严慧 作品数:12 被引量:14 H指数:2 供职机构: 湖北医药学院 更多>> 发文基金: 湖北省教育厅科学技术研究项目 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 化学工程 更多>>
基于网络药理学和分子对接探讨蛇床子治疗乳腺癌的作用机制 被引量:4 2022年 利用网络药理学和分子对接探讨蛇床子抗乳腺癌的分子机制。采用中药系统药理学数据库与分析平台获取中药蛇床子的化学成分及其相关靶点,借助Uniprot数据库进行基因转换;在GeneCards、OMIM数据库中检索乳腺癌疾病的相关靶点;利用Venn在线软件获取药物与疾病的共同靶点;由Cytoscape 3.7.2绘制药物-成分-靶点-疾病网络;STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络;基于DAVID数据库对靶点进行基因本体功能富集和京都基因与基因组百科全书通路富集分析,运用AutoDock软件对蛇床子的关键活性成分与作用靶点进行分子对接验证。结果表明,蛇床子的17个有效成分通过调控19个靶点和56条通路对乳腺癌产生作用,4个关键的化合物分别为β-谷甾醇、(E)-2,3-bis(2-keto-7-methoxy-chromen-8-yl)acrolein、豆甾醇、蛇床子素,可通过HSP90AA1、JUN、PRKACA、KDR等关键靶点介导癌症通路、癌症的蛋白聚糖、粘着斑、PI3K-Akt等信号通路发挥抗乳腺癌作用。该研究初步揭示了蛇床子抗乳腺癌的作用机制,为蛇床子的临床应用及其治疗乳腺癌的相关研究提供了理论依据。 柯昌虎 潘长江 严慧 刘佳玲 陈苗 李志浩关键词:网络药理学 分子对接 蛇床子 乳腺癌 基于网络药理学和生物信息学探讨满药复方木鸡颗粒治疗肝癌的分子机制 2024年 利用网络药理学和生物信息学方法揭示复方木鸡颗粒治疗肝癌的作用机制。通过TCMSP、Swiss Target Prediction数据库分别获取复方木鸡颗粒的活性成分以及相关靶点;在GEO数据库筛选肝癌的相关靶点;利用Venny 2.1在线平台获取药物与疾病的共同靶点;由Cytoscape 3.8.2绘制药物–成分–靶点–疾病网络;用STRING数据库构建PPI网络;通过DAVID数据库进行GO功能富集和KEGG通路富集分析;利用Kaplan Meier-Plotter数据库对关键基因的表达量及预后关联性进行分析;运用AutoDock软件对关键成分和靶点进行分子对接验证。复方木鸡颗粒中共获得37个活性成分,筛选出57个共有靶点,涉及生物过程98条、细胞成分17条、分子功能37条,介导15条信号通路。生存期分析结果显示,ESR1、CYP3A4、G6PD基因的表达量与肝癌患者的生存期具有相关性。分子对接表明筛选的6个活性成分与6个关键靶点蛋白之间具有较好的结合能力。复方木鸡颗粒中的大豆皂苷C、柚皮素、β-谷固醇、汉黄芩素等活性成分可以作用于ESR1、CYP3A4、G6PD等靶点,可能通过P53、戊糖磷酸途径、MAPK等信号通路发挥治疗肝癌的作用。 柯昌虎 严慧 严慧 李志浩 李志浩 朱军关键词:复方木鸡颗粒 肝癌 网络药理学 生物信息学 分子对接 基于网络药理学探讨蛇床子-补骨脂治疗乳腺癌骨转移的作用机制 被引量:2 2023年 目的基于网络药理学探讨蛇床子-补骨脂治疗乳腺癌骨转移的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中药分子机制的生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)检索药物的化学成分,借助Swiss Target Prediction数据库获取药物成分对应的相关靶点;在GeneCards、在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库中检索乳腺癌骨转移的相关靶点;利用Venny 2.1在线软件获取药物与疾病的共同靶点;由Cytoscape 3.8.2绘制药物-成分-靶点-疾病网络;STRING数据库构建蛋白相互作用网络;借助DAVID数据库进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。结果蛇床子-补骨脂中40个有效成分通过调控99个靶点和147条通路对乳腺癌骨转移产生作用。香叶木素、(E)-2,3-双(2-酮-7-甲氧基-甲氧羰基-8-基)丙烯醛、异补骨脂二氢黄酮、cniforin B、补骨脂甲素、O-乙酰异蛇床素、O-乙酰二氢欧山芹酯、补骨脂二氢黄酮甲醚、美花椒内酯、邻-异戊酰基二氢山芹醇、欧芹素、蛇床子素等成分可以通过表皮生长因子受体(EGFR)、RAC-α丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(Akt1)、类固醇受体辅助活化因子(SRC)等关键靶点介导癌症途径、内分泌抵抗、磷脂酰肌醇3激酶-丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(PI3K-Akt)、癌症中的蛋白聚糖、癌症中的微小RNA、癌症中的中心碳代谢、催乳素、细胞衰老、细胞凋亡、糖尿病并发症中的晚期糖基化终产物-晚期糖基化终产物受体(AGE-RAGE)、Ras、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)等信号通路来治疗乳腺癌骨转移。结论蛇床子-补骨脂可以通过多成分、多靶点、多途径参与乳腺癌骨转移的治疗,为其临床应用及治疗乳腺癌骨转移的机制深入研究提供了理论依据。 柯昌虎 严慧 陈琴华 黄慧敏 昝继斌 何晓东关键词:蛇床子 补骨脂 乳腺癌骨转移 网络药理学 基于GEO芯片和网络药理学探讨康力欣胶囊治疗乳腺癌的作用机制 2024年 目的:利用GEO芯片和网络药理学探讨康力欣胶囊治疗乳腺癌的分子机制。方法:通过TCMSP、HERB、Batman-TCM数据库检索药物的化学成分,借助Swiss Target Prediction数据库获取药物成分对应的相关靶点;在GEO数据库中检索乳腺癌的相关靶点;利用Venny 2.1.0在线软件获取药物与疾病的共同靶点;由Cytoscape 3.8.2绘制药物-成分-靶点-疾病网络;STRING数据库构建PPI网络;借助DAVID数据库进行GO功能富集和KEGG通路富集分析;运用AutoDock软件对关键的活性成分和靶点进行分子对接验证。结果:康力欣胶囊中59个有效成分通过调控106个靶点和43条通路对乳腺癌产生作用,法尼斯淝醇A、多胶阿魏素、宽叶阿魏酮、山奈酚、法尼斯淝醇B、泽兰黄醇素、槲皮素、宽叶阿魏醇、啤酒甾醇、阿魏种素等成分可以通过EGFR、JUN、PPARG、PTGS2、CCNA2、CHEK1、CDK1、CDK2、MMP9、TOP2A等关键靶点介导癌症的中枢碳代谢、细胞周期、代谢途径、癌症途径、AMPK、松弛素、FoxO、IL-17、Ras、HIF-1、MAPK、钙、胰岛素等信号通路来治疗乳腺癌。分子对接分析发现10个靶点蛋白与10个活性成分具有较好的结合能力。结论:康力欣胶囊可以通过多成分、多靶点、多途径参与乳腺癌的治疗,为其临床应用及治疗乳腺癌的机制深入研究提供了理论依据。 柯昌虎 严慧 严慧 黄慧敏关键词:乳腺癌 网络药理学 分子对接 丹参酮ⅡA干预乳腺癌的研究进展 2017年 总结近年来丹参酮ⅡA抗乳腺癌作用及其机制的相关研究进展。丹参酮ⅡA是从中药丹参中提取的脂溶性活性成分,药理活性多样。丹参酮ⅡA可以通过抑制细胞生长和增殖、诱导细胞凋亡、抑制细胞侵袭和迁徙、抑制肿瘤血管生成、逆转多药耐药等方式防治乳腺癌。 柯昌虎 姜雪强 严慧 邵将 丁雪茹 李志浩关键词:乳腺癌 基于网络药理学和分子对接探讨黄精抗衰老的作用机制 被引量:1 2023年 利用网络药理学和分子对接揭示黄精(Polygonati Rhizoma)抗衰老的物质基础及作用机制。通过TCMSP数据库获取黄精的化学成分,借助Swiss target prediction数据库收集黄精的化学成分对应的相关靶点;在GeneCards、OMIM、DiGSeE、HAGR数据库中筛选衰老疾病的相关靶点;利用Venny 2.1在线软件获取药物与疾病的共同靶点;由Cytoscape 3.8.2软件绘制药物-成分-靶点-疾病网络;利用STRING数据库构建蛋白质相互作用网络;通过DAVID数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析,运用AutoDock软件对关键的活性成分和作用靶点进行分子对接验证。结果表明,黄精的12个有效成分通过调控81个靶点和79条信号通路产生抗衰老作用,5个关键的化学成分为黄芩素、4′,5-二羟基黄酮、甘草素、(2R)-7-羟基-2-(4-羟基苯基)-苯并四氢吡喃-4-酮、zhonghualiaoine 1,可通过EGFR、VEGFA、HIF1A、ESR1、STAT3等关键靶蛋白介导癌症途径,癌症中的蛋白多糖、HIF-1、Ras、癌症的中枢碳代谢、PI3K-Akt、FoxO、Rap1等信号通路发挥抗衰老作用。分子对接表明筛选的靶点蛋白与有效活性成分具有较好的结合活性。 柯昌虎 严慧 赵阳 朱军 李志浩关键词:衰老 网络药理学 分子对接 基于网络药理学和分子对接探讨丹红注射液治疗急性心肌梗死的作用机制 2024年 目的 利用网络药理学和分子对接探讨丹红注射液治疗急性心肌梗死的分子机制。方法 通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)检索丹红注射液的化学成分,借助Swiss Target Prediction数据库获取药物成分对应的相关靶点;在人类基因数据库(GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)和基因疾病关联数据库(DisGeNET)中检索急性心肌梗死的相关靶点;利用Venny 2.1在线软件获取药物与疾病的共同靶点;由Cytoscape 3.8.2绘制药物-成分-靶点-疾病网络;应用STRING数据库构建蛋白相互作用网络;借助注释、可视化和集成发现数据库(DAVID)进行基因本体论(GO)功能富集与京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;运用AutoDock软件对关键的活性成分和作用靶点进行分子对接验证。结果 丹红注射液中63个有效成分通过调控137个靶点和132条通路对急性心肌梗死产生作用,紫丹参素C、木犀草素、黄芩素、香紫苏醇、山柰酚、槲皮万寿菊素等成分可以通过肿瘤坏死因子、外消旋-α丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶、白细胞介素1β、类固醇受体共激活因子、丝裂原活化蛋白激酶3、信号转导和转录激活因子3等关键靶点介导C型凝集素受体、肿瘤坏死因子、内分泌抵抗、催乳素、磷脂酰肌醇-3-激酶-丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶、Janus激酶-信号传导和转录激活因子等信号通路来治疗急性心肌梗死。分子对接结果显示靶点蛋白与活性成分具有较好的结合能力。结论 丹红注射液可以通过多成分、多靶点、多途径参与急性心肌梗死的治疗,为其临床应用及其治疗急性心肌梗死的机制深入研究提供了理论依据。 柯昌虎 吴亚晴 黄慧敏 严慧关键词:丹红注射液 急性心肌梗死 网络药理学 分子对接 正交设计优选金银花涂膜剂成膜材料的制备工艺 被引量:2 2017年 目的:优选金银花涂膜剂成膜材料的配比。方法:以涂膜剂外观性状、成膜时间为考察指标,10%PVA(A)、10%白及(B)和甘油(C)的用量为考察因素,采用L_9(3~3)正交实验方法,确定金银花涂膜剂成膜材料的最佳配比。结果:最佳配比组合为A3B3C1,即10%PVA、10%白及和甘油的用量分别为10 mL、6 mL、1 mL。结论:该工艺确定的成膜材料配比合理,成膜性能最优。 张萌瑶 郑欢 柯昌虎 柯昌虎 严慧 何晓东关键词:正交设计 酞酰亚胺衍生物的生物活性研究进展 2015年 酞酰亚胺衍生物已被发现具有广泛的生物活性,是一类潜在的多用途先导化合物,在医药领域备受人们关注。本文对酞酰亚胺衍生物降血脂、抗炎、抗菌、抗惊厥、α-糖苷酶抑制作用等生物活性的研究进展进行综述。 柯昌虎 李鹏 边晓丽 严慧 陈琴华关键词:酞酰亚胺 衍生物 生物活性 基于网络药理学和分子对接探讨金银花口服液防治新型冠状病毒感染的作用机制 被引量:1 2023年 利用网络药理学和分子对接探讨金银花口服液防治新型冠状病毒感染的分子机制。通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索药物的化学成分,借助Swiss Target Prediction数据获取药物成分对应的相关靶点;在GeneCards、CTD、TTD、DrugBank数据库中检索疾病的相关靶点;利用Venny 2.1.0在线软件获取药物与疾病的共同靶点;由Cytoscape 3.8.2绘制药物-成分-靶点-疾病网络;String数据库构建蛋白互作网络;借助David数据库进行基因本体论(gene ontology,GO)功能富集和京都基因和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;运用AutoDock软件对成分和靶点进行分子对接验证。结果发现,金银花口服液中16个有效成分通过调控88个靶点和108条通路对新型冠状病毒感染产生作用,伞房花耳草素、金圣草素、木犀草素、亚油酸乙酯、山奈酚、槲皮素等成分可以通过AKT1、SRC、EGFR、HIF1A、PPARG、MMP9、ESR1、MAPK1、PTGS2、MMP2等关键靶点调控HIF-1、化学致癌-受体激活、内分泌抵抗、粘着斑、PI3K-Akt、VEGF、松弛素、ErbB、丙型肝炎、乙型肝炎、Rap1等信号通路来治疗新型冠状病毒感染。分子对接结果显示,靶点蛋白与活性成分具有较好的结合能力。结果表明,金银花口服液可以通过多成分、多靶点、多途径参与新型冠状病毒感染的防治,这为其临床应用及深入研究防治新型冠状病毒感染的机制提供了理论依据。 柯昌虎 吴亚晴 丁雪茹 丁雪茹 黄慧敏关键词:网络药理学 分子对接