陈莉萍 作品数:56 被引量:212 H指数:7 供职机构: 湖州市疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 湖州市科技计划项目 浙江省医药卫生科学研究基金 湖州市自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 轻工技术与工程 生物学 农业科学 更多>>
2016年浙江省湖州市急性胃肠炎病例诺如病毒感染状况及其基因型别特征 被引量:8 2018年 目的调查浙江省湖州市急性胃肠炎病例诺如病毒的感染状况、基因型别及其动态变化趋势。方法于2016年采集湖州市食源性疾病主动监测哨点医院的急性胃肠炎病例粪便标本。采用特异性引物探针,应用real-time RT-PCR对标本进行诺如病毒核酸检测。同时对阳性标本衣壳蛋白基因片段进行扩增和测序,结合在线分型工具和序列系统进化分析诺如病毒基因型别。结果 501份急性胃肠炎患者粪便标本检出诺如病毒阳性101份,阳性率20.16%,以GⅡ基因组为主(86.14%);男性检出率为20.75%(50/241),女性检出率为19.54%(51/260),差异无统计学意义。不同年龄段病例均检出诺如病毒,<5岁儿童检出率最高。诺如病毒感染全年均有发生,但6-9月呈低流行状态。2016年湖州市流行的诺如病毒基因型别多样,包括GⅡ.17、GⅡ.4 Sydney_2012、GⅡ.3、GⅡ.13、GⅠ.6、GⅡ.2、GⅡ.6、GⅠ.7共8种基因型别。GⅡ.17和GⅡ.4 Sydney_2012呈月份交替流行。结论湖州市急性胃肠炎病例诺如病毒基因型别多样,且呈交替流行现象,应进一步加强监测各型别诺如病毒在本地的流行范围及型别分布变化情况。 纪蕾 陈莉萍 沈月华 严伟 吴晓芳 徐德顺 朱晓娟 查赟峰关键词:诺如病毒 胃肠炎 基因分型 湖州市食品中副溶血性弧菌污染状况、血清分型及耐药性监测 被引量:5 2010年 目的:了解湖州市食品中副溶血性弧菌的耐药性、血清型和污染状况,初步确定可能污染副溶血性弧菌的高危食品,为防止副溶血性弧菌引起的食源性疾病提供科学依据。方法:采集农贸市场、超市等各类食品,按照GB/T4789-2003方法进行分离鉴定,用API20E试剂条做进一步生化鉴定。用标准血清进行分型,用纸片扩散法进行药敏试验。结果:检测生禽肉、生畜肉、生食水产品、生食蔬菜、熟肉制品、鲜冻水产品及蔬菜沙拉共127件样品,检出副溶血性弧菌17份,检出率为13.39%(17/127),其中生禽肉中检出率最高29.4%。分离的17株副溶血性弧菌属于7个血清群,分别为0:5群占47.06%(8/17)、O:6群占23.53%(4/17)、0:1群、O:2群、O:4群、O:8群、O:11群各占5.89%(1/17)。分离菌株对诺氟沙星、头孢噻肟、环丙沙星、奈啶酸、四环素、复方新诺明、氯霉素、阿米卡星和庆大霉素100%敏感,对头孢噻吩的耐药率达到58.8%。所有菌株对氨苄西林及阿莫西林全部耐药,1株对四环素耐药。结论:湖州市食品中副溶血性弧菌污染率较高,存在安全隐患。同时要防止由耐药菌株引起的爆发流行。 吴晓芳 纪蕾 陈莉萍关键词:副溶血性弧菌 污染 血清分型 耐药性 2008年-2010年湖州市手足口病病原监测分析 被引量:7 2012年 目的:了解湖州市手足口病的感染情况,为制定预防和控制措施提供科学依据。方法:采用荧光定量RT-PCR方法,对2008年-2010年湖州市765份疑似手足口病感染者的疱疹液、咽拭子及粪便标本进行肠道病毒、肠道病毒71型和柯萨奇病毒A16型的核酸检测。结果:肠道病毒通用核酸阳性510例,阳性率为66.67%(510/765)。其中EV71阳性228例,阳性率为29.80%(228/765);Cox A16阳性134例,阳性率为17.52%(134/765);其他EV病毒阳性148例,阳性率为19.35%(148/765)。男女阳性率分别为67.46%(313/464)和65.44%(197/301)。5岁以下年龄组儿童阳性率为67.64%,是感染的主要人群。结论:EV71是引起湖州市儿童手足口病的主要病原,不同性别间EV、EV71及Cox A16的发病率无显著性差异。定期开展手足口病病原学监测,将有助于提出更好的预防和控制措施。 吴晓芳 纪蕾 徐德顺 沈月华 陈莉萍 查赟峰 朱晓娟关键词:手足口病 肠道病毒71型 柯萨奇病毒A16型 一对引物快速检测并区分诺如病毒GI型和GⅡ型的探讨 被引量:5 2013年 目的设计一对引物并利用该引物建立同时检测、区分诺如病毒GI型和GⅡ型的RT.PCR检测方法。方法参照已发表的GI型和GⅡ型诺如病毒全基因组序列,针对其衣壳蛋白基因保守区设计一对引物,提取病毒的RNA,进行RT-PCR扩增,对该方法的特异性及敏感性进行评价,并对临床粪便标本进行检测。结果实验结果表明,该检测方法特异性强,对GI型、GⅡ型诺如病毒、轮状病毒、肠道腺病毒、甲型肝炎病毒进行检测,均无交叉反应;对GI型和GII型诺如病毒核酸的最低检出限分别可达100pg/ml和10pg/ml。对101份临床标本分别用已有的单一RT—PCR方法和本研究建立的RT—PCR方法同时进行检测,结果完全相符。结论本研究建立的RT-PCR方法能利用一对引物同时对GI型和GⅡ型诺如病毒进行快速检测和分型,并且灵敏度高,特异性好,可用于感染性腹泻暴发中诺如病毒的快速检测。 韩建康 吴晓芳 徐德顺 陈莉萍 纪蕾关键词:诺如病毒 逆转录聚合酶链反应 依赖核酸序列的扩增技术在诺如病毒基因检测中的应用 被引量:3 2015年 目的将一种新颖的核酸扩增技术-依赖核酸序列的扩增技术(NASBA)应用于诺如病毒的快速检测与辅助诊断。方法根据NCBI诺如病毒RdRp基因保守序列设计特异性引物,建立NASBA检测方法,同时验证该方法的特异性、灵敏度和重复性,并利用所建立的NASBA检测方法对临床收集的108例病毒性腹泻患者粪便标本进行检测。结果本文建立的NASBA检测方法对诺如病毒具有高度特异性,与轮状病毒等腹泻相关病毒均无交叉反应,反应体系具有很高的稳定性;灵敏度高,即诺如病毒最低检测线为20 pg/μl;检测周期短,NASBA反应在42℃90 min即可进行有效扩增,3 h^4 h即可完成样品中目标基因的筛选。结论本研究应用的诺如病毒NASBA检测方法特异性好、灵敏度高、快速易操作,尤其适用于诺如病毒的日常监测和暴发疫情的应急诊断。 朱晓娟 徐德顺 陈莉萍 吴晓芳 纪蕾 沈月华关键词:诺如病毒 湖州市甲型H1N1流感病毒株的HA基因分析 2011年 目的:研究2010年湖州市甲型H1N1流感分离株(A/Huzhou/2010(H1N1))的HA基因特征。方法:采用MD-CK细胞对患者咽拭子和漱口液标本进行病毒分离,逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒HA基因并进行序列测定,用DNAstar和MegAlign等软件分析处理。结果:湖州市2010年甲型H1N1分离株的HA基因为1739个核苷酸,与湖州市2009年的分离株及WHO2010/2011推荐的甲型H1N1疫苗株相比,没有核苷酸的插入与丢失,氨基酸同源性分别为99.0%和98.9%。进化树分析显示,本次分离株与湖州市2009年的分离株及WHO2010/2011推荐的疫苗株非常相似。结论:甲型H1N1流感分离株的分子生物学特征及变异特征分析,对制定科学有效的防控策略具有重要意义。 陈莉萍 徐德顺 纪蕾 吴晓芳关键词:甲型H1N1流感 HA基因 基因特征 2013-2015年湖州市副溶血性弧菌血清分型及耐药性研究 被引量:6 2017年 目的通过对副溶血性弧菌的血清分群和耐药性检测,了解湖州市副溶血性弧菌血清分型及耐药状况,预防副溶血性弧菌食源性疾病发生,为指导临床合理用药提供依据。方法对2013-2015年湖州市食物中毒及监测水产品中分离的副溶血弧菌用VITEK2全自动微生物分析系统进行耐药性鉴定,血清学检测采用玻片凝集法。结果 206株副溶血弧菌中共检出7个血清群,25个血清型,其中食物中毒分离株以O3:K6为主,占64.3%,水产品分离株血清型分布范围散在。对氨苄西林和阿莫西林的耐药率极高,均达95%以上,头孢唑啉的耐药率分别达66.7%和55.5%,对亚胺培南、氨曲南、左氧氟沙星、萘啶酸、呋喃妥因、环丙沙星、妥布霉素、复方新诺明、氯霉素完全敏感。结论湖州市水产品分离的副溶血性弧菌血清分群多样化,存在一定程度的耐药情况。 朱晓娟 吴晓芳 徐德顺 陈莉萍 纪蕾 沈月华 查赟峰关键词:水产品 副溶血性弧菌 血清分型 耐药性 2011年-2013年湖州市儿童手足口病病原学监测分析 被引量:5 2015年 目的分析湖州市儿童手足口病病原学构成情况,为制定有效的防控策略提供依据。方法收集2011年-2013年湖州市手足口病疑似患者的咽拭子、疱疹液等标本926份,采用荧光定量RT-PCR方法进行肠道病毒(EV)、肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A组16型(COA16)核酸检测,并对部分EV71和COA16核酸阳性标本进行VP1区的序列测定和分析。结果 926份疑似感染者的咽拭子、疱疹液中肠道病毒阳性率为71.1%(658/926),其中肠道病毒71型阳性率为21.0%(194/926),柯萨奇病毒A组16型阳性率为16.2%(150/926),其他肠道病毒阳性率为33.9%(314/926)。VP1区的序列分析和系统进化结果表明湖州地区检出的EV71为C4a基因型,COA16为B1基因型。结论湖州市儿童手足口病2011年-2012年主要以EV71、COA16肠道病毒感染为主,2013年以其他肠道病毒感染为主,加强EV71、COA16肠道病毒的监测,同时要关注其他肠道病毒的型别,更好地预防和控制儿童手足口病。 沈月华 纪蕾 朱晓娟 陈莉萍 徐德顺 吴晓芳关键词:手足口病 肠道病毒 水中病毒浓缩方法研究进展 被引量:1 2015年 全球范围内由病毒污染水源引起疾病暴发事件不断发生。水环境的恶化为水体中病毒提供了良好的栖息场所,水体中致病性病毒的存在严重威胁着人体健康。由于水体中的病毒含量很少,滴度很低,一般很难直接检测到,常常需要预先富集浓缩。为了监测水中的病毒,最好的方法是简单、快速、经济,并且重复性好的方法。因此,许多技术已经被开发和优化,但仍然难以满足检测所有存在于自然界和人造设施的水中相关病毒的需要。 陈莉萍 徐德顺关键词:超滤 依赖核酸扩增技术在轮状病毒检测中的应用 被引量:5 2015年 目的将一种新颖的核酸扩增技术—依赖核酸扩增技术(nucleic acid sequence-based amplification NASBA)应用于轮状病毒的快速检测与辅助诊断。方法根据美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)轮状病毒VP7基因保守序列设计引物,建立NASBA检测方法,进行特异性、灵敏度和重复性试验,以所建立方法和RT-PCR方法同时对108例临床病毒性腹泻患者粪便样本进行检测。结果所建立的NASBA方法对轮状病毒具有较好的稳定性和高度特异性,与诺如病毒等8种腹泻相关病毒均无交叉反应,灵敏度达5μg/L。108份粪便样本中,用RT-PCR方法检出轮状病毒阳性11份,用NASBA方法检出阳性样本13份。结论本研究应用的轮状病毒NASBA检测方法特异、灵敏、快速简便,适用于轮状病毒的日常监测和暴发疫情的应急诊断。 徐德顺 陈莉萍 朱晓娟 吴晓芳 纪蕾 沈月华关键词:轮状病毒