徐星烨
- 作品数：2 被引量：0H指数：0
- 供职机构：中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所病毒基因工程国家重点实验室更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划北京市科技计划项目国际科技合作与交流专项项目更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 两株刚果红结合突变型志贺菌大质粒全基因组比较研究
- 2005年
- 对福氏志贺菌(Shigellaflexneri)5型及志贺氏志贺菌(Shigelladysenteriae)1型两株与刚果红结合突变菌株的大质粒pSF5及pSD1进行了全基因组测序及分析.pSF5全长136694bp,包含165个ORFs,其中133个功能明确,32个功能未知.pSD1全长182726bp,共有224个ORFs,其中181个功能明确,43个功能未知.pSF5中IS序列为53787bp,pSD1中为49616bp,分别占整个基因组的39.3%,27.2%.二者中共有22种不同类型的IS出现,其中ISEc8,ISSbo6在志贺菌大质粒中为首次报道.与pCP301相比,pSF5和pSD1都发生了大范围基因缺失,并在多处发生基因片段倒置等现象.pSF5中除与侵袭相关ipa-mxi-spa基因岛完全缺失外,与O-抗原生物合成密切相关的shf-rfbU-msbB基因也部分缺失,而在pSD1中上述基因则完整存在,但pSD1中与侵袭基因表达调控相关的virF基因缺失.结果表明,在pSF5和pSD1中与侵袭相关的调控因子及侵袭基因的缺失是导致刚果红结合突变的原因之一,但是否是唯一的原因还需进一步的验证.
- 唐旭东熊朝晖杨帆张笑冰杨剑陈立宏聂桓燕永亮江艳王璟薛颖徐星烨朱亚芳董杰安黎哲王勋陵金奇
- 关键词：刚果红基因组比较突变型质粒
- 应用全基因组PCR扫描方法进行猪链球菌基因组结构的比较分析
- 2007年
- 2005年,在中国四川局部地区爆发人感染猪链球菌疫情,因其感染人数多,病死率高引起关注,为了确定该致病菌是否发生变异,通过应用全基因组PCR扫描方法(WGPScaning)、多位点序列分型技术(MLST)以及毒力相关基因的序列测定,比较分别来自本次疫情中的病人和病猪、以前流行期间感染的病人分离的菌株以及网上公布的来自欧洲的猪链球菌基因组序列,结果显示各菌株的基因组结构相似,毒力相关基因没有差异,所有菌株都属于ST1序列群,说明本次引起四川疫情的菌株未发生明显的基因组结构的改变.
- 熊朝晖卫灿东杨剑彭俊平徐星烨王宇金奇
- 关键词：猪链球菌多位点序列分型
