邢旭东
- 作品数：1 被引量：1H指数：1
- 供职机构：哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院更多>>
- 发文基金：黑龙江省卫生厅科研项目更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 基于位置权重矩阵的核小体识别及功能分析被引量：1
- 2016年
- 为研究高通量的人类CD4+T细胞的核小体定位模式,使用迭代算法对核小体定位模式进行分类,并利用位置权重矩阵方法分别构建稳定核小体定位序列、动态核小体定位序列和连接区序列模型,通过十倍交叉验证评估模型性能,并与Segal方法与弯曲度方法进行比较,发现位置权重矩阵方法在敏感性、精度和准确性方面都具有一定优越性。同时采用滑窗法在全基因组选取候选序列进行核小体识别,挖掘核小体定位相关基因,并进行基因生物学进程功能富集分析,发现稳定与动态核小体、真实与潜在核小体对应的基因所参与调控的生物学过程各有不同,但也有一些生物学过程为不同类别核小体所共有,例如对细胞内大分子的调控功能。
- 岁品品邢旭东王宏崔颖
- 关键词：核小体定位位置权重矩阵
