- 2012-2013年广州地区散发性腹泻诺如病毒流行病学调查被引量:6
- 2014年
- 目的调查2012—2013年广州市散发性腹泻诺如病毒(NoV)流行状况和流行特点。方法收集2012—2013年广州地区门急诊散发性腹泻患者粪便标本2236份,采用荧光定量RT—PCR对采集的标本进行NoV核酸检测并初步分型,收集并分析病人的临床基本信息,分析NoV阳性检出率在不同年龄段、性别、月份季节差异,同时对NoV阳性的标本进行A组轮状病毒、B组轮状病毒、C组轮状病毒、腺病毒、札如病毒、星状病毒检测,研究其混合感染情况。结果NoV阳性检出率为10.60%(237/2236),以GⅡ型为主。NoV在18~40岁的青年人中检出率最高(16.47%),7~17岁少年最低(3.67%),男女检出率差异无统计学意义(P〉0.05)。NoV全年都可检测到,夏季为高发季节,其中7-8月份检出率最高。NoV与其他肠道病毒共感染率为14.35%(34/237),其中与A组轮状病毒共感染率最高。结论广州地区NoV夏季为高发季节。在18-40岁的青年人中检出率最高,以GⅡ型感染为主,混合感染最常见为A组轮状病毒。
- 汪杨徐霖罗燕芬钟慧玲张素粉张定梅朱勋曾谷城曹开源
- 关键词:诺如病毒RT-PCR
- 前列腺癌细胞转移相关基因的筛选被引量:2
- 2015年
- 目的通过对si RNA-PSMA-LNCa P、PC-3和LNCa P前列腺癌细胞株进行肿瘤转移基因芯片分析,筛选出与前列腺癌细胞转移相关的基因,并对芯片结果进行验证。方法利用肿瘤转移基因芯片技术,对si RNA-PSMALNCa P细胞株、PC-3细胞株和LNCa P前列腺癌细胞株进行肿瘤转移相关基因表达差异分析,从中筛选出可能调控前列腺癌细胞转移的基因,并利用real-time PCR的方法在前列腺特异膜抗原(PSMA)阳性/阴性的前列腺癌细胞株和临床样品中对筛选得到的基因进行进一步验证。结果从肿瘤转移基因芯片结果筛选得到了3种在PSMA表达抑制或不表达情况下显著上调的基因:MMP3、CDH6和MTSS1;3种基因的表达在PSMA阳性细胞株和PSMA阴性细胞株中与芯片结果一致;利用临床组织对肿瘤转移基因芯片结果验证,结果显示3种前列腺癌细胞转移相关基因的表达水平与前列腺癌临床分级和PSMA的表达呈负相关。结论发现了3种可能参与调控前列腺癌细胞转移的基因:MMP3、CDH6和MTSS1。它们的表达水平与前列腺癌临床分级、PSMA的表达呈负相关,可能参与了由PSMA介导的前列腺癌细胞的转移。
- 马建宏曹开源徐霖钟慧玲张素粉罗虹娇庹玖玲张甜刘建中
- 关键词:前列腺癌前列腺特异膜抗原肿瘤细胞转移
- 2010-2012年广州地区人冠状病毒分子进化分析被引量:1
- 2017年
- 目的 了解2010-2012年广州地区发热呼吸道感染患者的人冠状病毒各亚型分子进化情况.方法 采用RT-PCR法扩增HCoV-OC43、HCoV-229E和HCoV-NL63阳性标本的NP、RdRp和S基因部分片段,构建载体后进行测序,利用Bio-edit、Mega4.0、Clustal1.83等生物信息学软件对测序成功的基因序列进行比对和分析,建立HCoV-OC43、HCoV-229E和HCoV-NL63不同基因区域的分子进化树.结果 2010-2012年期间,HCoV-OC43、HCoV-229E和HCoV-NL63亚型在广州均未检测到重大变异株或重组株.HCoV-OC43与Belgium和中国香港来源流行株亲缘关系较近(GenBank登录号JN129834和AY903460);HCoV-229E与Amsterdam来源的病毒株亲缘关系最近(GenBank登录号JX503060);HCoV-NL63与中国北京和Amsterdam来源的流行株亲缘关系较近(GenBank登录号JX104161和DQ445911).各亚型NP和RDRp为保守基因,S基因变异较大.结论 2010-2012年期间,广州至少存在3种HCoV-OC43、HCoV-229E和HCoV-NL63流行株,没有发现重大变异株或重组株.各亚型NP和RDRp均为保守基因,可用于病毒的检测,S基因变异较大,适用于对分子变异规律的研究.
- 庹玖玲黄旭斌杨权罗洪娇周凯张素粉张甜曹开源徐霖
- 关键词:呼吸道感染分子进化
- 2011-2013年广州地区腹泻病毒的病原学研究被引量:13
- 2015年
- 目的调查2011-2013年广州地区7种主要腹泻病毒的流行状况和特点。方法收集2011-2013年广州地区腹泻患者粪便标本1 587份,采用ELISA检测粪便标本中A组轮状病毒抗原,用荧光定量RT-PCR的方法对采集的粪便标本进行6种病毒核酸检测,结合病人的临床资料进行病原学特征分析。结果 1 587份粪便标本中571例检出为腹泻病毒阳性,检出率为35.98%,主要腹泻病毒的检出率分别为:A组轮状病毒18.15%(288/1 587)、诺如病毒12.10%(192/1 587)、腺病毒6.87%(109/1 587)、星状病毒1.83%(29/1 587)、札如病毒0.69%(11/1 587)、B组轮状病毒0.25%和C组0.19%;腹泻病毒在1~岁婴幼儿和75~93岁老人腹泻病毒的总检出率最高,分别为57.57%和51.65%,在7~15岁少年检出率降到最低24.36%;〈3岁婴幼儿、3~74岁人群、75~93岁老人组检出率分别为43.62%、30.66%、51.56%,差异有统计学意义(P〈0.05);男女检出率差异无统计学意义(P〉0.05);腹泻病毒全年均可检出,夏季以诺如病毒感染为主而秋冬季以A组轮状病毒感染为主。结论 2011-2013年间广州地区腹泻病毒发病率较高,全年均有检出;发病率无性别差异;流行高峰出现在3月份;3岁以下幼儿和75岁以上老人是腹泻病毒监测的重点人群。
- 洪展桐徐霖钟慧玲张素粉罗虹娇庹玖玲张甜曹开源
- 关键词:腹泻病毒病毒性腹泻病原学
- 2011-2013年广州地区发热呼吸道感染患者的人流感病毒监测及其亚型的流行特征分析被引量:8
- 2015年
- 目的了解2011-2013年广州地区发热呼吸道症候群患者的人流感病毒及其亚型流行特征。方法收集广州市2011-2013年5家哨点医院共2 085例发热同时伴随有呼吸道感染症状病人的咽拭子标本及相关临床信息,对人流感病毒进行筛查,并结合临床信息,分析其流行特征。结果 2011-2013年收集到的2 085份样本中237例经普通PCR检测为人流感病毒阳性,检出率为11.4%,其中人流感病毒甲型和乙型阳性的标本分别为202例和35例(阳性率分别为9.68%和1.68%),以甲型流感为主;人流感病毒阳性率最高组别为学生(大中小学生)组,就诊率最高科室为儿科;男女比例1.34:1,性别发病率差异无统计学意义;亚型流行高峰呈不均匀分布,其中流感病毒甲型发病高峰为3-5月;流感病毒乙型分布较为分散;广州地区人流感病毒是以0~岁组、7~岁组及18~39岁年龄组易感,各年龄组发病率差异有统计学意义;广州地区甲型流感病毒也是以18~39岁组高发,各年龄组发病率差异无统计学意义;乙型感染则以7~17岁组发病率最高。结论 2011-2013年广州并未暴发大型的人流感病毒疫情,人流感病毒以甲型流感为主,乙型流感也有散发,未发现丙型流感病毒感染;流行高峰出现在3-5月,18~39岁年龄组发病率最高。
- 陈敏静徐霖钟慧玲张素粉罗虹娇庹玖玲张甜曹开源
- 关键词:呼吸道感染流行病学调查
- 2010-2015年广州地区HCoV流行病学特征及OC43亚型变异分析
- 研究背景呼吸道感染(RTI)是引起人类发病和死亡的主要原因之一,给人类的健康带来威胁同时增加社会经济负担。呼吸道感染分为上呼吸道感染(URTI)和下呼吸道感染(LRTI),常见病原体有病毒、细菌、真菌等,随着抗生素的发现...
- 张素粉
- 关键词:呼吸道感染人冠状病毒流行病学进化分析
- 文献传递
- 2012-2013年广州地区呼吸道合胞病毒感染的流行特征分析被引量:18
- 2015年
- 目的分析2012-2013年广州地区急性呼吸道感染人群中呼吸道合胞病毒(RSV)感染的流行状况和流行特点,为RSV感染的治疗和预防提供参考。方法收集2012年1月至2013年12月广州地区11家哨点医院发热同时伴有呼吸道感染症状病人的鼻咽拭子标本3 943份,采用巢式PCR的方法检测RSV的核酸,同时结合患者的临床基本信息,分析RSV的感染情况和人群、时间分布特点,对RSV阳性的标本进一步进行流感病毒(IFV)等7种常见呼吸道病毒的检测以了解其多重感染情况。结果共收集3 943份鼻咽拭子,1 374份来自门急诊病例,2 569份来自住院病例,男性2 446份,女性1 497份,年龄范围从0~98岁。共检出RSV阳性标本419份,检出率为10.63%,其中住院病例检出率(15.30%)高于门急诊病例(1.89%),男性检出率(11.28%)高于女性检出率(9.55%),差异均有统计学意义(P〈0.05)。所有人群中,婴幼儿(0~3岁)的检出率最高,为20.18%,占所有阳性病例的81.86%,随着年龄的增长RSV感染有下降趋势,中老年人的检出率有所升高。RSV感染的高峰期在1-4月,不同月份RSV的检出率差异有统计学意义(χ^2=3 068.914,P〈0.05)。阳性病例中100例病例混合感染了至少一种其他呼吸道病毒,占RSV总阳性病例的23.87%,85例为双重感染(85%),15例为三重感染(15%),流感病毒是最常见的混合感染病毒。结论 2012-2013年广州地区RSV感染以婴幼儿为主;住院病例感染率高于门急诊病例;高峰为1-4月,最常见的混合感染病毒是IFV。
- 钟慧玲徐霖张素粉罗虹娇曾谷城曹开源
- 关键词:呼吸道合胞病毒急性呼吸道感染流行病学
- 2012-2015年广州地区人冠状病毒及其亚型流行病学特征被引量:8
- 2016年
- 目的对2012-2015年广州地区发热呼吸道感染患者中人冠状病毒(HCoV)及亚型进行监测,分析其流行特征,为HCoV的预防和监控提供参考依据。方法收集2012年7月至2015年7月期间广州地区14家哨点医院符合标准的发热呼吸道感染病人的咽拭子标本,采用Real-time PCR方法进行HCoV及亚型检测,对HCoV阳性标本同时检测其它7种呼吸道病毒以了解混合感染情况;检测结果采用SPSS17.0统计分析,Excel作图表,结合病例信息,从人口学特征、年龄、季节、性别等方面对HCoV及亚型的流行特征进行分析。结果 2012-2015年间共收集了5 519份咽拭子标本,其中HCoV阳性病例174份,检出率为3.15%。住院病例检出率明显高于门急诊病例,差异有统计学意义(χ^2=9.432,P〈0.05);男女之间发病率差异无统计学意义(χ^2=0.848,P〉0.05);感染发病高峰出现在冬夏两季,各季节发病率差异有统计学意义(χ^2=29.352,P〈0.05);以41~66岁年龄组检出率最高为4.05%,各年龄段发病率差异有统计学意义(χ^2=5 519.000,P〈0.05)。亚型229E、OC43、NL63和HKU1检出分别为32例(0.58%)、92例(1.67%)、30例(0.54%)和19例(0.34%),HKU1和OC43同时感染1例,未检测到SARS和MERS亚型。阳性病例中51例发生混合感染,3例为三重感染,48例为二重感染,以混合流感为主。结论 2012-2015年广州地区HCoV流行高峰在冬夏两季,主要感染50岁以上的中老年人,因此要加强中老年人冬夏季节的防护,预防以HCoV感染导致的住院率和混合感染增高。
- 张素粉徐霖罗虹娇庹玖玲张甜曹开源
- 关键词:急性呼吸道感染人冠状病毒
- 2010-2012年广州地区腹泻患者中博卡病毒分子进化分析
- 2016年
- 目的了解2010-2012年广州地区腹泻患者的博卡病毒的分子变异情况。方法采用普通RT-PCR方法扩增2010-2012年14例人博卡病毒全基因组序列并测序,利用生物信息学软件分别对测序标本的全基因组和编码基因NS1、NP1和VP1/VP2序列进行比对和分析,了解广州地区人博卡病毒的进化变异特征。结果 14例HBo Vs全基因组长约5.2 kb,包含3个开放阅读框(ORF),编码3种蛋白:NS1、NP1、VP1/VP2。其中NS1基因高度保守,VP1/VP2有一些变异,但基于VP1/VP2序列进行的进化分析得到的结果与全基因组分析得到的结果一致。所有14例HBo V病毒株同属于HBo V1型,且没有发生明显的变异。结论2010-2012年广州地区分离到的14例人博卡病毒株同属于HBo V1型,没有发生明显的变异;NS1基因高度保守,VP1/VP2变异率相对较高,且进化分析结果与全基因组进化分析结果一致,可用于监测HBo V的变异。
- 刘均如徐霖钟慧玲张素粉罗洪娇张定梅张甜曹开源
- 关键词:腹泻人博卡病毒分子进化