俞雁
- 作品数：28 被引量：80H指数：5
- 供职机构：上海交通大学农业与生物学院上海市兽医生物技术重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划上海市科学技术发展基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生农业科学理学更多>>
- 蛋白质相互作用及互作网络的生物信息学分析被引量：5
- 2009年
- 后基因组时代的最终目标是认识真正执行生命活动的全部蛋白质的表达规律和生物学功能,即蛋白质组学研究。关键的挑战之一就是对蛋白质相互作用网络的研究,将有助于从系统角度加深对细胞结构和功能的认识,并且为新药靶位点的发现和药物设计提供理论基础。目前,用生物信息学的手段来研究蛋白质相互作用网络显示出巨大的优势,主要包括蛋白质相互作用网络的绘制与显示、网络的拓扑结构分析、网络结构模块的研究及网络的比对等。文章试图从生物信息学的角度认识蛋白质相互作用,并总结蛋白质相互作用网络的生物信息学分析方法。
- 谢超郜尽袁运生俞雁
- 关键词：蛋白质相互作用蛋白质相互作用网络生物信息学
- 酵母双杂交研究小鼠肝脏再生TGF-β调控通路中相关转录因子的相互作用
- 2011年
- 目的采用酵母双杂交系统研究肝脏再生调控途径转化生长因子β(TGF-β)信号通路中4种转录因子的相互作用。方法经CCl4腹腔注射诱导建立小鼠肝损伤再生模型,提取模型小鼠肝脏组织总RNA作为模板,经RT-PCR获得cDNA。经肝脏再生基因芯片检测显示差异表达且与TGF-β信号通路相关的激活转录因子3(ATF3)、DNA结合抑制因子3(ID3)、DNA损伤诱导的转录因子3(DDIT3)和LIM蛋白家族成员FHL2(FHL2)作为候选基因,进行基因克隆和载体构建,PCR及DNA测序鉴定。采用酵母双杂交系统进行自激活检测实验和酵母双杂交实验,观察ATF3、FHL2、DDIT3和ID3之间的相互作用。结果 PCR及DNA测序鉴定表明,ATF3、FHL2、DDIT3、ID3基因克隆与载体构建成功。自激活检测显示ATF3、FHL2、DDIT3和ID3不存在自激活现象;酵母双杂交实验发现7对蛋白互作,分别为ID3/ATF3、FHL2/ATF3、ATF3/ATF3、FHL2/FHL2、ID3/FHL2、ID3/ID3和ID3/DDIT3。结论 ATF3、FHL2和ID3间的蛋白互作可能对TGF-β信号通路具有调控作用;蛋白互作网络可作为肝损伤再生机制研究的途径之一。
- 谢超王方圆袁运生郜尽朱润芝韩伟俞雁
- 关键词：肝脏再生转录因子酵母双杂交系统
- S100A4原核表达载体的构建以及蛋白的表达和纯化被引量：2
- 2013年
- S100A4是S100蛋白家族的成员,在细胞的增殖、分化、损伤修复以及肿瘤细胞转移等方面发挥重要的调控作用。本研究将S100A4全长基因构建到pET28a原核表达载体上,利用大肠杆菌表达系统表达和纯化出高纯度的重组人S100A4。通过试验证明,重组人S100A4蛋白在体外可以有效地增强黑色素瘤细胞A375-S2的增殖。重组人S100A4原核表达与纯化方法的建立将促进其结构和生物学功能研究,并且对于S100蛋白家族其它蛋白的表达与纯化具有重要的参考意义。
- 韩雷何虹霖关文李京敬袁运生俞雁
- 关键词：S100A4原核表达蛋白纯化蛋白活性
- 小鼠部分肝切除术的现状与应用被引量：2
- 2011年
- 部分肝切除术创建于20世纪30年代,他为哺乳动物的肝再生和肝疾病等研究提供了重要的实验工具,现有的手术方法主要以大鼠和小鼠为对象.小鼠的部分肝切除手术与大鼠的手术方法有较大的相似性,但因其体质差异不能完全复制大鼠的手术方法.本文结合文献报道和实践操作的经验,除了对部分肝切除术的原理和主要方法进行介绍外,也对小鼠部分肝切除手术流程及其关键控制点进行了总结.
- 李一胡建军韩伟俞雁
- 关键词：肝部分切除术肝再生小鼠
- 重组人Midkine真核表达载体的构建以及蛋白表达和纯化被引量：1
- 2014年
- Midkine(MK)是一种肝素结合型生长因子,在胚胎早期的分化发育、肿瘤、炎症、再生等方面发挥着重要的调控作用。本研究将人MK(hMK)全长基因构建到pPICZa(B)表达载体上,通过化学转染方法,转染质粒至不同酵母菌株中进行筛选,利用毕赤酵母的高密度发酵进行表达,纯化出高纯度的重组人Midkine(rhMK),并通过试验证明,纯化的rhMK具有趋化UMR106细胞的活性。rhMK的真核表达与纯化方法的建立为后续的药效学试验奠定了基础,并对其它蛋白的真核表达、纯化也有一定的参考意义。
- 徐杨琪李京敬关文郜尽贾世香屠平韩伟俞雁
- 关键词：毕赤酵母发酵离子交换层析高效液相色谱
- 酵母双杂交报告基因β-半乳糖苷酶活性测定方法的研究被引量：5
- 2009年
- 目的建立标准的酵母双杂交系统报告基因表达的β-半乳糖苷酶活性测定方法。方法采用o-硝基-β-D-半乳糖苷(ONPG)为底物,以液氮反复冻融破碎酵母细胞壁,通过比较不同测定时间、接种阳性克隆数目、转化方法以及酵母株对β-半乳糖苷酶酶活的影响,确定最佳酶活测定条件。结果相同条件下,单个克隆之间的酶活有差异,相对标准偏差(RSD)>8%;相同条件下,Y187酵母株比AH109酵母株酶活高18～20倍,并且本底水平很低甚至没有;双倍体酵母的酶活介于两个单倍体酵母之间,同预计一致;质粒顺序转化与共转化在AH109中差异有统计学意义(P<0.001),而在Y187中没有明显差异(P>0.05)。结论测定酵母双杂交报告基因β-半乳糖苷酶的活性宜采用Y187酵母株,酶活变化范围大,本底小,受转化方法影响小,测定时选取5个以上阳性克隆混合培养更有利于酶活的准确测定。
- 郜尽王海侠李京敬俞雁
- 关键词：酵母双杂交Β-半乳糖苷酶酶活测定
- DNA水凝胶分子设计、合成与应用被引量：3
- 2014年
- DNA纳米技术是纳米生物技术的一个重要研究领域,近年来发展迅猛.通过理性设计和可控制备可以获得多种基于DNA纳米结构的材料.DNA水凝胶作为宏量DNA材料的重要代表备受关注,展现出很广泛的应用前景,尤其是在生物医学应用领域.本文介绍了DNA水凝胶的分子设计原理、合成方法和典型应用,重点综述近年来该领域具有代表性的研究成果.
- 仰大勇许传营彭松明崔金辉俞雁韩伟崔海信罗丹
- 关键词：纳米生物技术药物缓释免疫调控
- 骨桥蛋白及其护肝用途
- 一种生物医药技术领域的骨桥蛋白及其护肝用途，所述的蛋白的氨基酸序列如SEQ IDNO：1所示；所述的蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO：2所示。所述的蛋白在制备用于治疗病毒性的、代谢性的或毒性病原学的急性、亚急性、爆发...
- 俞雁袁运生韩伟
- 文献传递
- 人CXCL4蛋白原核表达与纯化
- 2016年
- CXCL4又名血小板因子4(PF4),属于CXC趋化因子亚家族,能够广谱的作用于多种细胞,在炎症,凝血等众多生理及病理反应中发挥重要作用。将CXCL4全长基因构建到原核表达载体p ET43.1a(+),利用大肠杆菌系统表达,继而纯化获得高纯度的目的蛋白。实验表明重组人CXCL4蛋白可以有效抑制人肾癌细胞增殖,具有生物学活性。重组人CXCL4原核表达与纯化方法的建立将有助于其生物学结构与功能的研究,并且对趋化因子家族其它蛋白质的表达与纯化具有参考价值。
- 周亮叶浩周瓅关文李京敬郜尽韩伟俞雁
- 关键词：原核表达纯化
- 骨桥蛋白:肝脏疾病中的一个重要分子被引量：1
- 2011年
- 骨桥蛋白(osteopontin,OPN)是一种多功能的糖蛋白,在体内参与多种生理和病理活动.众多的研究已经表明OPN表达在多种肝脏疾病和肝病动物模型中发生异常变化,这种变化具有重要的病理意义.深入研究OPN在不同肝脏疾病中的作用机制和其调控的通路,对寻找治疗肝脏疾病的新靶点和开发新药物都有非常重要意义.
- 袁运生谢旻旗钱正昊张夕原严德珺俞雁
- 关键词：骨桥蛋白肝脏疾病受体生物标记
