郭敏
- 作品数：16 被引量：37H指数：4
- 供职机构：河北科技师范学院动物科技学院更多>>
- 发文基金：河北省自然科学基金河北省应用基础研究计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生更多>>
- 不同物种TYR基因编码蛋白结构及功能的生物信息学分析被引量：1
- 2017年
- 利用生物信息学方法对13个物种TYR基因编码蛋白的理化性质,以及一级、二级、三级结构和亚细胞定位进行预测和分析,同时拟构建13个物种TYR基因的系统发育树。结果表明:TYR基因编码产物为不稳定蛋白(貉子除外),整条多肽链表现出亲水性。二级结构主要为α螺旋、β折叠,β转角区域分布少且散,均存在信号肽和跨膜区,可以判断TYR基因编码蛋白是定位于生物膜上的膜蛋白或分泌蛋白,主要在嘌呤和嘧啶、运输和结合、电压门控离子通道及转录中发挥作用。各物种TYR基因编码产物主要定位于内质网、高尔基体以及细胞质膜。除原鸡外,其他物种该蛋白均存在跨膜区,貉子有2个跨膜区域。各物种系统发育树与动物学进化观点基本一致。
- 郭敏李祥龙
- 关键词：物种酪氨酸酶基因毛色蛋白质结构生物信息学
- TYR基因及其与动物毛色关系的研究进展被引量：13
- 2017年
- 毛色是毛皮动物重要的品种特征之一,是一种易于观察的表型性状。黑色素对动物毛色的形成起至关重要的作用。在动物体内酪氨酸在酪氨酸酶(TYR)的催化作用下,经由DOPA、多巴醌、吲哚醌等形式最后生成黑色素。动物毛色的形成主要与黑色素细胞中合成的两种色素(真黑色素、褐黑色素)比例有关。黑色素细胞中色素的合成受多个基因和信号通路调控。动物毛色之所以具有多样性,也是由于这些基因调控所致。在众多的调控基因中,其中目前研究较多的主要有黑素皮质素受体1(MC1R)、剌鼠信号蛋白基因(ASIP)、TYR家族(TYR、TYRP1、TYRP2)等,各基因间相互作用形成不同的毛色。文章简要介绍黑色素形成的机理及概况,重点对TYR基因结构和功能及其在多种动物毛色方面的研究现状进行综述,以便为动物毛色选育提供理论依据。
- 郭敏张大山李祥龙
- 关键词：黑色素毛色基因调控
- 北极狐酪氨酸酶基因cDNA序列分析及启动子预测
- 2018年
- 为了探明北极狐酪氨酸酶（tyrosine,TYR）基因核心启动子活性区、转录因子结合位点、基因编码蛋白结构及功能,通过RT-PCR扩增及基因测序技术首次从北极狐皮肤组织中获得TYR基因c DNA序列,全长4 300 bp（包括5＇侧翼区2 681 bp,CDS区1 593 bp,3＇侧翼区26 bp）。生物信息学分析结果表明：北极狐TYR基因5＇侧翼区存在潜在的启动子区域,并发现TATA框和CAAT框等调控元件及髓细胞增生原癌基因（Myc）、胰十二指肠同源盒1（Pdx1）、V-Myb髓细胞组织增生病毒癌基因同源物（Myb）、E26转录因子1（Ets1）、特异性蛋白1（Sp1）和TATA盒结合蛋白（TBP）等多种转录因子。北极狐TYR基因编码蛋白的长度为530个氨基酸残基,编码蛋白是定位于生物膜上的不稳定可溶性亲水蛋白质,该蛋白以无规卷曲为主,主要参与信号转导和转录,存在跨膜区域和信号肽。北极狐与其他物种的系统进化树分析提示北极狐与家犬的遗传亲缘关系最近,不同物种间亲缘关系与生物进化观点基本一致,符合动物学分类。
- 郭敏牛迪刘艳军彭永东张文香刘铮铸冯敏山李祥龙巩元芳
- 关键词：北极狐酪氨酸酶基因生物信息学分析启动子转录因子结合位点
- 不同保存温度对蓝狐精子活率的影响被引量：1
- 2018年
- 为了确定蓝狐精液的体外最适保存温度,试验将蓝狐新鲜精液稀释后,平均分成4组,各组依次在常温、4℃、10℃和17℃保存,每组分别在存放0小时、12小时、24小时、36小时、44小时和50小时后检测精子活率。结果表明：各温度存放0小时时各组精子活率差异不显著（P〉0.05）,存放12小时和24小时时不同温度精子活率差异显著（P〈0.05）;两时间段均是10℃存放的精子活率最高,分别为0.603±0.066,0.561±0.050。存放36小时、44小时和50小时时,不同温度精子活率差异显著（P〈0.05）,这三个时间段均是4℃存放的精子活率最高,分别为0.442±0.039,0.429±0.044,0.396±0.049。
- 牛迪刘艳军郭敏张磊王建涛巩元芳刘铮铸
- 关键词：蓝狐温度体外保存精子活率人工授精
- 北极狐TYRP1基因启动子活性及转录调控区域分析被引量：2
- 2018年
- 通过分析调控北极狐毛色基因TYRP1启动子核心区域及转录因子,为探究该基因的表达调控机制提供理论依据,并为狐狸毛皮品质分子育种和彩色毛皮新材料的创制提供思路。通过基因组测序技术获得了北极狐TYRP1基因启动子序列,并利用生物信息学方法对北极狐TYRP1基因核心启动子区域和转录因子结合位点进行预测;以北极狐基因组DNA为模板,PCR扩增北极狐TYRP1基因不同长度的启动子缺失片段克隆至pGL3-Basic载体,将重组质粒瞬时转染到A375和293T细胞,利用双荧光素酶基因检测仪进行活性验证。结果表明,成功构建了9个含有不同长度启动子片段的重组质粒,经双荧光素酶活性检测发现北极狐TYRP1基因-699/+35区域为核心启动子区域,-699/-93区域存在着TYRP1基因正调控元件。生物信息学预测分析发现该区域存在4个转录因子结合位点;利用重叠延伸PCR技术成功构建了4个突变载体,经双荧光素酶活性检测发现4个突变载体活性均显著下降(P<0.05),表明这4个转录因子是北极狐TYRP1基因转录调控的正调控元件。本研究确定了北极狐TYRP1基因启动子核心区域-699/+35,Sp1(-656/-646)、CREB(-598/-589)、Sp1(-539/-530)和Sp1(-163/-154)为北极狐TYRP1基因转录的正调控元件。
- 郑晓宁王瑞宁王亚琪郭敏巩元芳刘铮铸彭永东李祥龙
- 关键词：北极狐启动子点突变转录调控
- 山羊Agouti基因启动子活性区域探究
- 2015年
- 对前期拼接获得的12 847 bp山羊Agouti基因序列（EF587236和JN651404）进行启动子活性区域预测,确定候选启动子区为6 450~7 100 bp,得到一个长度为2 537 bp的DNA片段,在该区域发现一个典型转录因子结合位点TATA框,并预测到HSF,SYR,GATA-1,Nkx-2,ADR1等多个转录因子结合位点;山羊基因组序列（登录号：AJPT01136617.1）中有两段序列与牛的预测启动子promoter A和promoter B同源性较高,据此设计引物扩增目的片段,同时构建12个荧光素酶报告基因质粒,瞬时转染人皮肤黑素瘤细胞A375和293T细胞检测目的片段是否具有Agouti基因启动子活性。结果表明,所构建的目的片段质粒与阴性对照相比无显著差异,说明所获得的目的片段不具有启动子活性。
- 张永改郭敏张大山刘伟兰李祥龙周荣艳李兰会
- 关键词：山羊启动子
- 低温保存蓝狐精液稀释剂配方筛选
- 2018年
- 为了获取低温保存蓝狐精液的最适稀释剂,试验设计了3种不同精液稀释剂配方,并与常用稀释剂进行对比,1组为对照组,2组为0.5×（G＋柠）组,3组为（G＋柠）组,4组为2×（G＋柠）组,G为葡萄糖,柠为柠檬酸钠溶液。分别在4℃存放0,12,24,36,48 h后检测精子活率。结果表明：在保存温度为4℃的情况下,存放0小时时,第4组的精子活率最高,与其他各组差异显著（P〈0.05）;存放12小时时,不同稀释剂的精子活率差异不显著（P〉0.05）;存放24小时时,第2组的精子活率最高,但与其他各组差异不显著（P〉0.05）;存放36小时时,第2组的精子活率最高,与第3组、第4组差异显著（P〈0.05）,与第1组差异不显著（P〉0.05）;存放48小时时,第2组的精子活率最高,与其他各组差异显著（P〈0.05）。
- 牛迪郭敏刘艳军张磊巩元芳刘铮铸
- 关键词：蓝狐人工授精体外保存稀释剂
- 北极狐MITF-M基因启动子活性及转录调控元件的分析被引量：1
- 2020年
- 为了探究MITF-M基因对狐狸毛色的遗传调控机制,利用PCR扩增技术对北极狐MITF-M基因启动子区6个缺失片段(2 279,1 738,1 313,1 040,524和236 bp)进行扩增,利用双荧光素酶报告基因检测技术对该基因启动子表达载体转染细胞(A375和293T)的相对活性进行检测,通过在线软件对核心启动子区转录因子结合位点进行预测,利用重叠延伸PCR和双荧光素酶报告系统检测技术对预测出来的转录因子结合位点进行点突变活性分析。结果表明,北极狐MITF-M基因启动子区524 bp(-510 bp/+13 bp)处活性最高,预测发现-510 bp/-222 bp区域存在CREB(-312 bp/-319 bp)、Sp1(-295 bp/-307 bp)和Sp1(-249 bp/-262 bp)转录因子结合位点,这3个转录因子结合位点突变后能使北极狐MITF-M基因的启动子活性上升。综上,北极狐MITF-M基因核心启动子区在-510 bp/-222 bp区域,转录因子结合位点CREB(-312 bp/-319 bp)、Sp1(-295 bp/-307 bp)和Sp1(-249 bp/-262 bp)对北极狐MITF-M基因的转录激活起到一定的调控作用。
- 郭敏李寒妹王瑞宁郑晓宁刘铮铸彭永东巩元芳李祥龙
- 关键词：北极狐启动子活性转录调控元件
- 蓝狐MITF-M基因序列扩增及生物信息学分析被引量：2
- 2018年
- 试验旨在研究蓝狐MITF-M基因核心启动子活性区、转录因子结合位点、基因编码蛋白结构及功能,为探究该基因的表达调控机制提供理论依据。从成年蓝狐背部皮肤组织中采集1cm×1cm样品,采用RT-PCR扩增及测序技术首次获得MITF-M基因序列3 880bp(包括5′侧翼区2 262bp、CDS区1 260bp、3′侧翼区358bp),编码419个氨基酸残基。生物信息学分析结果显示,蓝狐MITF-M基因5′侧翼区存在潜在的启动子区域(-86^-336bp),且发现TATA框、CAAT框、GC框和CRE等调控元件及CREB、LSF和Sp1等多种转录因子。MITFM基因编码的蛋白是定位于细胞核和细胞质的不稳定、可溶性亲水蛋白质。亚细胞定位结果提示该蛋白在细胞核、细胞质和线粒体的概率较高,分别为65.2%、17.4%和8.7%。DNAMAN软件对MITF-M基因编码蛋白的二级结构预测发现,该蛋白由α螺旋(33.66%)、β折叠(16.66%)和无规卷曲(49.68%)组成,且不存在跨膜区域和信号肽。蓝狐与其他物种MITF-M基因编码的氨基酸序列同源性对比和系统进化树分析均提示蓝狐与犬的遗传亲缘关系最近,与哺乳动物和禽类均具有较高的同源性(>89.1%),说明MITF-M基因编码区在物种进化过程中较为保守。本研究为深入研究MITF-M基因调控狐狸被毛颜色的分子遗传机制奠定了理论基础。
- 郭敏张东林刘艳军彭永东王建涛付志新董淑珍刘铮铸巩元芳李祥龙
- 关键词：蓝狐编码区生物信息学分析
- 美洲水貂TYRP1基因编码蛋白质结构及功能的生物信息学分析被引量：6
- 2018年
- 基于生物基因组学数据库,对美洲水貂酪氨酸酶相关蛋白质1(TYRP1)基因进行生物信息学分析,为其遗传特性及编码蛋白质功能机制的研究提供基础数据。生物信息学分析结果表明,美洲水貂TYRP1基因共编码537个氨基酸,其编码产物为不稳定的亲水蛋白质。二级结构主要以α-螺旋和无规卷曲为主,含有1个酪氨酸酶超家族结构域,存在信号肽、跨膜结构域和二硫键。该蛋白质主要在内质网中发挥细胞被膜、运输和结合的作用,同时还通过信号转导在细胞内发挥其生物学作用。系统进化情况和动物分类学基本一致,美洲水貂和雪貂的亲缘关系最近。美洲水貂TYRP1基因编码蛋白质在生物进化中具有较强保守性,该基因结构和功能的分析为水貂TYRP1基因遗传特性的进一步研究奠定了基础。
- 王亚琪郭敏刘铮铸耿立英张传生巩元芳李祥龙彭永东
- 关键词：毛色蛋白质结构生物信息学
