刘菁
- 作品数：32 被引量：118H指数：6
- 供职机构：福建省疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：福建省科技创新平台建设项目福建省自然科学基金国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学农业科学更多>>
- COI基因DNA条形码技术在福建省蜱类鉴定中的应用被引量：8
- 2020年
- 目的探讨基于线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(COI)基因的DNA条形码技术应用于福建省蜱类鉴定的可行性。方法蜱标本经形态学鉴定后提取基因组DNA,PCR扩增COI基因片段,并进行测序和比对,用Kimura-2-parameter模型计算种内及种间遗传距离,以邻接法构建系统发育树。结果经形态学鉴定,97只蜱隶属于5属12种,遗传距离计算结果显示,种间遗传距离(14.65%~26.79%)显著大于种内遗传距离(0~7.14%);BLAST同源性比对发现GenBank数据库中尚无越原血蜱(Haemophysalis Yeni)与基刺硬蜱(Ixodes spinicoxalis)的COI基因序列,褐黄血蜱(H.flava)、台岛血蜱(H.formosensis)、豪猪血蜱(H.hystricis)、粒形硬蜱(I.granulatus)、微小扇头蜱(Rhipicephalus microplus)与血红扇头蜱(R.sanguineus)的形态学鉴定与DNA条形码鉴定结果一致,但是,龟形花蜱(Amblyomma testudinarium)、台湾革蜱(Dermacentor taiwanensis)、中华硬蜱(I.sinensis)的形态学鉴定与COI基因DNA条形码鉴定结果不一致;系统发育树显示,同一物种的不同个体均形成高支持率的单系,种间分支很明显。结论COI基因DNA条形码测定是一种快速准确的蜱类鉴定新兴技术,但现阶段,COI基因DNA条形码技术尚不能完全脱离传统的形态学鉴定而独立进行,两者应有机结合。
- 周淑姮肖方震刘维俊刘菁韩腾伟邓艳琴
- 关键词：COI基因蜱类DNA条形码技术分子鉴定系统发育
- 武平县2018—2020年鼠类感染钩端螺旋体监测结果分析被引量：2
- 2022年
- 目的 分析2018—2020年武平县鼠类钩端螺旋体感染状况,为当地钩端螺旋体病防控提供科学依据。方法笼日法捕获鼠类动物,显微镜凝集试验检测鼠血清中特异性抗体并进行血清群分型,实时荧光定量PCR法检测鼠肾组织中钩体病原的携带状况。结果 2018—2020年武平县共捕获鼠类动物428只,优势鼠种为黄毛鼠、针毛鼠和黄胸鼠;检测鼠血清180份,阳性率为43.89%,不同年份阳性率差异无统计学意义(χ^(2)=1.063,P=0.588)。爪哇群为主要菌群,占82.28%;实时荧光定量PCR共检测鼠肾标本150份,其中阳性鼠肾66份,阳性率为44.00%,不同年份核酸阳性率差异无统计学意义(χ^(2)=1.939,P=0.379)。共分离6株钩端螺旋体菌株,均为爪哇群,检出率为2.09%。结论 武平县鼠类动物间存在钩端螺旋体病流行,优势鼠种病原携带率高,血清抗体水平呈上升趋势,应进一步加强钩端螺旋体病的防控工作。
- 刘维俊何嘉春肖方震刘菁曾志伟徐国英
- 关键词：钩端螺旋体鼠类自然疫源性疾病
- DNA条形码技术在福建省大田县山地生境中鼠种调查的初步应用被引量：1
- 2019年
- 目的探讨和应用基于COI的DNA条形码技术对福建省大田县野外生境进行鼠种调查。方法采用笼夜法在大田县境内捕鼠,对捕获鼠进行形态学鉴定后,经肝脏组织核酸提取、目标条带COI基因片段的扩增及测序获取序列信息,通过同源性比对、遗传距离分析和系统进化树构建对所捕获的野栖鼠进行准确鉴定。结果本次调查共捕获24只野栖鼠,经形态学鉴定青毛鼠14只、板齿鼠6只、白腹巨鼠3只、黄毛鼠1只。经DNA条形码技术鉴定,其中青毛鼠13只、板齿鼠6只、白腹巨鼠4只、大足鼠1只。各鼠种种内遗传距离为0.00%~0.21%,种间遗传距离为13.24%~18.03%,种间遗传距离显著高于种内遗传距离。DNA条形码技术鉴定结果与形态学鉴定结果存在2份标本的差异,经再次鉴定,更正了形态学鉴定结果。结论DNA条形码技术可作为形态学鉴定方法的补充,应用于鼠种调查和分析中。探讨和应用基于COI的DNA条形码技术对大田县山地生境进行鼠种调查。
- 刘维俊徐国英肖方震林代华刘菁韩腾伟
- 关键词：DNA条形码
- 福建省2010—2019年黄胸鼠及其体表染蚤情况调查被引量：2
- 2020年
- 目的调查分析福建省黄胸鼠及其体表染蚤情况,为鼠疫防控提供依据。方法采用描述性流行病学方法,对福建省2010—2019年黄胸鼠及其体表印鼠客蚤监测数据进行分析。结果2010—2019年黄胸鼠年均密度为1.8%,黄胸鼠占32.2%,其印鼠客蚤指数为0.6。各地区的鼠密度和染蚤指标均低于动物鼠疫Ⅳ预警值;各年监测月份黄胸鼠鼠密度0.7%~3.2%,总体上以5、6月稍高,10月稍低,黄胸鼠占18.6%~60.5%,均无明显波动;染蚤率为3.3%~40.6%,黄胸鼠印鼠客蚤指数为0.0~1.1,各年波动接近,总体上5、6月较高,9、10月较低;鼠、蚤材料检测结果均为阴性。结论福建省2010—2019年黄胸鼠鼠密度及其印鼠客蚤指数,均低于动物鼠疫Ⅳ级预警的预警值,发生动物鼠疫的风险低,但存在输入性风险,仍需提高警惕加强鼠疫防控。
- 王加熊周淑姮林代华刘菁肖方震邓艳琴
- 关键词：印鼠客蚤鼠疫黄胸鼠
- 福建省2004-2018年人间布鲁氏菌病疫情特征及防控对策被引量：5
- 2020年
- 目的分析福建省布鲁氏菌病(布病)疫情趋势,为制定有效防控对策提供依据。方法用描述性流行病学方法,对福建省2004-2018年报告的布病病例进行流行特征分析。结果 2004-2010年报告布病15例,年均发病率0.006/10万。2011-2018年病例大幅上升,报告496例,年均发病率0.163/10万,其中2015年病例达高峰,报告104例,年发病率0.2733/10万;南平市和漳州市年均发病率较高;每年各月均有病例,4~8月为发病高峰;农民病例最多(52.1%);发病年龄主要在30~60岁组(78.7%);男女性别比为2.6∶1。病羊、病猪是布病的传染源,传播途径以直接接触染疫动物或其产物而感染,或食用污染羊奶通过消化道感染。结论福建省县(市、区)有报告布病者占85.2%(75/88),疫情呈上升趋势,闽西北及闽东南局部地区疫情较严重。应建立联防联控机制,进行高危人群职业活动干预和健康教育,加强牲畜流通环节的检疫和管理,消灭传染源,是当前布病防控的重点措施。
- 林代华韩腾伟肖方震王加熊刘菁刘维俊邓艳琴
- 关键词：布鲁氏菌病疫情分析防控对策
- 2020年福建省恙虫病流行特征分析被引量：3
- 2022年
- 目的分析福建省2020年恙虫病流行特征,为恙虫病的预防和控制提供理论依据。方法从中国疾病预防控制信息系统收集福建省2020年报告的恙虫病病例信息,采用WPS Office 2016和SPSS 20.0对恙虫病的时间、地区和人群分布进行统计分析。结果2020年福建省共报告恙虫病病例1317例,发病率为3.17/10万,死亡病例1例。发病高峰在6-10月,报告病例前三位的地市(漳州市、南平市、龙岩市)占病例总数的77.37%。发病数男女性别比为1.07∶1,发病年龄集中在40~<70岁(76.01%),以50~<60岁年龄段最多(31.44%)。职业以农民为主(76.92%)。结论福建省恙虫病流行具有明显的季节性和地域集中性,应加强对重点人群和重点地区的日常监测,采取干预措施,控制恙虫病发生和流行。
- 曾志伟韩腾伟刘维俊刘菁周淑姮徐国英王加熊肖方震
- 关键词：恙虫病发病率
- 福建省鼠类携带新埃立克体调查及16S rRNA和groEL基因特征研究被引量：2
- 2020年
- 目的调查福建省鼠类携带新埃立克体情况,了解福建新埃立克体的16S rRNA和groEL基因特征。方法在福建省5个市15个县(市、区)采用笼日法捕鼠,心脏采血,PCR扩增新埃立克体的16S rRNA基因和groEL基因,纯化、测序后进行序列比对分析。结果福建省鼠中新埃立克体阳性率为6.67%,福州、南平、三明和宁德4个市的8个县检出新埃立克体,以三明市阳性率较高,为12.21%;其次为南平、宁德市和福州市分别为6.61%、5.56%和3.51%。黄胸鼠、褐家鼠、板齿鼠和黄毛鼠均有新埃立克体检出,其中野鼠阳性率为9.40%,以板齿鼠阳性率较高,为23.53%;家鼠阳性率为4.28%,以黄胸鼠阳性率较高,为6.94%。家鼠和野鼠阳性率差异有统计学意义(P<0.05)。影响鼠类感染新埃立克体的因素为鼠龄和生境。序列分析显示福建省鼠感染新埃立克体的16S rRNA和groEL基因序列高度一致。结论福建省鼠类新埃立克体感染普遍,且基因序列高度同源。属新埃立克体的自然疫源地,可为福建省新埃立克体病的防治提供基础资料和参考。
- 肖方震邓艳琴林代华韩腾伟徐国英刘菁刘维俊
- 关键词：鼠类基因特征
- 南平市啮齿动物蜱传病原体检测及复合感染研究
- 2022年
- 目的了解南平市啮齿动物监测点中蜱传病原体的种类及复合感染情况,为蜱传疾病防制提供依据。方法用笼夜法于2015—2020年对南平市7个监测点进行捕鼠。用PCR方法对鼠标本进行伯氏疏螺旋体、巴尔通体、新埃立克体、巴贝虫和无形体相关基因片段检测。结果捕获331只鼠,病原体感染率:巴尔通体13.6%(45/331)、无形体4.2%(14/331)、新埃立克体3.9%(13/331)、巴贝虫2.4%(8/331)、伯氏疏螺旋体1.5%(5/331),复合感染率4.5%(15/331)。结论南平市啮齿动物中存在巴尔通体、无形体、新埃立克体、巴贝虫和伯氏疏螺旋体感染及复合感染,该调查可为南平市蜱媒传染病的防控提供参考。
- 曾志伟周淑姮韩腾伟刘维俊刘菁徐国英王加熊邓艳琴肖方震
- 关键词：啮齿动物巴尔通体无形体伯氏疏螺旋体
- 福建省2014―2020年恙虫病流行特征和时空聚集性被引量：1
- 2023年
- 目的分析福建省2014―2020年恙虫病流行特征和时空聚集性,为制定防控策略提供依据。方法收集福建省2014―2020年通过中国疾病预防控制信息系统报告的恙虫病病例信息,采用WPS 2016、SPSS 20.0、ArcGIS 10.0、SaTScan 9.5等软件进行数据处理和统计分析,探索时空分布特征。结果2014―2020年福建省共报告恙虫病病例8595例,年均发病率为3.03/10万,病例主要集中在6―10月,病例集中于40~<70岁(73.10%),职业以农民为主(73.30%)。年均发病率最高的地区是南平市11.71/10万,发病率居前的县区为平和县(36.71/10万)、光泽县(31.28/10万)。时空扫描显示最大可能聚集区多达10个,以平和县为中心覆盖了6个县区。结论福建省恙虫病发病存在一定的时空聚集性,应加强对重点人群和重点地区的日常监测和病原检测工作,降低福建省恙虫病发病水平。
- 曾志伟祝寒松韩腾伟刘维俊刘菁肖方震周淑姮徐国英戴彦良王加熊
- 关键词：恙虫病
- 2019年福建省汉坦病毒分离株全基因组序列测定及分析
- 2022年
- 目的从分子水平分析2018—2020年福建省汉坦病毒(HV)分离株的型别,为疾病的预防控制提供实验依据。方法采集2018—2020年福建省肾综合征出血热(HFRS)急性期患者血清及监测点鼠肺标本。采用胶体金法检测血清样本中HV的IgM、IgG抗体,采用免疫荧光法检测鼠肺样本中HV抗原,阳性样本接种E6细胞分离病毒,用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)方法检测标本培养物上清,免疫荧光检测培养细胞以鉴定HV。采用高通量测序技术对分离株进行全基因组测序,MEGA 11.0软件对其进行序列比对和进化分析。结果捕获鼠形动物879只,阳性率为2.84%。分离得到2株病毒,均来自黑线姬鼠。基因组序列分析显示为汉滩病毒(HTNV)。采用最大似然法构建系统发育树中,所分离病毒株形成独立支系,与LongquanAa-10-101、Z251、LongquanMf-08-92等浙江地区HV分离株基因组核苷酸序列一致性较高,约为95.81%,聚集形成一个分支。氨基酸序列比对分析显示,所分离株与疫苗株Z10核蛋白相比,存在Thr43Ala、Lys95Met突变;与HTNV国际标准株76-118和疫苗株84FLi相比,缺少一个第N766位的糖基化位点。结论本研究提示福建地区流行HV具有独特基因特征,与浙江地区HV分离株具有较近的亲缘关系,可能源自共同进化的祖先,所分离病毒包膜糖蛋白和核衣壳蛋白的氨基酸变异所造成的影响,值得进一步关注和研究。
- 刘菁陈阳韩腾伟刘维俊曾志伟林文王加熊林代华肖方震
- 关键词：肾综合征出血热汉坦病毒基因组系统发育树
