孙德福
- 作品数：3 被引量：1H指数：1
- 供职机构：山东师范大学物理与电子科学学院更多>>
- 发文基金：山东省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：理学生物学更多>>
- 两种雌激素受体与抑制剂作用的机制
- 2011年
- 对雌激素受体ERα和ERβ与抑制剂244结合的体系进行了12 ns的分子动力学模拟,用MM-PBSA方法计算了体系的结合自由能,抑制剂与ERα的结合自由能是-30.11 kJ/mol,与ERβ的是-33.32 kJ/mo。lERα中Met421侧链原子与抑制剂间的静电排斥作用使活性口袋周围的残基构象发生变化,导致活性区域中结合空穴变大,从而使ERα与抑制剂的亲和性降低。自由能分解计算进一步说明了各个残基对自由能的贡献。
- 李龙飞孙德福张少龙张庆刚
- 艾滋病毒蛋白酶异位抑制剂体系的分子动力学研究
- 获得性免疫缺陷综合症(AIDS),即艾滋病,是一种跨种属传播的死亡率很高的疾病,艾滋病主要由Ⅰ型人类免疫缺陷病毒(HIV-1)引起,在艾滋病毒的生命周期中有多种酶起了重要的生化和生理作用,其中受到现代药物开发关注的有三种...
- 孙德福
- 关键词：分子动力学艾滋病毒蛋白酶生物分子
- 艾滋病毒蛋白酶异位抑制剂体系的分子动力学研究被引量：1
- 2012年
- 对艾滋病毒蛋白酶异位抑制剂体系和活性位抑制剂体系进行8 ns的分子动力学模拟,用MM-PBSA方法分别计算了抑制剂与蛋白酶的结合自由能。异位抑制剂体系中抑制剂与蛋白酶的结合自由能为-90.30 kcal/mol,活性位抑制剂体系中为-59.58 kcal/mol。在异位抑制剂体系中分子片段4DX卡在蛋白酶的exo位,使蛋白酶活性位点附近残基的活动范围减小,有利于抑制剂被束缚在活性位点附近。异位抑制剂使体系刚性更强,更稳定,抑制剂与蛋白酶的结合更为牢固。
- 孙德福王加磊张少龙张庆刚张怿慈
