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任洁: 作品数：19 被引量：145H指数：7; 供职机构：北京市农林科学院玉米研究中心更多>>; 发文基金：国家科技支撑计划北京市科委科技计划项目北京市农林科学院科技创新能力建设专项更多>>; 相关领域：农业科学生物学更多>>

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植物DNA数据库管理系统的开发与应用: 【研究背景】DNA指纹的高变异性和稳定性可以用来鉴定个体,这在植物育种中具有重要价值。DNA指纹数据库是植物分子研究必不可少的重要工具,因为它为作物育种、品种质量控制、品种权保护和分子标记辅助育种提供了强大的技术和信息支...; 江彬赵怡锟易红梅霍永学吴昊天任洁葛建镕赵久然王凤格; 关键词：SSR 数据库 DNA指纹基因分型; 文献传递

基于叶绿体InDel标记对玉米杂交种正反交的鉴定被引量：4: 2018年; 玉米的正反交杂交种在有些表型性状上存在差异,在有些品种中甚至直接影响总体产量。为了避免之前的鉴定正反交方法在取样类型和时间上存在的一定的局限性,本研究以玉米叶绿体基因组Insertion/Deletion(In Del)标记为基础开发引物,使用玉米叶片材料进行检测。结果显示CPMIDP01和CPMIDP03两个位点可分别鉴定玉米杂交种郑单958和京科968的正反交组合,并可组合成效果稳定的二重PCR,从而得到一种对玉米正反交种的快速鉴定方法。此方法可应用于中国主要玉米品种正反交鉴定中,作为核基因组检测的补充,进一步完善品种真实性及品系溯源信息。; 王蕊于倩倩田红丽许理文晏朋涛易红梅薛宁宁葛建镕董文攀杨扬任洁王璐周世良赵久然王凤格; 关键词：INDEL 叶绿体玉米杂交种毛细管电泳

基于农艺及品质性状与SSR标记的青贮玉米品种遗传多样性分析被引量：8: 2021年; 青贮玉米是优质饲料作物,对畜牧业的大力发展具有重要意义。为了探究青贮玉米品种的遗传多样性现状,以141个通过国家及各省区(市)审定的青贮玉米品种为材料,基于农艺及品质性状与SSR标记从生态区角度对供试品种进行遗传多样性分析。结果表明,13个农艺及品质性状的变异系数区间为10.30%~30.31%,平均为16.01%;多样性指数区间为0.50~0.71,平均为0.60。农艺及品质性状聚类将供试品种划分为5个组,同一生态区来源的品种多归为同一组。40个SSR标记共检测到482个等位变异,平均每个位点12.05个,多态性信息含量(polymorphism information content,PIC)变幅为0.27~0.89,平均为0.68。南方品种大部分聚集在同一组,与东华北、黄淮海和西北品种间的遗传距离均较远,分别为0.054、0.047和0.046。两种方法分析结果具有共性,但也存在一定的差异,南方品种在农艺及品质性状和SSR标记上均具有特异性,西北和黄淮海品种仅在农艺及品质性状具有特异性。将两种方法相结合,能更全面、准确的了解青贮玉米品种的遗传背景,为不同生态区新品种选育及推广种植提供依据和参考。; 刘少荣杨扬田红丽易红梅王璐康定明范亚明任洁江彬葛建镕成广雷王凤格; 关键词：青贮玉米审定品种 SSR标记

中国玉米品种保护现状分析被引量：12: 2020年; 【目的】植物新品种保护制度可以维护育种者的合法权益,推动种子产业化和发展现代种业,进而促进农业发展和保障国家粮食安全。通过分析中国玉米品种保护信息,掌握中国植物新品种保护工作在玉米(Zea mays L.)物种开展情况,并从知识产权角度了解中国玉米种业的现状。【方法】通过品种权公告等资料搜集、整理和校验,将玉米品种保护分为9种状态进行统计,最后汇总为一张表格代表了20年来植物新品种保护的玉米品种信息。【结果】1999-2018年,植物新品种保护接受申请的玉米品种数为7570个,获得授权的玉米品种数为3609个,其中,申请的杂交种与自交系比例为1.33﹕1、授权的杂交种与自交系比例为1.88﹕1。截止到2018年年底,处于申请保护阶段的玉米品种数为3060个,处于授权保护阶段的玉米品种数为2448个,处于撤销申请阶段的玉米品种数为901个,处于终止阶段的玉米品种数为1161个,其中,授权品种的审查时长平均为3.9年。1340个单位或个人作为申请人提交过玉米品种保护申请,其中,种业公司和科研院所分别占65.0%和28.4%;739个单位或个人作为品种权人获得过玉米品种权保护,种业公司和科研院所分别占59.7%和33.9%;申请人和品种权人最多的省份均为北京市,江西省、青海省、西藏自治区、香港、澳门和台湾省没有出现申请人和品种权人。【结论】玉米是中国植物新品种保护申请和授权数量最多的物种。在时间上,玉米品种保护申请的变化趋势分为起步、平稳、井喷3个时期,玉米品种授权的变化趋势分为不稳定、高峰、低谷和稳增4个阶段;在空间上申请人和品种权人主要集中于东北、华北及黄淮海地区。申请和授权的品种类型虽然以杂交种为主,但自交系的重视程度在逐年提升。种业公司是申请人和品种权人的主体,但科研院所的平均授权效率最高。总体上,育; 杨扬田红丽易红梅刘亚维任洁王蕊王璐赵久然王凤格; 关键词：玉米植物新品种保护品种数

植物品种SSR指纹分析专用软件SSR Analyser的研发被引量：16: 2018年; 【目的】开发适用于植物品种SSR指纹分析的软件工具,实现植物品种SSR指纹分析的自动化和标准化,解决SSR标记在实际应用中存在的数据采集效率较低、数据共享难度较大等问题。【方法】在商业化软件Gene Marker?的基础上,针对植物品种SSR指纹分析的特殊性,在SSR指纹处理、panel设计、数据库对接等方面进行算法开发或优化,形成植物品种定制化软件SSR Analyser,并在玉米等多种作物上测试其分析效果。【结果】在SSR指纹处理功能上,软件通过先用系统计算的矩阵进行弱消除,再用Pull-up峰匹配算法进行单峰消除的方案实现了对Pull-up峰准确自动消除;通过优化N+1峰、连续多峰等特殊峰型读取的算法,解决了特异峰不识别、读不准、误读等问题,对2 bp重复类型SSR标记为主的植物品种指纹采集更加精准;通过完善邻峰过滤、高低峰过滤和二倍体过滤算法,解决了植物品种混合样品的有效峰采集问题。在Panel设计功能上,软件兼顾了Panel设计的灵活性、方便性和统一性,在保证数据采集标准化的前提下,更加适应复杂的试验情况:提高了标记参数设置的灵活性,根据不同参数作用范围,标记参数设置既有针对特定物种、Panel一次性固定设置的参数,也有针对每个引物位点、每块电泳板单独设定或微调的参数;实现了从已有标记中快速重新组合形成新Panel的功能;保证了Panel的统一调用和同步更新。通过将软件与指纹库管理系统的无缝对接,实现了样品准备到指纹采集全流程的自动化、标准化,形成的指纹库具有直观可追溯的优势。将SSR Analyser在玉米大规模建库中试用,表明该软件的指纹分析更加简单高效,比原软件分析效率提高了10倍以上;将SSR Analyser扩大到水稻、大豆、黄瓜、西瓜、大白菜等多种二倍体作物和小麦、棉花等多倍体作物中试用,表明在二倍体作物上使用效果较�; 王凤格李欣杨扬易红梅江彬张宪晨霍永学朱丽葛建镕王蕊任洁王璐田红丽赵久然; 关键词：植物品种 SSR DNA指纹软件开发

DNA指纹技术在玉米区域试验品种真实性及一致性检测中的应用被引量：4: 2016年; DNA指纹技术在玉米区域试验品种管理中具有重要应用价值。中国自2002年起开始开展玉米区域试验品种真实性和一致性检测工作,截至2014年底,已累计检测国家及各省玉米区域试验品种15 596份。十多年来玉米区域试验品种DNA指纹检测规模不断扩大,检测技术不断提升,真实性和一致性问题得到有效控制。本文回顾了中国玉米区域试验品种DNA指纹检测的发展历程,总结了玉米区域试验品种DNA指纹检测的发展规律,分析了区域试验、审定、品种权保护及种子质量管理之间的协调和衔接情况,最后对玉米区域试验品种DNA指纹检测中面临的新品种的判定标准、区域试验品种的命名及标准样品的留取等问题进行了深入探讨。; 王凤格易红梅赵久然孙世贤杨国航任洁王璐; 关键词：玉米 DNA指纹品种区试品种管理

玉米杂交种纯度鉴定SNP 核心引物的确定及高通量检测方案的建立被引量：10: 2021年; 纯度是玉米种子质量的重要指标之一,尤其杂交种自交株是影响田间产量的关键因素。KASP(kompetitive allele specific PCR)技术具有高通量、低成本的优点,适用于种子纯度检测。本研究基于12套杂交种及其父母本的三联体样本及335份玉米杂交种国家审定标准样品SNP指纹,从384个SNP基础位点筛选获得60个候选位点,位点转化为KASP引物的成功率为95%。综合考虑引物双亲互补率、多态性、稳定性和分型效果等多项指标,最终确定20个引物作为玉米杂交种纯度鉴定的核心引物,能够有效鉴定99.7%供试样品纯度。对于待测样品京科968通过SNP-DNA指纹数据库查询,并选择双亲互补型引物进行纯度鉴定。在检测的110个个体中,共检出1个自交苗和2个异型株,纯度为97.3%。同时,基于纯度核心引物对批量样品检测建立高通量纯度检测方案,具有快捷、准确、高通量和低成本的特点,为政府监管和企业提供了更多纯度鉴定方案的选择。; 王蕊施龙建田红丽易红梅杨扬葛建镕范亚明任洁王璐陆大雷赵久然王凤格; 关键词：纯度 SNP 玉米杂交种核心引物

308个糯玉米审定品种SSR标记遗传多样性分析被引量：14: 2022年; 随着中国糯玉米产业的蓬勃发展,每年通过审定的糯玉米品种逐渐增多,为了解其育成品种的遗传多样性和亲缘关系,本研究以308个糯玉米审定品种为材料,利用SSR标记从审定年份和适宜种植区2个角度分析近年来糯玉米审定品种遗传多样性特点和发展趋势。结果表明,308份糯玉米审定品种在40个SSR标记上共检测出529个等位基因、1480种基因型,PIC变幅为0.226~0.890,平均为0.684。从审定时间看,各年份间审定品种的遗传多样性指数波动不大,其中2015年审定品种的遗传多样性最高,为0.720。从适宜种植区看,西南区审定品种的PIC值最高,遗传距离分析表明西南区和另外3个适宜种植区有着最远的遗传距离,平均为0.0217;聚类分析结果显示,西南区部分品种聚集为一组,表现出一定的地域特色。聚类分组中以京科糯2000为代表的第Ⅲ组品种数目最多(122个,东南区占比59.0%),且在主坐标图中独立分布,表明优良品种的出现及其杂优模式的推广能够丰富和拓宽品种的遗传多样性,为糯玉米新品种改良提供导向作用的同时推动糯玉米产业的发展。; 杨扬仇律雯田红丽易红梅卢柏山王璐范亚明史亚兴任洁葛建镕徐丽陆大雷赵久然王凤格; 关键词：糯玉米审定品种 SSR标记

玉米品种京科968纯度鉴定引物的确定被引量：6: 2017年; 为了确定一套京科968玉米品种纯度鉴定的引物组合,本研究从现有的玉米40对SSR引物中根据多态性、等效扩增、染色体分布挑选出15对候选引物。综合考虑多重电泳,对扩增产物片段大小相差10 bp以下的10对引物分别进行非荧光和荧光标记毛细管电泳;对扩增产物片段大小相差10 bp以上的引物跑琼脂糖凝胶电泳。最终根据三种电泳方式确定了相对应的纯度鉴定引物组合。此套纯度鉴定组合适于京科968玉米品种的纯度鉴定。并为其他玉米大品种的纯度鉴定提供了思路、尤其是对主要经营一些玉米大品种的企业尤为适用。; 冯博许理文王凤格蔚荣海易红梅刘文彬葛建镕田红丽侯振华王璐任洁王元东赵久然; 关键词：纯度鉴定分子标记

利用DNA指纹技术进行玉米自交系类群划分新方法——遗传背景分析法被引量：6: 2003年; 对52个待测玉米自交系和15个对照自交系进行DNA指纹分析,计算待测玉米自交系与各类群对照自交系之间的遗传距离,不用聚类分析方法,直接根据遗传距离进行类群划分,结果表明,与传统的聚类分析方法相比,遗传背景分析方法是十分有效的玉米自交系类群划分新方法,将52个玉米自交系主要分为5大类群,即瑞德群,黄改群,P群,旅大红骨群和兰卡斯特群,未发现新的优势类群,除了自交系黄C以外,其他所有玉米自交系的类群划分结果与系谱来源相吻合,并指出黄C属于瑞德群。; 郭景伦赵久然王元东段民孝邢锦丰王继东张静梅任洁; 关键词：DNA指纹技术玉米自交系类群划分

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