吴晶晶
- 作品数：2 被引量：6H指数：2
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- 米曲霉6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶基因(gnd)的克隆及生物信息学分析被引量：3
- 2012年
- 采用PCR技术从米曲霉CICC2012菌株基因组中克隆6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶基因(gnd),并利用生物信息学手段对其氨基酸序列、进化树、理化性质、蛋白质结构等进行分析。序列测定和分析结果表明,gnd基因序列长为1 723bp,包含1个1 551bp的开放阅读框,编码516个氨基酸;gnd基因编码的6PGDH氨基酸序列与黄曲霉6PGDH基因的同源性为99%,存在的丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸磷酸化位点分别有11、2和6个;6PGDH蛋白分子量为57.3kD,等电点为5.63;gnd基因编码蛋白二级结构α-螺旋区域占44.57%,β-折叠区域占12.79%,无规则卷曲区域占42.64%;氨基酸残基11～195位点为NADP+结合区域。
- 吴晶晶洪志宏张卡陈宏文
- 关键词：米曲霉克隆生物信息学
- 米曲霉6-磷酸葡萄糖脱氢酶基因gsdA的克隆及生物信息学分析被引量：3
- 2012年
- 6-磷酸葡萄糖脱氢酶催化6-磷酸葡萄糖生成6-磷酸葡萄糖酸,并生成NADPH,是微生物胞内磷酸戊糖途径(PPP)的关键酶。本研究以食品安全菌米曲霉CICC2012为材料,克隆获得6-磷酸葡萄糖脱氢酶基因(GenBank登录号:JN123468)。序列分析表明,该酶是由222个氨基酸组成的亲水性蛋白;128～134位氨基酸序列DHYLGKE为活性区域;170～176位氨基酸序列GTEGRGG可能为辅因子结合位点。进化树分析表明,米曲霉6-磷酸葡萄糖脱氢酶同其他丝状真菌及酵母的G6PDH较相似。
- 刘薇吴晶晶陈宏文
- 关键词：克隆生物信息学分析
