杨瑞红
- 作品数：21 被引量：17H指数：2
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- 运用SELDI芯片技术寻找弥漫大B细胞淋巴瘤相关性蛋白
- 本文研究目的：应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(surface enhanced laserdesorption/ionization time of flight mass spectrometry,SELDI-T...
- 杨瑞红
- 关键词：细胞淋巴瘤生物标志物
- 文献传递
- SELDI技术在肺鳞化疗监测中的临床观察
- 杨瑞红郭素堂宋霞田瑞芬王春艳王福花郭向云
- miR-497抑制结肠癌细胞HCT116炎症相关基因表达的基因芯片研究被引量：3
- 2017年
- 目的：采用基因芯片分析miR-497高表达对结肠癌细胞HCT116基因表达谱的影响。方法利用慢病毒感染人结肠癌细胞株 HCT116，建立 miR-497稳定高表达的结肠癌细胞模型HCT116-497细胞及阴性对照HCT116-CON细胞，用全基因组表达谱芯片筛选差异表达基因，利用MAS 3.0生物信息注释系统进行基因本体（gene ontology，GO）和信号通路富集分析（pathway analysis），筛选炎症相关基因。应用实时定量反转录聚合酶链反应（qRT-PCR）对候选基因进行验证。结果筛选出绝对倍数变化（absolute fold change）3.0倍以上的下调基因582个，发现其主要富集于炎症相关细胞因子网络等信号通路。选取下调基因中参与细胞因子网络和MAPK信号通路的15个炎症相关基因进行PCR验证后显示，与 HCT116-CON 细胞相比，HCT116-497细胞中10个基因（CACNB1、FOS、IL-29、RPS6KA2、TNFSF15、IL-11、INHBC、CSF1R、JAK3和IL-2Rβ）表达水平降低，差异均有统计学意义（均P＜0.05），与芯片结果一致。结论 miR-497抑制结肠癌细胞HCT116中炎症相关基因mRNA的表达。
- 王娟娟杨瑞红王福花郭向云李晓宇梁书丰郭素堂
- 关键词：结肠肿瘤基因本体
- 蛋白质组学在淋巴瘤中的应用
- 2007年
- 淋巴瘤是血液系统常见的恶性肿瘤之一,其诊断和分型一直是一临床难题。目前确诊主要依据组织病理学,而病理检查手段并不包括对淋巴瘤的临床分期、肿瘤负荷情况、浸润程度及对治疗的反应等。细胞从正常状态转为肿瘤的过程中,细胞内的蛋白质都会产生一系列的变化。随着生物信息学的快速发展和趋于成熟,以高通量、粗样本结合生物信息学为特点的蛋白质组学技术可以从细胞整体水平检测到这种变化。文章就蛋白质组学在淋巴瘤的诊断、分型、治疗及其应用前景作一综述。
- 杨瑞红王晋芬郭素堂
- 关键词：蛋白质组学淋巴瘤
- 全文增补中
- 表面加强激光解析电离蛋白质谱技术在乳腺癌血清学诊断中的应用被引量：2
- 2012年
- 目的探讨血清表面加强激光解析电离（SELDI）蛋白质谱技术在乳腺癌诊断方面的应用。方法用表面加强激光解析电离飞行时间质谱技术（SELDI—TOF—MS）及WCX2蛋白获得病理确诊的101例乳腺癌患者手术前和45名健康人的血清蛋白指纹图谱，用Biomarker Wizard和BPS软件分析差异蛋白，建立乳腺癌的分类树诊断模型，并对其进行盲法验证。结果乳腺癌组与健康对照组共有49个蛋白质差异有统计学意义（P〈0．05）；以其中3个蛋白质生物标志物（M／Z：5627、8124和2864）组建的诊断模型检测正确率为95％（139／146）。经盲法验证，其灵敏度为97％（98／101），特异度为91％（4l／45）。结论SELDI蛋白质谱技术可以有效的区分乳腺癌患者和健康人，其灵敏度和特异性高。SELDI—TOF—MS在乳腺癌的诊断及乳腺癌特异性的生物标志物分子的筛选方面具有一定的应用价值。
- 许慧娟郭向阳张华一王春艳梁帅杨瑞红王福花吴玉梅郭素堂李圻正
- 关键词：乳腺肿瘤蛋白质组学
- 食管癌患者外周血中基质活检因子mRNA表达的临床意义被引量：2
- 2007年
- 目的探讨食管癌患者外周血中基质活检因子(MMP-7)mRNA 表达与食管癌复发及预后的关系。方法采用实时荧光定量 RT-PCR 方法,检测82例食管癌术后患者外周血中 MMP-7mRNA 表达。结果 82例食管癌患者中,MMP-7 mRNA 表达阳性率为37.5%。MMP-7 mRNA 表达阳性与淋巴结转移、血行转移和临床分期显著相关。28例复发患者中,15例接受动态观察,其中5例外周血中MMP-7 mRNA 表达阳性先于影像学3～6个月,8例同时阳性。结论食管癌患者外周血中 MMP-7mRNA 表达阳性可作为食管癌转移、复发和预后判断的指标。
- 廉建红王春利刘维兰杨瑞红郭素堂
- 关键词：食管肿瘤反转录聚合酶链反应基质溶解因子
- 全文增补中
- 前列腺癌骨转移患者血清差异性相关蛋白质的筛选被引量：2
- 2011年
- 目的采用表而增强激光解析电离飞行时间质谱技术筛选前列腺癌骨转移血清差异性相关蛋门质。方法应用美目Ciphergen公司CM10，吕片和蛋白芯片仪检测19例前列腺癌无骨转移患者及35例前列腺癌骨转移患者血清中的蛋白质。利用PBSⅡ—C型蛋白质芯片阅渎仪对CMIO芯片进行检测，所得到的蛋白质以波谱的形式表示。采用BiomarkerWizard软件对2组血清相同质荷比的蛋白质含量数据进行方差分析，导入BiomarkerPattern软件，以得到正确分组的差异性蛋fLI质标志物。结果19例前列腺癌无骨转移患者与35例前列腺癌骨转移患者的血清蛋白质在质荷比为2000～20000时有6个蛋白质含量差异有统计学意义；前列腺癌无骨转移组在质荷比为2089、4281、3507、4178处的蛋白质的相对含量明显高于前列腺癌骨转移组，分别为4．63±8．03和9．88±10．77、19．78±21．46和26．73±19．41、5．46±10．14和8．10±8．74、38．01±26．27和45．25±20．40（P〈0．05）；前列腺癌无骨转移组在质荷比为15900、16081处的蛋白质的相对含量明显低于前列腺癌骨转移组，分别为11．52±16．80和4．84±5．83、8．55±12．64和3．564±3．90（P〈0．05）。结论表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术快速、准确，灵敏度、特异度高，通过蛋白芯片仪发现的差异性相关蛋白质，有望成为前列腺癌骨转移诊断中有应用价值的临床柃洲指标．
- 刘洪宇米振国韩雪冰郭素堂杨瑞红
- 关键词：前列腺肿瘤肿瘤转移光谱法质谱
- SELDI-TOF-MS技术在贲门癌诊断中的初步研究被引量：1
- 2012年
- 目的寻找贲门癌肿瘤标记物并建立诊断模型。筛选提示发生淋巴转移的差异蛋白,为临床早期诊断贲门癌及判断预后提供新方法。方法 CM10蛋白芯片结合表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)检测101例贲门癌患者及118例正常对照者血清蛋白,Biomarker Wizard软件和Biomarker Patterns System(BPS)分析得差异蛋白并建立贲门癌诊断分类树,双盲法验证其准确性。进一步分析对比有、无淋巴转移的贲门癌患者血清蛋白指纹图谱,得到差异蛋白。结果对照分析贲门癌患者和正常对照组的血清蛋白指纹图谱得56个差异蛋白(P<0.05),经BPS软件筛选,以质荷比为5 480.49(P<10-8)的蛋白为主根结点建立贲门癌诊断模型,其灵敏度为95.05%,特异度为95.76%。得到可提示淋巴转移的差异蛋白3 820.87(P<0.05),其灵敏度为84.4%,特异度为82.1%。结论 SELDI-TOF-MS技术可建立有较高灵敏度和特异度的贲门癌诊断模型,筛选出能够提示发生淋巴转移的差异蛋白,有助于贲门癌的早期筛查、诊断和预后判断。
- 靳小可杨瑞红郭素堂张旭东胡春松
- 关键词：贲门癌
- 应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术筛选乳腺癌相关蛋白标志物被引量：1
- 2013年
- 目的 应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱 （SELDI-TOF-MS）技术筛选乳腺癌的特异性蛋白标志物。方法 用SELDI-TOF-MS仪及CM10蛋白芯片检测110例乳腺癌患者治疗前及100名健康对照的血清蛋白指纹图谱，应用软件自动采集数据、筛选差异表达蛋白，对表达有差异蛋白的诊断效率进行统计分析，采用多变量的Logistic回归模型校正混杂因素。结果 乳腺癌组与健康对照组相比，共有49个蛋白峰的强度差异有统计学意义（P＜0.05）。结合以前的文献，筛选出6个蛋白标志物，质荷比（M／Z）分别为3264、3968、4376、8124、8924和9180，组建成乳腺癌诊断模型，其中表达下调的蛋白M／Z有4376、8126和8924，表达上调的有3264、3968和9180。M／Z为3264、3968、4376、8126、8924的蛋白诊断乳腺癌的ROC曲线下面积分别为0.936、0.933、0.727、0.976和0.751，可作为诊断乳腺癌的标志物。M／Z为9180的蛋白与乳腺癌的TNM分期和Her-2的表达相关（P＜0.05），M／Z为8926的蛋白峰与乳腺癌淋巴结转移有一定的关系（P＜0.05）。结论 SELDI蛋白质谱技术可能有效地区分乳腺癌患者和健康人，筛选出的蛋白对乳腺癌诊断的灵敏度和特异度较高。SELDI在乳腺癌的诊断及乳腺癌特异性分子生物标志物的筛选方面具有一定的应用价值。
- 王春艳杨瑞红王福花吴玉梅李炘正郭素堂
- 关键词：乳腺肿瘤表面增强激光解析电离飞行时间质谱蛋白质组学
- SELDI技术在肺鳞化疗监测中的临床观察
- 目的:肺癌病人在手术后对治疗的反应差异很大,出现此差异的原因很多。本实验用蛋白质飞行质谱分析方法对肺鳞癌手术后进行化疗治疗的疗效以及预后进行观察分析,希望找到疗效检测和预后的生物指标。
- 杨瑞红郭素堂宋霞田瑞芬王春艳王福花郭向云
- 文献传递
