张国栋
- 作品数:4 被引量:6H指数:2
- 供职机构:苏州市立医院更多>>
- 发文基金:江苏省自然科学基金苏州市科技发展计划更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学更多>>
- 基于基质辅助激光解吸电离飞行时间技术的两种质谱检测系统对于临床常见菌株鉴定能力的研究被引量:2
- 2022年
- 目的:比较并评价基于基质辅助激光解吸电离飞行时间(MALDI-TOF MS)技术的两种质谱检测系统安图Autof ms1000和布鲁克Microflex LT在临床菌株鉴定中的应用。方法:选取2018年11月-2019年2月苏州市立医院临床分离的菌株共3312株(50个菌属和156个菌种)。临床常见细菌2397株、念珠菌570株、其他真菌15株,厌氧菌170株、其他细菌160株。同时采用两个质谱系统对上述菌株进行鉴定,结果不一致的菌株采用16/18S rDNA或内转录间隔区(ITS)序列测序确认结果。结果:安图Autof ms1000和布鲁克Microflex LT对上述所有临床菌株属水平总鉴定准确性分别为96.4%和94.3%,而二者种水平总鉴定准确性分别为85.0%和69.9%。570株念珠菌中,二者种水平鉴定准确性分别为81.6%和27.2%。15株其他真菌中,二者种水平鉴定准确性分别为86.7%和6.7%。误鉴定菌株数分别为5株和6株。结论:安图Autof ms1000和布鲁克Microflex LT在细菌鉴定应用方面具有一定的一致性。在真菌的鉴定中,Autof ms1000有一定的优势。二者质谱数据库均有改善优化的空间。
- 张宇琼张宇琼陆文香陈海鹏张国栋
- 关键词:细菌鉴定内转录间隔区
- 1株引起肺部感染的按蚊伊丽莎白菌的鉴定及耐药分析被引量:1
- 2023年
- 目的 分离鉴定1株引起肺炎的按蚊伊丽莎白菌并对其进行耐药分析。方法 利用MALDI Biotyper质谱仪、VITEK 2 Compact 30全自动细菌鉴定仪、VITEK MS质谱仪、Illumina Miseq测序仪对菌株进行鉴定,利用微量肉汤稀释法对菌株进行药敏试验。结果 MALDI Biotyper质谱仪和VITEK 2 Compact 30全自动细菌鉴定仪鉴定结果均为脑膜脓毒性伊丽莎白菌,VITEK MS质谱仪和Illumina Miseq全基因组测序鉴定结果均为按蚊伊丽莎白菌。药敏结果显示该菌涉及的耐药类别包括青霉素类、β-内酰胺/β-内酰胺酶抑制剂复合物、头孢类、碳青霉烯类、氨基糖苷类、四环素类、氯霉素类等,对上述各类别中的1种或多种抗生素耐药,但对哌拉西林、哌拉西林/他唑巴坦、米诺环素、替加环素敏感。结论 引起患者肺部感染的病原菌为按蚊伊丽莎白菌。该菌具有多重耐药现象,应加强监测和注意合理用药。
- 王小龙张国栋袁垆夏瑜张梦寒
- 关键词:肺部感染菌种鉴定多重耐药
- 抗人肝细胞生长因子受体单链抗体慢病毒载体的构建和应用被引量:3
- 2014年
- 目的构建可表达抗人肝细胞生长因子受体(HGFR)单链抗体(scFv)的慢病毒表达载体,将其感染HEK293细胞,检测该抗体的表达及与抗原结合活性。方法采用反转录PCR(RT-PCR)从分泌小鼠抗人HGFR抗体的杂交瘤细胞株(8E8)中扩增VH和VL基因,用重叠延伸PCR法将VH和VL进行拼接,得到含有信号肽SP-VH-linker-VL的单链抗体基因(HGFR-scFv),将其插入克隆载体pCR-Blunt中。用内切酶将HGFR-scFv基因从pCR-Blunt上切下,插入慢病毒载体pRRL-CMV中,经相应酶切和测序鉴定,正确构建慢病毒表达载体pRRL HGFR-scFv。磷酸钙法转染HEK293T细胞,48 h后通过荧光显微镜检测绿色荧光蛋白(GFP)的表达,将获得病毒颗粒进一步感染HEK293细胞,RT-PCR和ELISA检测scFv的表达情况。结果抗人HGFRscFv的慢病毒表达载体构建成功,病毒颗粒感染HEK293细胞后,得到了可以稳定表达抗人HGFR-scFv的细胞系;ELISA结果表明,scFv能与人HGFR特异性结合。结论成功克隆了小鼠抗人HGFR抗体的scFv基因,并构建其慢病毒表达系统。
- 陈永华郭佳尹衍新蒋明朱红胜张国栋李冰宇
- 关键词:肝细胞生长因子受体单链抗体慢病毒表达载体
- 产气克雷伯菌引起新生儿感染的临床分布特征及质谱同源性分析
- 2024年
- 目的分析产气克雷伯菌引起新生儿感染的临床分布特征及质谱同源性,为防控新生儿感染提供依据。方法回顾性收集2021年4月至2023年4月苏州市立医院新生儿科收集的58株非重复的产气克雷伯菌分离物。利用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)技术进行蛋白水平的同源性分析建库。使用MALDI Biotyper 3.1生成主成分分析(principal component analysis,PCA)和主谱图(main spectrum profile,MSP)树状图,以获得蛋白水平的同源性。结果51例感染患儿中以重症监护室、早产患儿及低体重感染患儿为主,分别占84.31%(43/51)、86.27%(44/51)和84.31%(43/51)。重症监护室内早产患儿气管插管患儿42例,占97.67%,低出生体重患儿气管插管患儿32例,占74.44%。51例产气克雷伯菌感染患儿绝大多数住院时间较长,住院时长>60 d的占25.49%。58株产气克雷伯菌临床标本主要从血、导管头、痰液、胃液、眼分泌物和尿液中分离出。6例患儿在不同样本类型中同时检出产气克雷伯菌。MSP聚类分析显示,58株产气克雷伯菌分为3个群,其中KA群14株,KB群6株,KC 38株。KC群主要与重症监护室有关,多伴有气管插管和血流感染。KB群主要与早产低体重患儿相关,而KA群主要与普通病房患儿相关。结论产气克雷伯菌具有高侵袭力,MALDI-TOF MS质谱快速同源性分析对产气克雷伯菌感染快速筛查具有一定的临床意义。
- 苏宁李文静张国栋
- 关键词:新生儿同源性分析