徐德顺
- 作品数：130 被引量：576H指数：11
- 供职机构：湖州市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：湖州市科技计划项目浙江省医药卫生科学研究基金湖州市自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生轻工技术与工程农业科学生物学更多>>
- 湖州市非细菌性急性胃肠炎暴发中诺如病毒的分子生物学特点初步研究被引量：5
- 2011年
- 本文初步研究了湖州市非细菌性急性胃肠炎暴发中检出的诺如病毒的分子生物学特征。收集湖州市2008年和2009年2起非细菌性急性胃肠炎暴发疫情中采集的患者粪便标本,采用荧光定量RT-PCR方法对其进行诺如病毒核酸检测,并对核酸阳性标本进行RNA多聚酶部分区域的RT-PCR扩增。选取阳性扩增产物进行纯化及序列测定,结合诺如病毒GI、GII各基因型参考株进行核苷酸序列遗传进化分析。结果2起疫情均同时检出了GI和GII型诺如病毒。随后对其中4份RNA多聚酶区扩增阳性的标本进行测序及序列分析,结果发现2008年检出的2株GI型诺如病毒均为GI/2基因型;而2009年检出的1株GI型诺如病毒为GI/3基因型,另一株GII型诺如病毒则与近些年欧洲和亚洲相继出现的遗传组GII的新基因型GIIb的各代表株同源性最高,为GIIb基因型。这说明湖州地区流行的诺如病毒存在很高的遗传多样性,并且不同时间流行的基因型也存在一定差异。这也是国内首次在急性病毒性胃肠炎暴发中检出诺如病毒GIIb变异株。
- 纪蕾吴晓芳徐德顺龚黎明
- 关键词：诺如病毒
- 水中病毒浓缩方法研究进展被引量：1
- 2015年
- 全球范围内由病毒污染水源引起疾病暴发事件不断发生。水环境的恶化为水体中病毒提供了良好的栖息场所,水体中致病性病毒的存在严重威胁着人体健康。由于水体中的病毒含量很少,滴度很低,一般很难直接检测到,常常需要预先富集浓缩。为了监测水中的病毒,最好的方法是简单、快速、经济,并且重复性好的方法。因此,许多技术已经被开发和优化,但仍然难以满足检测所有存在于自然界和人造设施的水中相关病毒的需要。
- 陈莉萍徐德顺
- 关键词：超滤
- 浙江省湖州市A(H1N1)pdm09流感病毒耐药基因的变异分析
- 2024年
- 【目的】了解浙江省湖州市2023年A(H1N1) pdm09流感流行株耐药基因变异和遗传进化特征。【方法】收集2家流感监测医院的呼吸道标本进行A(H1N1) pdm09流感病毒核酸检测,阳性标本接种MDCK细胞进行流感病毒分离和测序。应用DNA Star 7.1软件和Mega4.0软件对神经氨酸酶(NA)基因酶活性位点和M2离子通道蛋白(M2蛋白)与耐药相关的氨基酸位点进行分析。【结果】分离株与疫苗株的NA基因核苷酸同源性范围为98.87%~99.22%,氨基酸同源性范围为98.94%~99.36%。M基因核苷酸同源性范围为99.07%~99.85%,氨基酸同源性范围为99.02%~99.94%,分离株和疫苗株同属于6B.1A.5a.2a进化分支。NA基因酶活性中心关键位点氨基酸仍高度保守,与NA抑制剂耐药相关的9个关键氨基酸位点无变异,但部分流行株非酶活性位点发生一些变异。分离株M2蛋白与耐药相关的5个氨基酸位点未发生替换,但第31位氨基酸由丝氨酸变为天冬酰胺。【结论】2023年湖州市A(H1N1) pdm09流行株与世界卫生组织(WHO)推荐的2023—2024年疫苗株有较高的同源性。所有流行株均对金刚烷胺类药物耐药。
- 徐德顺查赟峰卢忠豪
- 关键词：流感病毒基因变异M蛋白神经氨酸酶
- 2019年浙江省湖州市副溶血性弧菌病原学特征分析被引量：10
- 2021年
- 目的了解2019年浙江省湖州市副溶血性弧菌检出株的血清型别、毒力基因携带情况、抗生素敏感性以及分子分型特征。方法收集湖州市2019年分离到的92株副溶血性弧菌阳性菌株,并对其开展血清学试验、毒力基因检测、抗生素敏感试验和脉冲场凝胶电泳分子分型。结果病例源菌株主要血清型为O3∶K6,毒力基因型为tlh^(+)tdh^(+)trh^(-),食品源主要血清型为O2∶Kut,毒力基因型为tlh^(+)tdh^(-)trh^(-)。分离株对氨苄西林有很高的耐药性,耐药率达到90.22%(83/92);其次为庆大霉素和四环素。分子分型显示,经Not I酶酶切后,91株副溶血性弧菌产生81个PFGE带型,相似度达到85.00%以上的克隆系有16个。结论2019年湖州市副溶血性弧菌菌型多样性可能是疾病高发的原因之一。淡水产品和海水产品可能存在交叉污染,需加强相应监管。
- 严伟沈月华徐德顺
- 关键词：副溶血性弧菌病原学特征分子分型
- 通过试剂和消耗性材料管理不符合分析规避检测风险
- 2023年
- 实验室检测工作质量受到人(人员)、机(仪器设备)、料(检测样品、试剂和消耗材料)、法(检测方法)、环(环境条件及设施)、测(测定过程)等诸多因素的影响。作为影响检测结果的因素之一,试剂和消耗性材料种类繁多、使用量大,其质量优劣直接影响检测结果准确性。为此《检验检测机构资质认定能力评价检验检测机构通用要求》(RB/T214-2017)[1]:对检验检测质量有影响的试剂和消耗性材料的控制范围,是否有文件化的验收规定,是否经过检查或验证符合有关标准规范要求之后才投入使用;所使用的服务和供应品(包括消耗材料)是否都符合规定的要求,是否保存了符合性检查活动记录等做出了要求。但实际工作中检测实验室对试剂和消耗材料的管理,在外部评审中是常见的不符合之处[2-3]。主要是机构对评审准则要求的理解存在偏差,特别是试剂和消耗性材料是一个动态管理过程,且购买、使用往往涉及多部门,在管理上存在特殊性。本文就试剂和消耗性材料外部评审中提出的不符合之处进行分析并就规避检测风险进行探讨。
- 杨凤华吴丹青吴益春汤海凤徐德顺曹芳红
- 关键词：试剂风险规避
- 交叉引物恒温扩增结合免疫金标方法检测副溶血性弧菌被引量：2
- 2017年
- 目的用交叉引物恒温扩增技术(CPA)结合免疫金标方法快速检测副溶血性弧菌。方法用加热煮沸方法提取菌株和标本的DNA;对CPA方法进行敏感性和特异性检测,并和荧光定量PCR方法进行比较;并用建立的方法对模拟牡蛎样本进行检测。结果该方法 60℃40 min即可完成反应,且敏感性和特异性高,14株副溶血性弧菌检测结果均阳性;最低检测限为1.8 cfu/ml,模拟样本的检测限达到180 cfu/g。与荧光定量PCR检测结果一致。结论该方法具有检测时间短、扩增效率高、灵敏度高、特异性强、操作简单等特点,特别适合在基层实验室和现场快速检测。
- 吴晓芳韩建康徐德顺朱晓娟陈莉萍卢亦愚
- 关键词：副溶血性弧菌
- 2023年湖州市区pdm09 H1N1流感病毒NA基因特征分析
- 2024年
- pdm09 H1N1流感病毒自2009年爆发引起全球大流行,目前已成为流感流行常见亚型之一[1]。该病毒包含由8个基因片段,其中神经氨酸酶(neuraminidase,NA)是嵌入流感病毒包膜表面的一种重要的功能糖蛋白[2]。主要负责成熟病毒从宿主细胞中释放,在感染下一个宿主细胞进行复制转录,最终使机体出现临床症状和体征[3]。
- 沈樟徐德顺
- 关键词：流感病毒基因变异神经氨酸酶
- 湖州市首例境外输入性基孔肯雅热病例报告
- 2023年
- 基孔肯雅热(CHIK)是基孔肯雅病毒(CHIKV)引起的虫媒传染病,以伊蚊等吸血昆虫为传播媒介,临床表现以发热、关节痛、皮疹为主,人群普遍易感。2008年3月广州报告国内首例输入性CHIK病例[1],2008年12月杭州发现1例输入病例[2],2010年广东省报告本地暴发疫情[3],全国多地陆续发现病例[4]。
- 任飞林张鹏付云郑佳仪刘光涛徐德顺闻栋
- 关键词：基孔肯雅热输入性病例报告输入病例吸血昆虫虫媒传染病
- 感染性腹泻疫情中诺如病毒的分子流行病学分析被引量：7
- 2011年
- 目的 研究感染性腹泻疫情中诺如病毒的分子流行病学特点.方法 对2008-2010年湖州地区的感染性腹泻疫情标本共119份进行诺如病毒核酸检测,并选取部分阳性扩增产物经序列测定分析诺如病毒的基因型.结果 119份感染性腹泻标本荧光定量PCR检测阳性50份,其中GⅠ型9份,GⅡ型35份,GⅠ和GⅡ混合感染6份.对12份PCR扩增阳性产物进行序列分析显示：5株GⅠ型诺如病毒毒株分属于GⅠ/2和GⅠ/3两种基因型；7株GⅡ型诺如病毒毒株中除1株属于新基因型GⅡb外,其余6株均属于GⅡ/4基因型.结论 诺如病毒是引起湖州地区感染性腹泻疫情最重要的病原菌之一,且湖州地区的诺如病毒存在很高的遗传多样性,同时也存在基因型别的差异.
- 吴晓芳纪蕾徐德顺韩建康沈月华陈莉萍查赟峰汤仁树姚文庭
- 关键词：诺如病毒腹泻流行病学分子
- 大肠杆菌O_(157)∶H_7实时荧光PCR快速检测方法的建立被引量：17
- 2009年
- [目的]利用特异性荧光探针为特点的TaqM an荧光定量PCR技术,建立大肠杆菌O157∶H7污染的快速敏感特异的检测方法。[方法]以大肠杆菌O157∶H7的rfbE基因作为靶序列,设计一对引物和探针,以大肠杆菌O157∶H7菌株提取核酸DNA作为模板,优化引物和探针的浓度比和Mg2+浓度,以大肠杆菌O157∶H7和10种相关细菌考核检测体系的灵敏性、稳定性和特异性。[结果]建立的反应体系在引物和探针的浓度为0.6μmoL/L、0.8μmoL/L,Mg2+浓度为4mmoL/L时,具有良好的特异性和敏感性。在10株相关菌株的检测中,除大肠杆菌O157∶H7出现很好的阳性外,其余菌株均为阴性。在纯菌条件下,定量检测低限为17 cfu/mL。同一样品重复检测3次C t值的变异系数均小于5%。[结论]该方法特异性强,稳定性高,操作简便快捷,适应食品微生物检验发展需要,具有较大的推广及应用价值。
- 徐德顺沈月华程平庆
- 关键词：荧光定量PCRTAQMAN探针
