刘成
- 作品数：10 被引量：56H指数：4
- 供职机构：云南省烟草公司更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金引进国际先进农业科技计划中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学轻工技术与工程矿业工程更多>>
- 番茄WOX转录因子家族的鉴定及其进化、表达分析被引量：37
- 2016年
- WUSCHEL相关的同源异型盒(WUSCHEL-related homeobox,WOX)是一类植物特异的转录因子家族,具有调控植物干细胞分裂分化动态平衡等重要功能。本研究利用番茄(Solanum lycopersicum)基因组数据,通过建立隐马尔科夫模型并进行检索,鉴定了番茄10个WOX转录因子家族成员。多序列比对发现,番茄WOX转录因子家族成员具有高度保守的同源异型结构域;以拟南芥WOX转录因子家族成员序列为参照,通过邻接法、极大似然法、贝叶斯法重建了系统发育树,三者呈现出类似的拓扑结构,番茄和拟南芥WOX转录因子家族共25个成员被分为3个进化支(Clade)和9个亚家族(Subgroup);利用MEME和GSDS对WOX转录因子家族成员的蛋白保守结构域和基因结构进行了分析,同一亚家族内的WOX转录因子家族成员的保守结构域的种类、组织形式以及基因结构具有高度的一致性;利用Perl和Orthomcl对家族成员的染色体定位和同源性关系进行分析,结果表明串联重复的Sl WOX3a和Sl WOX3b可能来源于一次复制事件;利用番茄转录组数据和q RT-PCR进行表达分析,结果显示家族成员在不同组织中的表达存在差异,暗示了WOX家族的不同成员在功能上可能具有多样性。本研究对番茄WOX转录因子家族成员进行GO(Gene Ontology)注释和比较分析,结果表明该家族成员作为转录因子,可能在组织器官发育、细胞间通讯等过程中发挥作用。
- 李晓旭刘成李伟张增林高晓明周慧郭永峰
- 关键词：番茄生物信息学分析
- 普通烟草SBP转录因子家族的全基因组鉴定及其进化和表达分析
- SBP转录因子家族作为植物特异性的转录因子具有重要的生物学功能,广泛参与花和果实发育等诸多生命过程。利用普通烟草(Nicotiana tabacum)TN90基因组数据,通过隐马尔科夫模型检索,SMART和Pfam分析,...
- 刘成李晓旭苏玉龙郭永峰
- 关键词：生物信息学分析普通烟草
- 文献传递
- 普通烟草NtNAC072基因的克隆、鉴定及表达模式分析被引量：8
- 2019年
- NAC转录因子是一类植物特有的转录因子,在植物生长发育、衰老及生物或非生物胁迫中发挥着重要的调控作用。为明确烟草转录因子NtNAC072的生物学功能,在普通烟草中克隆了NtNAC072基因,利用生物信息学分析结合亚细胞定位和转录激活实验对该基因功能进行初步鉴定,并通过实时荧光定量PCR方法研究基因的表达模式。结果表明,NtNAC072转录因子N端有典型的NAC结构域并且较为保守;进化分析表明,普通烟草中NtNAC072与拟南芥AtNAC072同源;亚细胞定位和转录激活实验结果表明,NtNAC072定位于细胞核中并具有转录激活活性;表达模式分析发现,NtNAC072基因表达具有特异性,其在衰老叶片中表达量较高并且受干旱胁迫、盐胁迫、脱落酸处理诱导。因此,作为NAC型转录因子NtNAC072可能在烟草叶片衰老、落黄以及非生物逆境应答中发挥着重要的调控作用。
- 李晓旭郭存刘成李虹李伟蒋勋郭永峰
- 关键词：烟草NAC转录因子叶片衰老非生物胁迫
- 一种生物质燃料自动填料装置
- 本实用新型属于燃料填料装置领域，具体涉一种生物质燃料自动填料装置，包括生物质燃料储存室、螺旋输送机A、螺旋输送机B和螺旋输送机C，生物质燃料储存室的上方设置有人工填料口，所述螺旋输送机A的入料口设置在所述生物质燃料储存室...
- 张军刚袁国庆解燕夏贤仁夏荣帅杨美丽杨森周玉思王全贞刘成
- 普通烟草RLP类受体蛋白家族成员的鉴定与进化、表达分析被引量：2
- 2017年
- 类受体蛋白(receptor-like proteins,RLPs)作为一类细胞表面受体,广泛存在于高等植物中,参与调控植物生长发育和抗逆等过程。本研究以普通烟草(Nicotiana tabacum)TN90数据库为基础,构建隐马尔科夫模型进行检索,鉴定了普通烟草RLP家族成员;采用邻接法构建系统发育树进行系统进化分析;利用GSDS对RLP家族成员的基因结构进行了分析;利用普通烟草TN90转录组数据,分析RLP基因家族成员的表达情况;最后对普通烟草RLP家族成员进行GO注释分析。结果表明,在普通烟草中共鉴定出70个RLP家族成员,各成员的氨基酸序列长度和等电点差异较大;系统进化与基因结构分析表明,普通烟草RLP家族成员划分为6个亚家族,基因结构较为简单;转录组分析结果显示,RLP基因家族成员在不同组织和发育时期的表达有较大差异,个别成员在叶片衰老时期表达量较高;GO注释结果表明,RLPs在植物的生长发育、逆境响应等过程中发挥作用。本研究结果将为普通烟草RLP基因功能分析和利用奠定基础。
- 李奎李晓旭刘成段奇佳郭永峰
- 关键词：普通烟草生物信息学分析
- 普通烟草SBP转录因子家族的全基因组鉴定及其进化和表达分析被引量：10
- 2015年
- SBP转录因子家族作为植物特异性的转录因子具有重要的生物学功能,广泛参与花和果实发育等诸多生命过程。利用普通烟草(Nicotiana tabacum)TN90基因组数据,通过隐马尔科夫模型检索,SMART和Pfam分析,鉴定了普通烟草SBP转录因子家族成员;通过多序列比对鉴定并分析了普通烟草SBP结构域的结构特征;通过邻接法、极大似然法进行了系统发育分析;分别利用GSDS和MEME对SBP转录因子家族成员的基因结构和蛋白保守结构域进行了分析;利用普通烟草TN90转录组数据分析了SBP转录因子家族成员在不同组织和时期的表达情况,并对鉴定出的SBP转录因子家族成员进行了GO注释分析。结果表明,普通烟草基因组编码32个SBP转录因子家族成员,氨基酸序列长度差异较大;系统发育分析表明,所有的SBP转录因子家族成员可分为8个亚家族。转录组数据显示,SBP基因家族成员在不同组织和时期中表达迥异,但在花器官中均有较高的表达量。GO注释结果表明,该家族成员作为转录因子,在植物的生长发育、逆境响应等过程中发挥作用。本研究为烟草及其他植物中SBP转录因子家族基因的鉴定和功能研究提供了基础。
- 刘成李晓旭苏玉龙郭永峰
- 关键词：生物信息学分析普通烟草
- 普通烟草SBP转录因子家族的全基因组鉴定及其进化和表达分析
- SBP转录因子家族作为植物特异性的转录因子具有重要的生物学功能,广泛参与花和果实发育等诸多生命过程.利用普通烟草(Nicotianatabacum)TN90基因组数据,通过隐马尔科夫模型检索,SMART和Pfam分析,鉴...
- 刘成李晓旭苏玉龙郭永峰
- 关键词：生物信息学分析普通烟草
- 烟叶落黄过程中烟碱代谢规律及相关基因表达分析被引量：4
- 2017年
- 为探究烟草叶片落黄衰老过程中生物碱组分变化及代谢相关基因表达情况,以红花大金元为材料,气相色谱-质谱联用法测定中部烟叶生物碱含量,利用已有的烟草叶片衰老转录组数据(RNA-seq),分析叶片衰老成熟期烟碱代谢相关基因的表达水平,同时实时荧光定量PCR验证基因表达。结果显示,烟草进入成熟衰老期,叶片中烟碱、去甲基烟碱、新烟草碱、麦斯明等生物碱含量逐渐升高,烟碱转运蛋白基因JAT1、NUP1,烟碱转化基因CYP82E2、CYP82E4,烟碱合成基因ADC1、ODC2、BBL2以及烟碱代谢调控基因COI1、JAZ1、MYC2、MYC3呈现上调表达,而调控基因MTHFR1下调表达。差异表达基因协同调控烟碱代谢过程,影响衰老叶片中的烟碱合成与积累。
- 张震彪李伟杜咏梅张海良刘成李晓旭郭永峰
- 关键词：烟碱转录组实时荧光定量PCR
- 马铃薯SBP转录因子家族的全基因组鉴定及进化和表达分析被引量：1
- 2018年
- SBP转录因子家族是植物特有的一类转录因子家族,主要参与植物生长、发育和多种生理生化过程的信号传导。马铃薯是一种重要的经济和粮食作物,但马铃薯SBP转录因子家族的分析尚未见报道。本研究利用生物信息学技术,对马铃薯基因组进行分析,在马铃薯中共鉴定出16个SBP转录因子,并对其系统进化关系、编码基因结构以及基因表达模式进行研究。系统进化分析表明,马铃薯和拟南芥SBP转录因子家族成员共31个成员,被分成7个亚家族(Subgroup);结构分析表明,同一亚家族内的成员的蛋白保守结构域的类别、组成以及编码基因的基因结构具有高度的相似性,但不同亚家族的成员差异较大;基因表达分析表明,编码SBP转录因子家族成员的基因表达模式具有明显的时空特异性,且成员对不同的激素处理有不同的响应模式。本研究为进一步研究马铃薯SBP转录因子的功能以及可能的调控机制研究提供了理论依据。
- 郭存李晓旭刘成李奎李奎
- 关键词：马铃薯拟南芥生物信息学
- 普通烟草SBP转录因子家族的全基因组鉴定及其进化和表达分析
- SBP转录因子家族作为植物特异性的转录因子具有重要的生物学功能,广泛参与花和果实发育等诸多生命过程。利用普通烟草(Nicotiana tabacum)TN90基因组数据,通过隐马尔科夫模型检索,SMART和Pfam分析,...
- 刘成李晓旭苏玉龙郭永峰
- 关键词：生物信息学分析普通烟草
