孙雪丽
- 作品数：22 被引量：154H指数：6
- 供职机构：福建农林大学园艺学院园艺植物生物工程研究所更多>>
- 发文基金：国家现代农业产业技术体系建设项目国家自然科学基金博士后科研启动基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 香蕉水通道蛋白基因家族的密码子偏好性分析被引量：3
- 2018年
- [目的]研究香蕉水通道蛋白(AQP)基因家族密码子使用特点,为其基因编码规律及功能和分子进化研究提供依据。[方法]采用Codon W、SPSS、Origin等软件分析香蕉AQP基因家族密码子偏好性。[结果]从香蕉基因组中鉴定获得54条香蕉AQP基因,其中包括9条NIPs、21条PIPs、4条SIPs和20条TIPs。香蕉AQP基因家族A、T、C、G出现频率平均值分别为12.0%、15.9%、52.3%和37.4%,平均GC3s含量为75.8%,ENc值在31.0~60.7,平均值为42.9;SIPs、NIPs、PIPs和TIPs分别有2、5、7和6个最优密码子,且多以C结尾,少数以G结尾;ENc和CAI呈极显著负相关,说明密码子第3位碱基会影响基因表达能力。[结论]香蕉AQP家族基因密码子偏好性较弱,偏好使用G和C且以G/C结尾的密码子,PIPs和TIPs密码子偏好性受自然选择的影响较大,而NIPs和SIPs受碱基突变的影响较大。
- 屈蒙蒙孙雪丽郝向阳时梦谭秋月刘萍元梁蕾廖斌赖钟雄程春振
- 关键词：香蕉水通道蛋白密码子
- 龙眼Hsf基因家族全基因组鉴定及体胚发生过程中的表达分析被引量：6
- 2019年
- 基于龙眼基因组数据库对龙眼Hsf(DlHsf)基因家族进行全基因组鉴定,并对其基因结构、启动子作用元件和CpG岛分布情况、编码蛋白的理化性质和进化情况以及它们在不同体胚发生阶段和不同组织器官的表达情况进行研究,同时对靶定DlHsf的miRNA进行预测分析.结果表明:DlHsf基因家族共20个成员,基因结构高度保守.它们编码的蛋白具有典型的DNA结合域(DBD),且均为不含信号肽的不稳定蛋白.启动子分析发现,该基因家族成员的启动子除典型的热激元件(HSE)外,还含有MYB元件等与逆境胁迫及生长发育相关的元件,DlHsfA1d、DlHsfA9a、DlHsfA9b和DlHsfC1启动子存在典型的CpG岛.进化树分析表明DlHsf可分为DlHsfA、DlHsfB和DlHsfC三类. qRT-PCR结果表明,DlHsf在胚性阶段(EC)和球形胚阶段(GE)表达量较高,在不完全胚性紧实结构阶段(ICpEC)表达量较低,在龙眼体胚发育过程中呈现"V"状趋势,表明DlHsf可能主要在EC、GE阶段发挥作用.此外,DlHsf家族成员在花芽和花蕾中表达量较高,其次是在果肉中,推测DlHsfs可能与龙眼花发育等生长过程相关. psRNA Target预测结果表明DlHsf基因家族受到miRNA调控,且调控方式多样.本研究表明DlHsf功能多样,可能在龙眼生长发育、胁迫响应、DNA甲基化、组织器官特异表达等生物学过程中发挥作用.(图8表5参38)
- 王云彭丽云孙雪丽高玉莹陈晓慧陈裕坤林玉玲赖钟雄
- 关键词：龙眼
- 印度梨形孢提高香蕉抗热性的生理生化机制被引量：5
- 2020年
- 为研究印度梨形孢(Piriformospora Indica)对香蕉抗热性的影响及其生理生化机制,测定和比较了45℃高温处理0 h、3 h、6 h、12 h和24 h的有/无定殖的“天宝蕉”叶片中抗氧化活性物质活性或含量及激素含量变化情况.结果显示:高温处理后有/无P.indica定殖的香蕉叶片中H2O2含量呈先升后降的变化趋势,脯氨酸(Pro)和丙二醛(MDA)含量呈下降趋势,同时,P.indica定殖的香蕉叶片中H2O2、Pro和MDA含量均高于无定殖对照.高温处理下香蕉叶片超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化氢酶(CAT)、过氧化物酶(POD)和苯丙氨酸酶(PAL)活性均逐步升高,且P.indica定殖的香蕉叶片中这些指标均低于无定殖组.P.indica定殖的香蕉多酚氧化酶(PPO)活性在高温处理各时间点变化不显著,而无定殖组PPO活性在高温处理3 h时显著升高.高温处理前后P.indica定殖香蕉叶片中吲哚乙酸(IAA)和赤霉素(GA)含量均低于无定殖组,脱落酸(ABA)含量显著高于无定殖组,茉莉酸(JA)和水杨酸(SA)含量差异不大.上述结果表明P.indica可以通过提高香蕉叶片中H2O2、Pro、MDA和ABA含量以及抑制IAA和GA含量提高香蕉抗热能力.
- BODJRENOU Mahoudjro David孙雪丽MENSAH Raphael Anue李丹刘范田娜赖钟雄程春振
- 关键词：高温胁迫活性氧抗氧化物质植物激素
- 香蕉GLP基因家族全基因组鉴定及表达分析被引量：9
- 2020年
- 为揭示香蕉类萌发素蛋白(GLP)功能,对香蕉GLP基因家族(MaGLP)进行了全基因组鉴定,分析了基因结构、染色体分布和启动子顺式作用元件和转录因子结合位点(TFBS)分布情况以及编码蛋白的理化性质、保守基序、进化关系,同时基于转录组的结果研究它们在4℃和45℃处理的叶片、枯萎病菌FocTR4处理的根系以及自然成熟和乙烯催熟的不同成熟阶段的果实中的表达情况。结果显示:MaGLP家族共有44个成员,编码区CDS序列长度为567~2103 bp,分布于除10号染色体外的所有染色体上。大部分GLP基因包含1~2个外显子,多数GLP具有信号肽且主要定位在胞外。进化树分析发现,MaGLP可分为8个亚家族,其中亚家族M为香蕉特有。顺式作用元件和TFBS预测结果显示,MaGLP启动子区存在多种植物激素和逆境胁迫相关响应元件以及7种TFBS。MaGLP成员在香蕉不同组织部位中的表达水平差异较大且受多种胁迫调控。其中MaGLP5-1和MaGLP9-8对各种处理均有响应,MaGLP1-2和MaGLP9-4受高温、低温胁迫抑制,而Ma GLP9-6受高温、低温胁迫诱导,MaGLP5-4受高温和FocTR4调控,Ma GLP4-4仅响应高温胁迫。研究结果表明Ma GLP在香蕉抵御逆境过程中发挥重要作用。
- 刘范田娜孙雪丽刘嘉鹏伍俊为黄玉吉程春振
- 关键词：香蕉逆境响应基因表达
- 水培炼苗对香蕉组培移栽苗生长及光合特性的影响被引量：4
- 2020年
- 为了解采用改良Hoagland溶液进行水培炼苗对香蕉组培苗生长和光合特性的影响,以‘巴西蕉’组培苗为材料,进行直接移栽(G1)、正常炼苗移栽(G2)和水培一周后移栽(G3)处理,比较3组香蕉苗形态、生理特性和生长相关指标的差异.结果显示,与G1和G2组相比,G3组香蕉幼苗根长、地上部和地下部干重、根冠比极显著增加(P<0.01),根数显著增多(P<0.05).移栽后4个月,G3组株高、叶宽、叶长极显著大于G2组(P<0.01),大于G1组,但差异不显著.植株叶片叶绿素含量和根系活力由高到低均为G3组、G2组、G1组,且G3组极显著高于其他两组(P<0.01).移栽后4个月,G3组叶片叶绿素a、叶绿素b、总叶绿素和类胡萝卜素含量与G1组相比分别增加49.0%、50.1%、49.4%和58.5%,与G2组相比分别增加23.98%、28.38%、25.43%和26.77%;G3组根系活力分别约为G1和G2组的3.04倍和1.86倍;G3组植株净光合速率、蒸腾速率、气孔导度、实际光合效率(YII)、电子传递速率(ETR)、光化学猝灭系数(q_P)也均极显著高于其他两组(P<0.01).本研究表明水培炼苗可以提高香蕉苗根系活力,加快植株生长,提高叶片叶绿素含量和光合效率,增强植株生物量的积累,说明水培炼苗具有应用于香蕉种苗繁育的巨大潜力.
- 田娜刘范孙雪丽车婧如项蕾蕾赖钟雄程春振
- 关键词：香蕉根系活力光合特性
- LED补光对香蕉组培苗增殖和生理生化指标的影响被引量：6
- 2020年
- 为研究补充不同光质的LED光源对香蕉组培苗增殖和相关生理生化指标的影响,以‘天宝蕉’为材料,通过设置普通荧光+LED红光(R)、普通荧光+LED蓝光(B)、普通荧光+LED绿光(G)、普通荧光+LED白光(W)、普通荧光+LED暖白光(WW)、普通荧光+LED暖黄光(WY),对照组普通荧光7种处理,比较不同LED补光对香蕉组培苗的增殖率、相关生理指标、叶绿素含量及叶绿素荧光参数的影响.结果显示,WY处理下香蕉组培苗的增殖系数最大,B处理下香蕉苗的增殖系数最小;R处理下,植株高度最大,B处理下,植株假茎最粗,WW处理下,有最大的根长,W处理下根数、根粗、叶数、叶宽、叶长的数值最大,同时鲜重和含水量最高,壮苗系数最优.与CK相比,R、B和G处理会降低叶绿素以及类胡萝卜素含量,而补充LED白光可以提高叶绿素以及类胡萝卜素含量.此外,LED补光,尤其是R、W和G补光会引起香蕉组培苗叶片Fv/Fo、Fv/Fm和NPQ参数的显著增加和Y(Ⅱ)、ETR、和qP等参数的降低.本研究表明在增殖培养阶段补充LED暖黄光,香蕉组培苗的增殖率最高;在生根培养阶段补充LED白光,香蕉组培苗的叶绿素含量、chla/chlb比值、类胡萝卜素含量最大,同时光合效率和壮苗系数最高;结果可为香蕉组培苗增殖和生根阶段的光质选择奠定基础.
- 项蕾蕾李丹孙雪丽田娜刘范付帅陈裕坤林玉玲程春振王天池赖钟雄
- 关键词：香蕉增殖系数生理生化指标叶绿素含量叶绿素荧光
- 香蕉MaHY5基因密码子的偏好性分析被引量：5
- 2020年
- 为了解香蕉MaHY5基因密码子的使用特性,本研究利用生物信息学工具,分析了香蕉MaHY5基因的密码子使用偏好性,并分别与其它31个物种的HY5基因以及模式生物基因组进行比较。结果显示,香蕉MaHY5基因密码子选择偏好性弱且偏好以G/C结尾;自然选择的作用对香蕉MaHY5密码子偏性影响最大;多数双子叶植物HY5密码子可能偏好A/T结尾,而单子叶植物HY5密码子可能偏好G/C结尾;基于HY5的CDS序列聚类结果比密码子使用频率分类结果更能反映物种间的进化规律;大肠杆菌原核表达系统更适用于香蕉MaHY5的异源表达试验,拟南芥可能为香蕉MaHY5转基因的最为理想受体。本研究分析了香蕉MaHY5基因及其他物种中HY5基因的密码子偏好性与进化关系,同时筛选最适合MaHY5基因异源表达宿主及遗传转化受体,为深入探究MaHY5基因的功能提供理论基础。
- 项蕾蕾孙雪丽刘范田娜付帅程春振王天池赖钟雄
- 关键词：香蕉密码子偏好性基因功能
- 三明野生蕉和天宝蕉对Foc TR4侵染早期应答的差异被引量：6
- 2017年
- 以GFP标记的香蕉枯萎病菌Foc TR4作为病原菌,比较了水培条件下Foc TR4对"天宝蕉"和三明野生蕉的早期侵染情况.研究表明,Foc TR4在"天宝蕉"韧皮部的定殖明显早于三明野生蕉.枯萎病菌感染香蕉后会诱发香蕉细胞内活性氧爆发和激活寄主抗氧化系统.通过研究水培和土培条件下两种香蕉种质接种枯萎病菌后根系超氧化物歧化酶(SOD)变化情况,发现三明野生蕉根系SOD活性高于"天宝蕉",三明野生蕉感染枯萎病后根系SOD活性增强,而"天宝蕉"根系SOD活性下降,说明三明野生蕉的耐枯萎病能力可能与其根系较高和早期上调的SOD活性有关.
- 程春振马文昇刘炜婳张梓浩齐全孙雪丽张永艳赖钟雄
- 关键词：香蕉枯萎病绿色荧光蛋白超氧化物歧化酶
- 香蕉枯萎病防控和抗病育种研究进展被引量：37
- 2018年
- 香蕉是世界四大水果之一和一些热带地区的主要粮食作物。病害的发生严重制约了香蕉产业的发展,其中由尖孢镰刀菌古巴专化型引起的香蕉枯萎病是香蕉产业全球毁灭性真菌病害,目前仍无有效、彻底的根治措施。随着该病害在全球范围内的迅速蔓延,香蕉枯萎病的防控目前已成为香蕉生产和研究领域最为关注的热点。笔者重点对近年来香蕉枯萎病的防治、抗病育种以及香蕉抗病基因和枯萎病菌致病基因的挖掘等方面的研究进行概述,以期为更加深入进行香蕉枯萎病的研究和防治提供参考。
- 孙雪丽郝向阳王天池赖钟雄程春振
- 关键词：香蕉枯萎病抗病育种
- 福建非洲菊产区根腐病病原菌的分离与鉴定被引量：13
- 2018年
- 福建清流是我国重要的非洲菊产区,近年来该地区根腐病为害严重。本研究以表现出根腐病症状的非洲菊病根为材料进行了病原菌分离。经形态学和分子生物学鉴定,分离获得尖孢镰刀菌、隐地疫霉菌、炭疽菌、腐皮镰刀菌等多种致病菌,其中尖孢镰刀菌和隐地疫霉数量最多。经柯赫氏定理验证确定隐地疫霉为导致福建清流地区根腐病发生的主要病原菌。本研究可为福建清流地区非洲菊根腐病防治策略的选择提供依据,同时可为今后非洲菊-根腐病互作机理、拮抗菌的筛选研究奠定基础。
- 郝向阳林觅孙雪丽焦元辰杨春晓赖钟雄王天池程春振
- 关键词：非洲菊根腐病
