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马海涛

作品数:6 被引量:102H指数:6
供职机构:大连水产学院生命科学与技术学院更多>>
发文基金:国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金国家公益性行业科研专项更多>>
相关领域:农业科学生物学更多>>

文献类型

  • 6篇中文期刊文章

领域

  • 5篇农业科学
  • 1篇生物学

主题

  • 3篇微卫星
  • 2篇养殖
  • 2篇微卫星分子标...
  • 2篇分子标记
  • 1篇性状
  • 1篇养殖群体
  • 1篇生物素
  • 1篇史氏鲟
  • 1篇群体遗传结构
  • 1篇微卫星分析
  • 1篇镜鲤
  • 1篇基因
  • 1篇基因型
  • 1篇基因型分析
  • 1篇虹鳟
  • 1篇虹鳟养殖
  • 1篇繁殖
  • 1篇繁殖群
  • 1篇繁殖群体
  • 1篇POLYMO...

机构

  • 5篇中国水产科学...
  • 3篇大连水产学院
  • 1篇上海水产大学
  • 1篇上海海洋大学
  • 1篇国家级天津市...

作者

  • 6篇马海涛
  • 5篇孙效文
  • 5篇于冬梅
  • 3篇鲁翠云
  • 2篇匡友谊
  • 2篇李大宇
  • 2篇朱晓东
  • 1篇杨建新
  • 1篇沈俊宝
  • 1篇金万昆
  • 1篇常玉梅
  • 1篇于东梅

传媒

  • 2篇水产学报
  • 1篇上海水产大学...
  • 1篇动物学杂志
  • 1篇Zoolog...
  • 1篇大连水产学院...

年份

  • 1篇2008
  • 5篇2007
6 条 记 录,以下是 1-6
排序方式:
草鱼基因组中微卫星分子标记的制备及筛选被引量:10
2007年
采用新型的生物素-磁珠吸附微卫星富集法与传统的放射性同位素杂交法相结合的方式,研究了草鱼(Ctenopharyngodon idella)基因组中存在的微卫星资源。结果,从1 000个细菌中,挑出90个阳性克隆,把其中45个进行测序分析,在这些序列中共含有68个微卫星核心序列,有55个含有重复次数大于5次的微卫星核心序列。其中,单一型标记49个,占72%,包括CA重复单元共22个,GT重复单元共18个,其他重复单元为9个;在72%的单一型标记中,完美单一型微卫星标记为44个,占65%。另外,混合型标记共19个,13为完美混合型;在所有微卫星标记中,CA重复类型最普遍,依次为GT、GA等。在68个微卫星标记中,有15个依据引物设计原理设计了引物。
马海涛鲁翠云于冬梅孙效文
关键词:草鱼生物素磁珠微卫星
样本容量对养殖群体内主要遗传结构分析参数的影响被引量:12
2008年
用微卫星标记评估养殖群体的遗传结构,设置8个取样量梯度,5个标记量梯度,统计分析了各遗传参数的变化。结果:群体等位基因数(A)随样本量的增加而呈现上升趋势,但上升幅度由0.6667-0.9615(10〈n〈30)下降到0.2308-0.3333(30〈n〈50);46.15%的位点出现高频率等位基因即等位基因纯合化趋势,这可能与养殖群体长期受选择压力的影响有关。等位基因纯合化使多数位点的有效等位基因数(Ae)、期望杂合度(Ho)及多态信息含量(PIC)在样本量大于40时,在多个标记量梯度其变动范围均变小,并出现平台现象。样本量、微卫星标记的数量和多态性水平对群体遗传结构均有较大的影响,建议在用微卫星进行群体遗传评估时,标记的数量在20个以上,样本容量大小在40-50之间较为适合。
鲁翠云金万昆孙效文李大宇朱晓东马海涛于东梅杨建新
关键词:养殖群体
用磁珠富集法制备史氏鲟的微卫星分子标记被引量:8
2007年
采用生物素-磁珠富集法与放射性同位素杂交法相结合的方式,研究了史氏鲟Acipenser schrencki基因组的微卫星资源。结果表明:在得到的1 400多个细菌中,有300多个阳性克隆,将其中96个进行测序,在这些序列中共有115个微卫星核心序列,含99个重复次数大于10次的微卫星核心序列。其中完美型标记40个,占40.4%;非完美型标记52个,占52.5%;混合型标记共7个,占7.1%。随机选取侧翼序列较长的50个序列,依据引物设计原理设计引物50对,经3次PCR筛选,有28对引物可得到稳定的特异性扩增;同时利用史氏鲟的6个个体检验了这些位点的多态性,并统计了等位基因数,发现有22对等位基因具有良好的多态性。
于冬梅匡友谊马海涛梁利群孙效文
关键词:磁珠富集史氏鲟微卫星
三个虹鳟养殖群体遗传结构的微卫星分析被引量:10
2007年
利用20个微卫星标记对3个虹鳟(Oncorhynchus mykiss)养殖群体进行遗传结构分析。结果表明,(1)3个群体检测的平均等位基因数为3·6~4·1,平均观测杂合度为0·5224~0·6328,平均期望杂合度为0·4736~0·5522,平均多态信息含量为0·4354~0·5084,说明这几个群体多态性属于偏高水平,遗传多样性高。通过d值,确定了Hard-Weinberg平衡的偏离情况,发现AY039638、AY039646在3个群体中都表现为不平衡。对3个群体的遗传距离进行了估算,并进行聚类分析,本溪的两个群体先聚为一支,再与渤海群体相聚,显示出明显的地理特征。(2)本溪虹鳟群体在位点AF352770出现部分等位基因消失的现象;AF352754在本溪群体中表现为位点消失,可作为区分本溪群体和渤海群体的分子标记。(3)综合评价3个群体,渤海站虹鳟群体的遗传多样性最高,与前人研究结果一致。
于冬梅马海涛孙效文
关键词:虹鳟微卫星
镜鲤两个繁殖群体的遗传结构和几种性状的基因型分析被引量:39
2007年
利用扩增效果好、在群体中具有多态性的28个微卫星标记,检测国家换新良种场的镜鲤繁殖群体和黑龙江水产研究所松浦实验场的镜鲤繁殖群体的遗传组成,计算了两个群体的有效等位基因数,期望杂合度和多态信息含量等遗传参数,换新与松浦两个群体的有效等位基因数分别为2.874和3.102,期望杂合度分别是0.565和0.603,多态信息含量分别是0.534和0.568;遗传结构分析研究结果表明这两个群体的多样性较高,信息含量丰富,具有进一步筛选出优良品种的遗传基础。但连锁不平衡分析表明这两个群体在较大的选择压力下,已严重偏离Hardy-Weniberg平衡,要保持群体的优良性状相关的遗传基础,应该在进一步的选种中注意增加群体的遗传多样性。也用28个基因座的不同基因型与换新208个亲本的体重值进行了连锁分析,得到12个与镜鲤体重相关的基因型,其中紧密相关的基因型3个;分析了一些严重偏离平衡的基因型,并分析了出现这种现象的可能原因,同时探讨了一些基因型与胚胎期致死或易感病基因连锁的可能性。为描述基因型偏离程度,创造了基因型偏离指数,并用其对群体中一些基因型出现的偏离现象进行了探讨。
孙效文鲁翠云匡友谊金万昆沈俊宝朱晓东李大宇马海涛于冬梅
关键词:镜鲤繁殖群体基因型
Microsatellite Variations Among Four Populations of Eriocheir sinensis被引量:23
2007年
Using microsatellite markers, we analysed genetic polymorphism in four populations of Eriocheir sinensis, sampled from Jiangsu, Anhui, Liaoning and Tianjin. Twenty-four pairs of primers were used to amplify the target fragments ranging from 80 bp to 445 bp, which included 16 pairs designed in our laboratory and eight pairs published internationally. Two to 10 alleles per locus in four populations were amplified, and there were 155 alleles in all populations. The average number of alleles per locus was 6.458. The average number of effective alleles per locus (Ne) was 4.349l to 4.7234; the average observed heterozygosity (Ho) was 0.5690 to 0.6722; and the average expected heterozygosity (He) was 0.7238 to 0.7546. Hardy-Weinberg equilibrium analysis (Z2 test, P 〈 0.05) revealed that seven loci in the four populations were in equilibrium. The genetic distances between the four populations were calculated and revealed that the Anhui, Jiangsu and Tianjin crabs belong to a Yangtse River population, while the Liaohe crabs form another branch.
马海涛常玉梅于冬梅孙效文
关键词:MICROSATELLITE
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