郜尽 作品数:26 被引量:138 H指数:8 供职机构: 上海交通大学药学院 更多>> 发文基金: 安徽省高等学校优秀青年人才基金 国家高技术研究发展计划 上海市科学技术发展基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 农业科学 更多>>
蛋白质相互作用及互作网络的生物信息学分析 被引量:5 2009年 后基因组时代的最终目标是认识真正执行生命活动的全部蛋白质的表达规律和生物学功能,即蛋白质组学研究。关键的挑战之一就是对蛋白质相互作用网络的研究,将有助于从系统角度加深对细胞结构和功能的认识,并且为新药靶位点的发现和药物设计提供理论基础。目前,用生物信息学的手段来研究蛋白质相互作用网络显示出巨大的优势,主要包括蛋白质相互作用网络的绘制与显示、网络的拓扑结构分析、网络结构模块的研究及网络的比对等。文章试图从生物信息学的角度认识蛋白质相互作用,并总结蛋白质相互作用网络的生物信息学分析方法。 谢超 郜尽 袁运生 俞雁关键词:蛋白质相互作用 蛋白质相互作用网络 生物信息学 金银花中绿原酸和木犀草苷的同时提取及测定研究 被引量:8 2011年 目的:优化金银花样品中绿原酸和木犀草苷提取工艺,并建立两者含量同时测定的方法。方法:设计三水平四因素的正交试验,筛选最佳提取条件,并以此条件处理不同产地的金银花,用HPLC测定其绿原酸和木犀草苷的含量。结果:最佳提取工艺条件为:用50%的乙醇35mL在70℃下回流提取1h;0.5%冰醋酸和甲醇为流动相,梯度洗脱,检测波长350 nm,绿原酸和木犀草苷的线性方程y=1×106x-806 7和y=4×106x-119 017,线性区间为:0.2~1.6μg和0.22~2.2μg,回归系数r值为0.999 9和0.9997;精密度、稳定性、回收率试验结果均良好;五个产地的金银花有四个绿原酸和木犀草苷的含量高于药典规定。 王海侠 汪玮鑫 时维静 郜尽关键词:金银花 HPLC 绿原酸 木犀草苷 宁溃灵的药理学研究 2002年 宁溃灵是治疗消化性溃疡的有效方剂 ,具有稳急止痛 ,理气消胀 ,健脾和胃 ,生肌愈疡的功效。我们的试验表明 :宁溃灵的最大给药量为 1 1 7.7g/kg/d(生药 ) ,相当于人日用量的 2 74.62倍。宁溃灵对醋酸形成的慢性胃溃疡大鼠 ,可显著的促进胃溃疡的愈合 ,并可降低其升高的胃蛋白酶活性。宁溃灵有轻微的促进胃肠运动作用 ,可轻微的加快小鼠对碳墨的推进速度。宁溃灵对由冰醋酸导致的腹痛 (扭体反应 )有明显的抑制作用 ,对热刺激引起的疼痛 (小鼠甩尾反应 )有抑制作用。 郜尽 冯英菊 杨甫昭关键词:药理学 抗溃疡病药 中成药 2种定量PCR法与探针杂交法在检测重组白介素1受体拮抗剂中宿主DNA残留量的比较 被引量:2 2014年 目的:建立Taqman探针技术的定量PCR方法,对大肠杆菌E.coli/BL21菌株生产的重组白介素1受体拮抗剂(rhIL^-1ra)中的残留宿主DNA进行了定量分析,并与SYBR Green法和地高辛探针杂交法进行比较。方法:以BioRad Chromo 4荧光定量PCR仪为平台,选择大肠杆菌23S核糖体RNA基因为靶基因,设计引物和Taqman探针,以纯化的宿主基因组DNA为标准品,对供试品中残留DNA进行定量。同时在重复性,精密度,检测限等方面与SYBR Green方法和地高辛探针杂交法进行比较。结果:本实验建立的Taqman探针法检测限为0.01 ng·mL^-1,在0.01~1000 ng·mL^-1区间同样具有良好的线性(r=0.997),回收率89.7%~136.0%。测定4批次供试品中残留DNA浓度为0.052、0.092、0.096、0.025 ng·mL^-1。结论:Taqman探针法与SYBR Green法检测灵敏度均达到0.01 ng·mL^-1,在重复性与精密度方面效果一致,且均优于探针杂交方法。 李京敬 郜尽 韩伟关键词:大肠杆菌 定量PCR 酵母双杂交报告基因β-半乳糖苷酶活性测定方法的研究 被引量:5 2009年 目的建立标准的酵母双杂交系统报告基因表达的β-半乳糖苷酶活性测定方法。方法采用o-硝基-β-D-半乳糖苷(ONPG)为底物,以液氮反复冻融破碎酵母细胞壁,通过比较不同测定时间、接种阳性克隆数目、转化方法以及酵母株对β-半乳糖苷酶酶活的影响,确定最佳酶活测定条件。结果相同条件下,单个克隆之间的酶活有差异,相对标准偏差(RSD)>8%;相同条件下,Y187酵母株比AH109酵母株酶活高18~20倍,并且本底水平很低甚至没有;双倍体酵母的酶活介于两个单倍体酵母之间,同预计一致;质粒顺序转化与共转化在AH109中差异有统计学意义(P<0.001),而在Y187中没有明显差异(P>0.05)。结论测定酵母双杂交报告基因β-半乳糖苷酶的活性宜采用Y187酵母株,酶活变化范围大,本底小,受转化方法影响小,测定时选取5个以上阳性克隆混合培养更有利于酶活的准确测定。 郜尽 王海侠 李京敬 俞雁关键词:酵母双杂交 Β-半乳糖苷酶 酶活测定 人CXCL4蛋白原核表达与纯化 2016年 CXCL4又名血小板因子4(PF4),属于CXC趋化因子亚家族,能够广谱的作用于多种细胞,在炎症,凝血等众多生理及病理反应中发挥重要作用。将CXCL4全长基因构建到原核表达载体p ET43.1a(+),利用大肠杆菌系统表达,继而纯化获得高纯度的目的蛋白。实验表明重组人CXCL4蛋白可以有效抑制人肾癌细胞增殖,具有生物学活性。重组人CXCL4原核表达与纯化方法的建立将有助于其生物学结构与功能的研究,并且对趋化因子家族其它蛋白质的表达与纯化具有参考价值。 周亮 叶浩 周瓅 关文 李京敬 郜尽 韩伟 俞雁关键词:原核表达 纯化 小鼠肝再生过程中脂质代谢相关通路中基因的表达谱变化(英文) 被引量:1 2009年 1材料与方法
1.1材料 试验动物:9周龄的雄性C57BIV6小鼠,自由采食和饮水,每天光照12h,黑暗12h。试剂:TRIzol试剂(Invitrogen);RNeasy Total RNA Mini Kit(Qiagen);基因芯片Genechip mouse genome 43020(Affymetrix);17启动子引物序列(Affymetrix)。 袁运生 张夕原 严德珺 杨婷旭 郜尽 俞雁关键词:脂质代谢 再生过程 小鼠 表达谱 通路 TRIZOL 白茅根中绿原酸的提取与含量测定 被引量:10 2010年 目的:筛选最佳的白茅根中绿原酸的提取条件,建立药材中绿原酸含量的测定方法。方法:通过3水平、4因素正交实验方法确定白茅根中绿原酸提取的最佳条件,采用高效液相法测定其含量。结果:提取最佳条件为:提取次数为2次,料液比为1:30,90℃甲醇做溶剂,超声时间为40分钟。HPLC含量测定方法的最佳条件为:以乙腈-0.4%磷酸(13:87)为流动相,流速1.0ml.min-1,检测波长328nm,其中绿原酸在0.2~3.2μg范围内呈线性关系,线性方程Y=2×106X-59372,r=0.9998,精密度、重复性、回收率试验结果均比较理想,RSD分别为:0.95%、1.83%、4.73%。结论:以料液比1:30,90℃提取两次能够有效地提取绿原酸;HPLC方法检测绿原酸准确,重现性好,结果可靠。 王海侠 姚青春 时维静 郜尽关键词:绿原酸 中药制药工艺 蒺藜草中一个新的六糖甾体皂甙结构的NMR研究 被引量:8 2002年 从蒺藜草中分离得到一个新的六糖甾体皂甙,利用NMR方法,特别是2DNMR技术,确定了它的化学结构为3-O-{β-D-吡喃木糖基-(1→3)-[β-D-吡喃葡萄糖基-(1→2)]-β-D-吡喃葡萄糖基-(1→4)-[α-L-吡喃鼠李糖基-(1→2)-β-D-吡喃半乳糖基}-22-甲氧基-26-O-{β-D-吡喃葡萄糖基}-蒺藜基皂甙元. 涂光忠 马立斌 李喜来 安东各 孙文基 郭遵武 郜尽关键词:NMR 中药 小鼠肝再生过程中脂质代谢相关通路中基因的表达谱变化 被引量:1 2009年 [目的]研究肝再生过程中肝脏内脂质代谢通路相关基因的表达谱变化。[方法]建立CC l4诱导肝再生小鼠模型,从小鼠肝组织中提取总RNA,通过微阵列基因芯片技术检测在不同肝再生期间脂质代谢通路相关基因的表达变化,并进行具体功能分析。[结果]肝再生过程中,有98个脂质代谢相关基因的表达水平发生了变化,根据这些基因表达的变化趋势可以分为8组。整体上看,基因表达前期表现为抑制,后期表现为上调。其中,脂肪酸的合成通路基因表达以上调为主,分解代谢通路变化并不明显;大多数胆汁酸合成通路基因在4.5天之前表现为抑制,在4.5天和7天时表现为上调。[结论]肝再生过程中,脂质代谢相关通路间的基因表达变化并不一致,这些数据为进一步研究脂质代谢相关通路对肝再生的调控作用提供了明确的基因范围。 袁运生 张夕原 严德珺 杨婷旭 郜尽 俞雁关键词:脂质代谢 基因表达谱 肝再生 微阵列芯片