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邱旭华
作品数:
2
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供职机构:
江苏大学生命科学研究院
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发文基金:
转基因生物新品种培育专项
江苏省高校自然科学研究项目
江苏省博士后科研资助计划项目
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相关领域:
生物学
农业科学
自然科学总论
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合作作者
刘晓光
江苏大学食品与生物工程学院
刘海军
江苏大学生命科学研究院
陈克平
江苏大学生命科学研究院
杨艳华
江苏大学生命科学研究院
朱克明
江苏大学生命科学研究院
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江苏大学
作者
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杨艳华
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刘海军
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刘晓光
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1篇
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基于Make2D-DB Ⅱ构建水稻二维电泳-质谱联动数据库
2013年
基于Make2D-DB Ⅱ软件包构建了一个水稻二维电泳-质谱联动数据库Rice2DDB,介绍了该数据库的构建方法和步骤,为快速发展的水稻蛋白质组学研究提供了数据管理和交流的平台,对其他物种的蛋白质组学研究也具有参考价值。
刘海军
朱克明
杨艳华
邱旭华
陈克平
关键词:
水稻
二维电泳
数据库
II
普城沙雷氏菌pigX基因的生物信息学分析
2017年
通过生物信息学方法对普城沙雷氏菌(Serratia plymuthica)G3菌株中GGDEF/EAL结构域蛋白编码基因pigX启动子区域的调控信息以及编码蛋白质的理化特性和结构特点进行了解析。利用启动子分析软件Softberry和Neural Network Promoter Prediction对pigX基因编码区上游序列进行启动子预测,利用生物信息学方法对PigX蛋白的氨基酸组成和理化特性、磷酸化和糖基化位点、跨膜结构、信号肽二级结构和保守结构域等进行预测分析。结果显示:pigX启动子区有Fur和SoxS结合位点;PigX是微亲水性的脂结合蛋白,具有信号肽和跨膜结构域、糖基化和高水平磷酸化位点,α-螺旋和无规则卷曲是其主要二级结构。生物信息学分析预测结果表明G3菌株PigX具有较高水平磷酸化位点及由α-螺旋和无规则卷曲组成的二级结构,这与预测的PigX参与铁代谢和氧化应激反应及作为Csr D同源物与CSRB家族sRNAs分子结合的功能相吻合。
吴岩
邱旭华
刘晓光
关键词:
生物信息学
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