性率为8.7%(2/23)。空肠弯曲菌、结肠弯曲菌cdtA的阳性率分别为100%(42/42)和78%(18/23);空肠弯曲菌cdtB扩增的的阳性率为97.6%(41/42)。而23株结肠弯曲菌扩增结果均为阴性;空肠弯曲菌、结肠弯曲菌cdtC的阳性率皆为100%,但PCR扩增产物大小不一致,空肠弯曲菌为555 bp,结肠弯曲菌约为465 bp。结论m-PCR的方法可以有效的对空肠弯曲菌和结肠弯曲菌进行属内分型。中国菌株细胞溶涨毒素基因簇cdt基因的特征与文献报道国外菌株存在差异。
- 张茂俊顾一心冉陆张建中
- 关键词:空肠弯曲菌多重聚合酶链反应毒力