宋兵
- 作品数:3 被引量:18H指数:2
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- 福建省稻田土壤细菌群落的16S rDNA-PCR-DGGE分析被引量:17
- 2008年
- 用不依赖细菌培养的16S rDNA-PCR-DGGE方法对福建省6个不同地区12个取样点的稻田土壤进行细菌群落结构分析。对12份样品直接提取其总DNA,用F341GC/R534引物扩增16S rDNA基因的V3可变区,结合DGGE(denaturing gradient gel electrophoresis)技术分析样品细菌群落组成。结果表明,福建省不同地区的稻田土壤之间细菌群落结构存在较大差异,大体上可分为闽东、闽南、闽北、闽西4个大类。同一地区的根际土和表土样品之间也存在差异,但差异相对较低,其中龙岩根际土和表土细菌群落结构相似性最大,永泰差异性最大。回收了DGGE图谱中11个条带,测序结果经过Blast比对表明其中10个条带代表的细菌是不可培养的,显示了DGGE技术的优越性。
- 李友发宋兵宋亚娜郑斯平翟焕趁郑伟文
- 关键词:稻田土壤细菌群落
- 稻田固氮细菌分离物的PCR-DGGE分析及苯酚降解菌株的筛选
- 稻田固氮微生物是土壤微生物资源的重要组成部分。本文采用16S rDNA-PCR-DGGE法对本实验室以前从福建稻田土壤分离取得的八个固氮细菌分离物进行分子鉴定,发现每一种分离物都不同程度的被杂菌污染,即以一种固氮细菌为优...
- 宋兵
- 关键词:固氮细菌苯酚降解降解菌株生物修复
- 文献传递
- 稻田固氮细菌分离物的PCR-DGGE及其序列同源性分析被引量:2
- 2007年
- 采用PCR-DGGE法对从福建稻田取得的8个固氮细菌分离物进行分子鉴定,通过测序比对,发现它们与中慢生根瘤菌(Mesorhizobiumsp.)、鞘氨醇单胞菌(Sphingomonassp.)、根瘤菌(Rhizobiumsp.)、慢生根瘤菌(Bradyrhizobiumsp.)、克雷伯氏杆菌(Klebsiellasp.)、伯克霍德尔氏菌(Burkholderia cepacia)、假单胞菌(Pseud-omonassp.)、诺卡氏菌(Nocardioides)和红球菌(Rhodococcussp.)9个属的固氮细菌具有高度同源性。
- 宋兵李友发林智敏陈彬郑伟文
- 关键词:水稻土固氮细菌