徐霖
- 作品数：80 被引量：239H指数：8
- 供职机构：中山大学中山医学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广东省自然科学基金国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学生物学文化科学更多>>
- Endophilin B1基因及蛋白的生物信息学分析被引量：1
- 2012年
- 目的:利用生物信息学方法分析人Endophilin B1基因以及蛋白的结构,为进一步研究其功能和参与的调控机制提供一定的理论依据。方法:通过GenBank搜索Endophilin B1基因及蛋白序列,采用生物信息学方法分析该基因在不同物种中的差异,分析该蛋白的亚细胞定位,二级结构,功能域以及抗原表位。结果:该基因编码一个长度为365个氨基酸的蛋白,具有两个BAR和SH3两个功能域。Endophilin B1蛋白理论分子量为40796.3,理论等电点为5.78。二级结构中α螺旋(H)占56.44%,β折叠(E)占5.48%,无规卷曲占38.08%。Endophilin B1蛋白含有4个可能的N连接糖基化位点,5个潜在的酪蛋白激酶II磷酸化位点,7个豆蔻酰基化位点,3个PKC磷酸化位点以及2个酪氨酸激酶磷酸化位点。并进一步利用DNAstar软件分析了了该蛋白的抗原表位。结论:利用生物信息学预测出的结构和功能信息,能为Endophin B1蛋白的相关研究提供一定的信息基础。
- 王铸何霞冯发深关琳琳徐霖张定梅汪杨罗燕芬曹开源
- 关键词：B1BARDOMAINDOMAIN
- 免疫学与生物化学融合性实验教学的探索被引量：2
- 2009年
- 《分子医学技能》课程涵盖了免疫学、生物化学及分子生物学多项实验技术,是一门实用性极强的基础医学实验学科。为了使免疫学与生物化学实验教学更好地融合在一起,利用学生业余科研探索出免疫学和生物化学的综合性实验项目,使学生在系统学习和掌握基本技术的同时,能够综合地分析实验结果,及时联系医学应用,既提高了学生的学习兴趣,又培养学生的动手能力、应用能力和独立工作能力的综合性创新能力。
- 袁广卿周俊宜骆晓枫黄小荣徐霖李苏华沈泳芝皮艳娜乔中原
- 关键词：免疫学生物化学实验教学
- 2014—2015年广州地区人呼吸道合胞病毒和人博卡病毒的流行病学特征被引量：4
- 2017年
- 目的分析2014-2015年广州地区发热呼吸道感染患者中人呼吸道合胞病毒(RSV)和人博卡病毒(HBoV)的流行特征。方法采集2014年1月至2015年12月期间广州地区11家哨点医院符合条件的发热呼吸道感染患者的鼻咽拭子标本,采用Real-time PCR的方法对RSV和HBoV进行核酸检测,结合患者的临床资料,分析病毒感染的人口学特征、病例类型、年龄、时间等分布特点,对RSV或HBoV阳性标本同时检测其它7种常见呼吸道病毒以了解混合感染情况。结果 2014-2015年间共收集2 146份鼻咽拭子标本,其中RSV阳性标本223例,HBoV阳性标本22例,检出率分别为10.39%和1.03%;RSV住院病例检出率明显高于门急诊病例,差异有统计学意义(χ~2=41.868,P<0.05);HBoV住院病例与门急诊病例检出率无差异(χ~2=1.379,P>0.05);RSV检出率男性大于女性,差异有统计学意义(χ~2=5.855,P<0.05);HBoV检出率男女之间差异无统计学意义(χ~2=0.109,P>0.05);RSV和HBoV的检出均与年龄有关,检出率最高的年龄组分别为1岁以下婴幼儿和2岁的婴幼儿。RSV的感染高峰在1-4月,HBoV在8月和11月检出率较高。RSV阳性病例中混合感染47例,混合感染率为21.08%,其中双重感染44例,三重感染3例,鼻病毒是最常见的混合感染病毒。HBoV阳性病例中混合感染11例,混合感染率为50.00%,其中10例为双重感染,1例为三重感染。结论 2014-2015年广州地区RSV和HBoV均以感染婴幼儿为主。RSV的流行高峰在1-4月,鼻病毒是最常见的混合感染病毒;HBoV为全年分布不均,8月和11月检出率较高。
- 罗虹娇徐霖周凯袁磊张甜曹开源
- 关键词：急性呼吸道感染人呼吸道合胞病毒人博卡病毒流行病学调查
- 2009年广州人肠道病毒EV71型分离株重组分析被引量：2
- 2013年
- 对人肠道病毒EV71型2009年广州分离株Guangzhou09构建序列系统进化树并分析其重组特点。P1、P2和P3区种系发生进化树提示该分离株发生重组,相似性曲线以及bootscan进一步分析显示该分离株于非结构编码蛋白2B片段区(核苷酸位置4 027bp)处存在EV71亚型C4Shanghai-FJ713137与CVA409-HQ728260型间重组。该分离株与中国大陆目前优势株流行趋势一致,是广州首例发生型间重组且由C4亚型及CVA4型发生重组。
- 关琳琳汪杨罗燕芬徐霖张定梅曹开源
- 关键词：手足口病
- 体外诱导小鼠月不胎干细胞分化为T淋巴细胞
- 2008年
- 目的体外诱导小鼠胚胎干细胞（ESC）分化为T淋巴细胞。方法借助小鼠胚胎干细胞体外自然分化形成的类胚体（EB）中含有三胚层细胞的独特细胞环境，加入多种细胞因子和胸腺肽αl，体外诱导小鼠ESC向T淋巴细胞分化。利用流式细胞仪在不同时间点检测诱导细胞表面T淋巴细胞发育相关的表面标志CD25、CD44、CD3、CD4、CD8以及T细胞受体（TCR）αβ和TCRγδ分子的表达水平。结果诱导3d后，出现CD44^＋细胞；第6天出现CD44^＋、CD44^＋CD25^＋和CD25^＋细胞群；第15天开始表达CD3分子；1周后开始出现CD4^＋CD8^＋双阳性细胞。随着诱导时间的延长，CD3^＋细胞和CD4^＋CD8^＋细胞的百分比不断升高。培养1个月后，出现少量的CD4^＋和CD8^＋的单阳性细胞。诱导细胞早期表达TCRαβ和TCRγδ。随着诱导时间的延长，T细胞进一步成熟，诱导细胞以TCRαβ细胞为主。结论细胞网子和胸腺肽αl的共同作用可以在体外诱导小鼠胚胎干细胞分化成具有T淋巴细胞表型的细胞，且细胞的表型变化与T细胞体内正常的胸腺发育过程中的表型变化一致。
- 彭延文徐霖张秀明李树浓
- 关键词：胚胎干细胞T淋巴细胞小鼠
- 2011-2013年广州地区腹泻病毒的病原学研究被引量：13
- 2015年
- 目的调查2011-2013年广州地区7种主要腹泻病毒的流行状况和特点。方法收集2011-2013年广州地区腹泻患者粪便标本1 587份,采用ELISA检测粪便标本中A组轮状病毒抗原,用荧光定量RT-PCR的方法对采集的粪便标本进行6种病毒核酸检测,结合病人的临床资料进行病原学特征分析。结果 1 587份粪便标本中571例检出为腹泻病毒阳性,检出率为35.98%,主要腹泻病毒的检出率分别为：A组轮状病毒18.15%（288/1 587）、诺如病毒12.10%（192/1 587）、腺病毒6.87%（109/1 587）、星状病毒1.83%（29/1 587）、札如病毒0.69%（11/1 587）、B组轮状病毒0.25%和C组0.19%;腹泻病毒在1~岁婴幼儿和75~93岁老人腹泻病毒的总检出率最高,分别为57.57%和51.65%,在7~15岁少年检出率降到最低24.36%;〈3岁婴幼儿、3~74岁人群、75~93岁老人组检出率分别为43.62%、30.66%、51.56%,差异有统计学意义（P〈0.05）;男女检出率差异无统计学意义（P〉0.05）;腹泻病毒全年均可检出,夏季以诺如病毒感染为主而秋冬季以A组轮状病毒感染为主。结论 2011-2013年间广州地区腹泻病毒发病率较高,全年均有检出;发病率无性别差异;流行高峰出现在3月份;3岁以下幼儿和75岁以上老人是腹泻病毒监测的重点人群。
- 洪展桐徐霖钟慧玲张素粉罗虹娇庹玖玲张甜曹开源
- 关键词：腹泻病毒病毒性腹泻病原学
- 2011-2013年广州地区发热呼吸道感染患者的人流感病毒监测及其亚型的流行特征分析被引量：8
- 2015年
- 目的了解2011-2013年广州地区发热呼吸道症候群患者的人流感病毒及其亚型流行特征。方法收集广州市2011-2013年5家哨点医院共2 085例发热同时伴随有呼吸道感染症状病人的咽拭子标本及相关临床信息,对人流感病毒进行筛查,并结合临床信息,分析其流行特征。结果 2011-2013年收集到的2 085份样本中237例经普通PCR检测为人流感病毒阳性,检出率为11.4%,其中人流感病毒甲型和乙型阳性的标本分别为202例和35例（阳性率分别为9.68%和1.68%）,以甲型流感为主;人流感病毒阳性率最高组别为学生（大中小学生）组,就诊率最高科室为儿科;男女比例1.34：1,性别发病率差异无统计学意义;亚型流行高峰呈不均匀分布,其中流感病毒甲型发病高峰为3-5月;流感病毒乙型分布较为分散;广州地区人流感病毒是以0~岁组、7~岁组及18~39岁年龄组易感,各年龄组发病率差异有统计学意义;广州地区甲型流感病毒也是以18~39岁组高发,各年龄组发病率差异无统计学意义;乙型感染则以7~17岁组发病率最高。结论 2011-2013年广州并未暴发大型的人流感病毒疫情,人流感病毒以甲型流感为主,乙型流感也有散发,未发现丙型流感病毒感染;流行高峰出现在3-5月,18~39岁年龄组发病率最高。
- 陈敏静徐霖钟慧玲张素粉罗虹娇庹玖玲张甜曹开源
- 关键词：呼吸道感染流行病学调查
- 鉴定发热伴出疹症候群传染病相关病毒病原体的多重实时定量PCR的引物、探针及检测方法
- 本发明公开了鉴定发热伴出疹症候群传染病相关病毒病原体的多重实时定量PCR的引物、探针及检测方法。包括对水痘-带状疱疹病毒、人类小DNA病毒B19、肠道病毒（肠道病毒71型和柯萨奇病毒A16型）、登革热病毒、风疹病毒和麻疹...
- 黎孟枫朱勋吴珏珩曹开源何振健袁洁李隽张定梅徐霖杨纨张赫男
- 文献传递
- 小鼠FasL基因真核表达载体的构建及在HEK293细胞中的表达
- 2012年
- 目的构建含有小鼠Fas Ligand(FasL)基因的重组真核表达载体,并检测FasL蛋白在其稳定转染的HEK293细胞中的表达情况,为构建表达小鼠Fas L的树突状细胞(DC)模型,深入研究DC联合T细胞防治移植物抗宿主病(GVHD)的新方法奠定基础。方法从小鼠脾脏中提取RNA并逆转录为cDNA,以该cDNA为模板扩增FasL基因,插入pcDNA3.1(+)载体中构建pcDNA3.1(+)-FasL重组质粒,利用脂质体将其转染HEK293细胞,用G418筛选稳定表达细胞系,Western blot确定重组蛋白的表达。结果通过酶切及测序证实FasL序列正确插入表达载体pcDNA3.1(+),Western blot检测证实转染重组质粒的细胞能正确表达FasL蛋白,G418筛选后能够得到稳定表达FasL的抗性细胞株即FasL-HEK293。结论重组质粒pcDNA3.1(+)-FasL和稳定表达FasL的HEK 293细胞成功构建,为后续FasL-DC细胞的研究打下了坚实基础。
- 何霞汪杨何善阳王铸冯发深关琳琳罗燕芬潘金成曹开源徐霖
- 关键词：FASLIGAND基因转染HEK293细胞
- 2012-2013年广州地区散发性腹泻诺如病毒流行病学调查被引量：6
- 2014年
- 目的调查2012—2013年广州市散发性腹泻诺如病毒（NoV）流行状况和流行特点。方法收集2012—2013年广州地区门急诊散发性腹泻患者粪便标本2236份，采用荧光定量RT—PCR对采集的标本进行NoV核酸检测并初步分型，收集并分析病人的临床基本信息，分析NoV阳性检出率在不同年龄段、性别、月份季节差异，同时对NoV阳性的标本进行A组轮状病毒、B组轮状病毒、C组轮状病毒、腺病毒、札如病毒、星状病毒检测，研究其混合感染情况。结果NoV阳性检出率为10．60％（237／2236），以GⅡ型为主。NoV在18～40岁的青年人中检出率最高（16．47％），7～17岁少年最低（3．67％），男女检出率差异无统计学意义（P〉0．05）。NoV全年都可检测到，夏季为高发季节，其中7-8月份检出率最高。NoV与其他肠道病毒共感染率为14．35％（34／237），其中与A组轮状病毒共感染率最高。结论广州地区NoV夏季为高发季节。在18-40岁的青年人中检出率最高，以GⅡ型感染为主，混合感染最常见为A组轮状病毒。
- 汪杨徐霖罗燕芬钟慧玲张素粉张定梅朱勋曾谷城曹开源
- 关键词：诺如病毒RT-PCR
