王宏
- 作品数：10 被引量：32H指数：5
- 供职机构：哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金黑龙江省自然科学基金黑龙江省高等教育教学改革工程项目更多>>
- 相关领域：生物学文化科学医药卫生更多>>
- 面向实践能力培养的生物信息学课程体系建设被引量：3
- 2013年
- 生物信息学是新兴的多学科交叉科学,它的发展和人才培养对于我国未来生物医药产业发展具有重大影响。在教学实践基础上,介绍生物信息学专业课程体系建设方面的开创性工作,并探讨本科生培养的办学模式及培养经验。对于全面推广和提升生物信息学教育理论,提高我国计算生物学人才培养质量具有重要的指导意义。
- 王宏李霞徐良德
- 关键词：生物信息学课程体系
- R语言在生物信息实践中的应用被引量：5
- 2015年
- R语言是一种用来进行数据探索、统计分析、作图的计算机语言。与现有的计算机语言相比,它在计算和数据处理上具有强大的优势。同时,R语言应用简单、操作便捷,极大程度上降低了非计算机专业人员对于计算机语言掌握的难度。随着新一代测序技术和计算机技术的进步,生物信息学产生了大量新技术,新方法,为识别人类复杂疾病的治病靶点,阐明复杂疾病的发病机制,开发新的治疗药物成为可能。本文通过具体的案例分析阐明R语言在生物信息中的重要应用,为生物信息专业的研究者和师生提供有益的借鉴。
- 韩俊伟智慧王宏徐良德
- 关键词：R语言计算机语言生物信息
- 基于位置权重矩阵的核小体识别及功能分析被引量：1
- 2016年
- 为研究高通量的人类CD4+T细胞的核小体定位模式,使用迭代算法对核小体定位模式进行分类,并利用位置权重矩阵方法分别构建稳定核小体定位序列、动态核小体定位序列和连接区序列模型,通过十倍交叉验证评估模型性能,并与Segal方法与弯曲度方法进行比较,发现位置权重矩阵方法在敏感性、精度和准确性方面都具有一定优越性。同时采用滑窗法在全基因组选取候选序列进行核小体识别,挖掘核小体定位相关基因,并进行基因生物学进程功能富集分析,发现稳定与动态核小体、真实与潜在核小体对应的基因所参与调控的生物学过程各有不同,但也有一些生物学过程为不同类别核小体所共有,例如对细胞内大分子的调控功能。
- 岁品品邢旭东王宏崔颖
- 关键词：核小体定位位置权重矩阵
- 信息熵在生物医学中的应用
- 2016年
- 信息论在生物医学中的应用逐渐被认识，信息论创立的标志是1948年香浓第一次提出了信息熵的概念。随着现代科学技术的发展,信息熵等概念和方法已突破了香浓信息论的范围,被许多学科用于解决各自的实际问题,并且获得了成功。信息论已开始应用于生物医学的研究和应用，熵的概念也被引入现代生物医学的研究之中，成为现代医学研究的一种新思路、新方法。本文介绍了信息论在生物医学研究中的应用。
- 宿菲刘宝全王宏杨林丽
- 关键词：生物医学信息熵
- 基于表达及网络拓扑结构挖掘动脉粥样硬化风险疾病基因被引量：5
- 2010年
- 基于功能基因组信息、网络拓扑结构信息整合分析方法,利用基因表达谱数据和蛋白质互作数据挖掘动脉粥样硬化(AS)风险疾病基因,为从基因组层面研究动脉粥样硬化提供了新的视角.经过差异表达分析,支持向量机(SVM)的机器学习方法双重筛选,可以鉴别出可信度水平较高的风险疾病基因,对于研究动脉粥样硬化疾病基因在网络中的拓扑性质,建立基因与疾病发生发展过程的联系,提供了新的思路.得到了巨噬细胞样本中59个风险疾病基因,泡沫细胞中61个风险疾病基因.这些风险基因与已知疾病基因共享大部分动脉粥样硬化病变相关生物学过程及信号通路.并应用到对其他复杂疾病致病机理的研究中。
- 王宏曲晓莉赵研张静陈丽娜
- 关键词：动脉粥样硬化支持向量机
- 基于功能一致性和网络拓扑属性预测冠心病致病基因被引量：8
- 2009年
- 基于功能一致性利用蛋白质互作网络挖掘潜在的疾病致病基因,对于了解疾病致病机理和改进临床治疗至关重要.基于基因功能一致性和其在蛋白质互作网络中的拓扑属性将基因与疾病之间建立关联,对疾病风险位点内的基因进行了致病风险预测,并通过GO及KEGG功能富集分析方法进一步筛选,预测出新的致病基因.预测出了51个新的冠心病致病基因,分析发现大部分基因参与了冠心病的致病过程.为疾病基因的挖掘提出一个新的思路,从而有助于复杂疾病致病机理的研究.
- 赵研陈丽娜张良才王倩尚玉奎王宏李琬
- 人类蛋白质结构互作网络--结构域对网络拓扑与蛋白质功能的影响被引量：6
- 2010年
- 高通量的蛋白质互作数据与结构域互作数据的出现,使得在蛋白质组学领域内研究人类蛋白质结构互作网络,进一步揭示蛋白质结构与功能间的潜在关系成为可能.蛋白质上广泛分布的结构域被认为是蛋白质结构、功能以及进化的基本功能单元.然而,结合蛋白质的结构信息(例如蛋白质结构域数目、长度和覆盖率等)来研究这些表象后的内部机制仍然面临着挑战.将蛋白质分为单结构域蛋白质与多结构域蛋白质,并进一步结合蛋白质互作信息与结构域互作信息构建了人类蛋白质结构互作网络;通过与人类蛋白质互作网络进行比较,研究了人类蛋白质结构互作网络的特殊结构特征;对于单结构域蛋白质与多结构域蛋白质,分别进行了功能富集分析、功能离散度分析以及功能一致性分析等.结果发现,将结构域互作信息综合考虑进来后,人类蛋白质结构互作网络可以提供更多的单纯的蛋白质互作网络无法提供的细节信息,揭示蛋白质互作网络的复杂性.
- 陈丽娜王倩尚玉奎张良才孙钊何伟明赵研李琬王宏何月涵李霞
- 关键词：结构域蛋白质功能
- 基于人类蛋白质互作网络及基因调控网络挖掘共调控模块的组装性
- 网络中的共调控模块具有组装、关联多种生物学实体(基因、蛋白质复合物或生物学通路)的性质，并通过这种组装性性质，协调网络中的邻近区域，行使各种生物学功能。随着大量生物信息资源以及新的计算分析方法的出现，使得基于计算方法挖掘...
- 王宏
- 关键词：蛋白质网络转录调控网络
- 基于学科竞赛的医学创新型人才培养模式探索与实践被引量：1
- 2018年
- 为进一步发挥学科竞赛在创新人才培养中的重要作用,全面提高人才培养能力,推进产学协同育人向纵深发展,中国高等教育学会《高校竞赛评估与管理体系研究》专家工作组负责研制和发布了学科竞赛排行榜,并撰写出版《全国普通高校竞赛白皮书》。连续推出2012-2016年和2013-2017年两轮中国高等学校学科竞赛榜单,在国内各大高校中引起了较大反响。学科竞赛为高等医学教育带来了新的机遇与挑战,如何顺应新时代教育理念,在医学院校开展丰富的学科竞赛,为培养医学创新型人才提供助力,是当下高等医学教育工作者值得深入思考的问题。
- 王宏李勇常志强何月涵
- 关键词：学科竞赛教学改革
- 《生物信息学》课程科研教学一体化模式的研究与实践被引量：7
- 2015年
- 生物信息学(bioinformatics)是一门新兴学科,由生物学、医学、计算机学、信息管理学、应用数学以及统计学等多门学科交叉所形成,它极大地推动了诸如生命科学、医学等相关学科的发展。随着新一代测序技术和计算机技术的进步,生物信息学在许多领域取得了很大进步,如发现与识别人类疾病基因,研究基因与蛋白质的表达和功能,阐明疾病发生的遗传背景和分子机制,提出相应的复杂疾病的预防措施及开发新的治疗药物等。然而,在我国当前的《生物信息学》课程的教学中,仍然存在教学内容较为落后、教学方法相对单一、科研成果转化教学有待深化等问题。该文提出《生物信息学》课程科研教学一体化教学模式,期望通过该模式完善教学内容,改进教学方法,有效融合教学与科研,进而提高教学质量,增强学生应用理论知识解决实际生物学问题的能力。
- 韩俊伟李春权王宏徐良德李霞
- 关键词：生物信息学改进教学
