包俊英 作品数:11 被引量:44 H指数:5 供职机构: 中山医科大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家教育部博士点基金 广东省自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 更多>>
日本血吸虫(中国大陆株)若干酶类基因的发现 被引量:8 2001年 目的 运用表达序列标签 (EST)技术 ,从日本血吸虫 (Schistosomajaponicum ,Sj)cDNA文库中分离、鉴定出有潜在应用价值的血吸虫基因序列。方法 应用EST方法 ,从日本血吸虫cDNA文库中随机挑选出单个重组克隆 ,PCR扩增出插入片段 ,并进行PCR产物直接测序 ;将获得的序列资料与EBI和GenBank进行BLASTn和BLASTx同源性检索 ,对可能的酶类基因序列进行分析。结论 采用EST策略 ,可获得日本血吸虫 (中国大陆株 )若干酶类基因序列EST ,为进一步的cDNA全长扩增和克隆奠定基础。 李晖婷 余新炳 吴忠道 李焱 包俊英 邵筱关键词:日本血吸虫 中国大陆株 CDNA文库 表达序列标签 日本血吸虫基因表达序列标签的获得和分析 被引量:11 2001年 为寻找日本血吸虫新基因并进行血吸虫基因功能研究 ,随机挑选日本血吸虫 (中国大陆株 )成虫 c DNA文库克隆 ,培养后提取噬菌体 DNA作模板 ,进行 PCR反应扩增 ,将扩增产物部分测序产生表达序列标签 (EST) ,并将 EST输入Gen Bank和 EMBL,运用分子生物学软件比较其同源性 ,推导其蛋白序列并进行分析 ,结果得到 75个未曾登录的新基因 ,并对其中一些基因进行功能推测研究 ,认为表达序列标签是快速有效寻找基因的方法 。 李焱 余新炳 吴忠道 李晖婷 包俊英 卞国武关键词:日本血吸虫 成虫CDNA文库 表达序列标签 基因功能分析 基因表达 日本血吸虫新基因的筛选及S.jElonginC基因结构和功能的研究 目的:采用表达序列标签(EST)法随机筛选日本血吸虫(中国大陆株)成虫cDNA文库,获得日本血吸虫成虫ESTs;将获得的ESTs通过互联网登录GenBank并进行了同源性分析;对部分具有潜在功能的克隆进行序列的通测,获得... 包俊英关键词:CDNA文库 血吸虫 新基因 文献传递 日本血吸虫RNA聚合酶转录因子SⅢ-p15真核正反义表达载体的构建和鉴定 被引量:5 2002年 目的 构建日本血吸虫 RNA聚合酶 转录延长因子 S - p15真核正反义表达载体 ,为进一步鉴定该因子的生物学功能奠定基础。方法 采用表达序列标签法从日本血吸虫成虫 c DNA文库中获得了 1个 RNA聚合酶转录因子 (S - p15 )全长 c DNA序列 ,克隆及序列测定后 ,将该片段正向及反向插入到真核表达载体 pc DNA 3中。重组载体采用氨苄青霉素 L B培养基筛选、双酶切、PCR及测序鉴定。结果 经鉴定 ,S - p15 - pc DNA3真核正反义表达载体构建成功。结论 构建成功 S -p15 - pc DNA3真核正反义表达载体 ,为下一步鉴定其生物学功能奠定基础。 包俊英 吴忠道 徐劲 余新炳关键词:日本血吸虫 反义DNA 真核表达载体 序列标签法寻找日本血吸虫新基因 被引量:3 2002年 目的 寻找日本血吸虫新的疫苗候选分子 ,通过构建基因的反义核酸表达载体进行基因性质功能研究。 方法 运用表达序列标签法寻找并获得日本血吸虫新基因 ,对未知基因进行功能分析 ,并构建反义真核表达载体。 结果 获得表达序列标签 JAYL0 2 30的全长 c DNA序列 ,其推导氨基酸序列与人类和猪等生物的抗凋亡因子 1具有同源性 ,将之反向克隆入真核表达载体 p EGFP- N3中。 结论 表达序列标签法与生物信息技术结合有利于寻找新基因 。 李焱 余新炳 吴忠道 李晖婷 包俊英 邵筱关键词:日本血吸虫 表达序列标签 反义核酸 克隆 日本血吸虫RNA聚合酶Ⅱ转录因子SⅢ-p15亚单位的分离和序列分析 被引量:7 2002年 目的 分离和鉴定日本血吸虫 (Schistosomajaponisum ,Sj)新基因。 方法 应用表达序列标签 (Expressedse quencetags ,ESTs)法随机筛选SjcDNA文库 ,通过PCR直接序列测定技术和同源性比较对阳性插入片段进行鉴定。采用亚克隆技术和生物信息学分析对日本血吸虫RNA聚合酶Ⅱ转录延长因子SⅢ -p15亚单位进行结构和功能的鉴定。结果 我们从SjcDNA文库中随机筛选到一个cDNA克隆 ,它含有一个 371个碱基组成的阅读框 ,编码 118个氨基酸 ,与哺乳动物等的RNA聚合酶Ⅱ转录因子SⅢ - p15亚单位具有较高的同源性 ,且具有该因子所特有的氨基酸序列 ,表明我们已经获得了日本血吸虫RNA聚合酶Ⅱ转录因子SⅢ - p15亚单位。 结论 获得了日本血吸虫RNA聚合酶Ⅱ转录因子SⅢ - p15亚单位的全长cDNA序列 。 包俊英 余新炳 吴忠道关键词:日本血吸虫 CDNA 日本血吸虫未知基因的获得、鉴定和编码区的克隆 被引量:1 2001年 目的 寻找日本血吸虫未知基因 ,并对其进行鉴定和编码区克隆。方法 运用表达序列标签 (EST)法寻找日本血吸虫未知基因 ,对获得的表达序列标签运用生物学软件进行分析 ,根据同源基因序列推测其可能的功能 ,并将其克隆入真核表达载体 pEGFP N3中。 结果 获得 1个完整的日本血吸虫cDNA序列 (JAYL0 2 30 ) ,氨基酸同源性分析发现与其他生物的抗凋亡因子 1具有同源性 ,构建了重组克隆 pEGFP N3 JAYL0 2 30。 结论 EST法是一种快速发现和鉴定日本血吸虫未知表达基因的有效方法 ,有助于加速其全长cDNA的克隆。 李焱 余新炳 吴忠道 郑焕钦 李晖婷 包俊英关键词:日本血吸虫 表达序列标签 克隆 生物信息学 日本血吸虫未知基因JAYL0230全长cDNA的克隆和测序分析 被引量:2 2000年 为获取日本血吸虫未知基因全长cDNA,通过EST序列的同源性比较,发现日本血吸虫未知基因序列,将未知基因克隆的cDNA插入片段克隆到载体pBluscript(KS),并对其进行序列测定和序列分析。结果获得日本血吸虫未知基因JAYL0230的克隆,序列分析结果提示该cDNA序列含有一个402bp的完整阅读框序列。 李焱 余新炳 吴忠道 曹爱莲 郑焕钦 李晖婷 包俊英 邵筱关键词:日本血吸虫 未知基因 克隆 全长CDNA 测序分析 比较基因的表达分析 被引量:11 2001年 基因表达类型差异方面的研究是理解分化和发育机制的最有发展前景的方法之一。另外 ,与疾病相关的靶分子的确认为合理的药物干涉开创了新途径。最新的技术发展和改进在转录水平方面加速了对基因表达的分析。对目前所应用的方法的认识和理解是有效和成功基因筛查方法的关键之一。 包俊英 余新炳 吴忠道关键词:基因 血吸虫蛋白水解酶的研究进展 被引量:1 2001年 血吸虫通过分解宿主血红蛋白获得生长、发育和繁殖所需的氨基酸。一系列的血吸虫 蛋白水解酶参与了宿主血红蛋白的降解过程。本文综述了近年血吸虫组织蛋白酶B、L、D,血吸虫 豆酶及二肽酶系等方面的研究进展。 包俊英 吴忠道 余新炳关键词:血吸虫 蛋白水解酶 血红蛋白