翟焕趁
- 作品数：8 被引量：45H指数：4
- 供职机构：福建农林大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家公益性行业科研专项福建省科技计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学理学更多>>
- 水稻泛素结合酶基因家族的生物信息学与表达分析被引量：5
- 2016年
- 泛素/蛋白酶体系统在植物的生长发育、形态建成和抗病反应等过程中起着重要的作用。近年的研究表明,某些病原菌能够模拟寄主植物泛素/蛋白酶体系统组分,从而达到利用该系统为病原菌服务的目的。泛素结合酶是泛素化反应过程中的第二个酶,对植物泛素/蛋白酶体系统的正常运行不可或缺。已有的研究表明,水稻基因组数据库中存在48个预测的泛素结合酶基因。为了初步揭示这些泛素结合酶基因在植物抗病防御反应中的功能,研究其与植物抗病性的关系。本研究通过生物信息学、RNA-seq和qRT-PCR的方法,分析了水稻泛素结合酶基因家族的特征及其表达模式。系统进化树分析表明,48个水稻泛素结合酶基因可分为3个大组,总共7个亚组。蛋白结构域分析表明,水稻泛素结合酶基因主要由一个泛素结合酶催化结构域组成。电子表达谱分析表明,大多数水稻泛素结合酶基因能被稻瘟病菌诱导表达。启动子区顺式作用元件分析表明,4个抗病相关顺式作用元件和1个过敏性反应相关顺式作用元件在48个水稻泛素结合酶基因的启动子区有很高的分布。稻瘟病菌接种亲和性和非亲和性水稻单基因系的RNA-seq结果表明,处理36h读取到的水稻泛素结合酶基因为44个,其中高表达基因数量超过读取到的泛素结合酶基因总数的50%。qRT-PCR分析结果表明稻瘟病菌的侵染在亲和和非亲和组合中都能诱导部分水稻泛素结合酶基因的表达。在非亲和组合中水稻泛素结合酶基因的表达倾向于受到抑制。
- 刘鑫张恒阚虎飞周立帅黄昊宋林林翟焕趁张君鲁国东
- 关键词：水稻泛素结合酶生物信息学稻瘟病菌RNA-SEQQRT-PCR
- 稻瘟病菌无毒基因Avr-Pid2的分子标记及其连锁图被引量：1
- 2011年
- 无毒基因的克隆与变异监测可以为水稻抗病品种布局与利用提供重要信息。将菌株GUY11和FJ81278及其有性后代接种水稻品种Pi-d2及其亲本TP309进行毒性分析。结果表明,FJ81278含Avr-Pid2,有性后代在Pi-d2上的无毒、有毒分离比例符合1:1,推断FJ81278对Pi-d2的无毒性由单一基因座控制。通过SSR标记和转座子元件标记分析,确定Avr-Pid2定位于染色体7上,并获得了与无毒基因Avr-Pid2连锁的标记Propiz-t和ms7-27/28,它们与Avr-Pid2的遗传距离分别为6.1 cM、13.0 cM。这些标记的获得将Avr-Pid2限制在第7染色体上约420 kb物理距离范围内,为进一步的克隆奠定了良好基础。
- 翟焕趁王宝华鲁国东朱立煌王宗华
- 关键词：稻瘟病菌无毒基因分子标记
- 福建省稻田土壤细菌群落的16S rDNA-PCR-DGGE分析被引量：17
- 2008年
- 用不依赖细菌培养的16S rDNA-PCR-DGGE方法对福建省6个不同地区12个取样点的稻田土壤进行细菌群落结构分析。对12份样品直接提取其总DNA,用F341GC/R534引物扩增16S rDNA基因的V3可变区,结合DGGE(denaturing gradient gel electrophoresis)技术分析样品细菌群落组成。结果表明,福建省不同地区的稻田土壤之间细菌群落结构存在较大差异,大体上可分为闽东、闽南、闽北、闽西4个大类。同一地区的根际土和表土样品之间也存在差异,但差异相对较低,其中龙岩根际土和表土细菌群落结构相似性最大,永泰差异性最大。回收了DGGE图谱中11个条带,测序结果经过Blast比对表明其中10个条带代表的细菌是不可培养的,显示了DGGE技术的优越性。
- 李友发宋兵宋亚娜郑斯平翟焕趁郑伟文
- 关键词：稻田土壤细菌群落
- 反相HPLC法同时测定青梅中的7种有机酸被引量：14
- 2007年
- 建立了用反相高效液相色谱法同时快速测定青梅中草酸、酒石酸、苹果酸、乳酸、乙酸、柠檬酸及琥珀酸等7种有机酸的方法。采用的色谱柱为Hypersil ODS C18（250mm×4．6mmi．d．，5μm），流动相为0．01mol·L^-1 KH2PO4（pH2．8），流速为0．8mL·min^-1，柱温21℃，检测波长215nm。有机酸的回收率为75．4％～121．0％；相对标准偏差为0．78％～2．12％；检出限为0．0221．290μg·mL^-1。测定了4种不同青梅样品中有机酸的含量。
- 翟焕趁史怀宋亚娜郑伟文
- 关键词：反相高效液相色谱法青梅有机酸
- 福建青梅rDNA ITS区克隆与序列分析被引量：6
- 2008年
- 利用PCR法对青梅ITS1、5.8S、ITS2序列扩增后克隆测序,用软件DNAMAN和MEGA3.1分析测序结果,研究18个福建青梅样品的核糖体ITS碱基序列差异。获得青梅18个样品rDNA中的ITS和5.8S完全序列,ITS1、5.8S和ITS2序列长度分别为223～224bp、164bp和241～246bp,5.8S较为保守。根据测序结果,以UPGMA法建立系统发生树,从分子水平说明18个样品间的变异程度,并将福建青梅差异较大的14条rDNA ITS序列登录GenBank,获得登录号:EF523482-EF523493、EF529435和EF529436。
- 翟焕趁宋亚娜郑伟文
- 关键词：青梅ITS序列克隆
- 稻瘟病菌菌株FJ81278中新发现的一个基因注释及其表达分析被引量：1
- 2011年
- 对稻瘟病菌菌株FJ81278进行基因组和转录组分析,发现一个新的特异基因MoHsbA编码的蛋白具有疏水表面结合蛋白A(HsbA)结构域和一个信号肽.进一步的生物信息学分析发现,该基因组中另外7个基因编码的蛋白也具疏水表面结合蛋白结构域.稻瘟病菌中的HsbA蛋白聚集于系统发育树的同一个大的分支上,说明它们具有较近的亲缘关系.转录组和EST数据库中HsbA的表达情况不同,但在菌株GUY11侵染阶段基因芯片中均表现为上调.实时定量PCR分析表明,MoHs-bA在菌株FJ81278不同生长发育阶段均有表达,但在附着胞阶段表达量相对较高,推测该基因与附着胞的形成相关.研究结果为进一步揭示稻瘟病菌HsbA的生物学功能奠定了基础.
- 翟焕趁连壁王杏杏王宝华鲁国东王宗华
- 关键词：稻瘟病菌转录组
- 稻瘟病菌菌株FJ81278无毒基因Avr-Pid2的定位及深度测序分析
- 稻瘟病是世界水稻生产上的重要病害之一，严重影响各国的粮食安全。培育抗病品种是防治该病最为经济有效的措施，但往往由于稻瘟病菌无毒基因发生变化的菌株在群体中占优势，导致病菌群体能够使相对应的抗性基因在田间丧失作用。稻瘟病菌与...
- 翟焕趁
- 关键词：稻瘟病菌抗病品种
- 福建青梅（Prunus mume）的遗传多样性与有机酸分析
- 福建是青梅的重要产地，但野生梅越来越少，商用药材大部分来自人工栽培。目前，福建青梅栽培品种的分类、鉴别以及药材质量评价等尚未进行系统研究。本研究旨在通过对青梅主栽品种的遗传多样性及有机酸分析，为青梅野生及栽培品种的种质资...
- 翟焕趁
- 关键词：青梅ITS区高效液相色谱有机酸
- 文献传递
