王惠珂
- 作品数:10 被引量:9H指数:2
- 供职机构:安徽农业大学动物科技学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金安徽省自然科学基金更多>>
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- 禽致病性大肠杆菌PhoP/Q调控的毒力基因及肠道感染应答基因的筛选
- 禽致病性大肠杆菌(Avian pathogenic Escherichia coli,APEC)是人兽共患细菌病的潜在病原。PhoP/Q是最早被发现对APEC致病性及逃逸宿主防御反应起重要作用的二元调控系统。为了进一步揭...
- 祁克宗王惠珂
- 关键词:禽致病性大肠杆菌差异基因
- APEC感染雏鸡小肠炎症相关基因的RNA-Seq分析被引量:1
- 2017年
- 【目的】研究禽致病性大肠杆菌(APEC)感染雏鸡小肠炎症相关基因表达的变化。【方法】对14日龄雏鸡腿部肌肉注射0.5mL/羽1×106 CFU/mL的APEC菌液,观察雏鸡的发病情况,并取病变严重雏鸡空肠为测序样品,同时以注射等量生理盐水为对照,采用RNA高通量测序(RNA-Seq)技术,筛选分析感染和未感染APEC雏鸡小肠炎症相关基因表达的变化。【结果】以差异倍数在2倍及以上为标准,从试验组与对照组共筛选出差异表达基因131个。GO分类结果显示,有87个差异基因得到491个GO功能注释,这些基因主要富集在炎症反应、肝素整合、白细胞介素-6的生物合成等过程。基于KEGG分析,仅有29个差异基因得到注释,涉及41个信号通路,主要参与的信号通路有PPAR、花生四烯酸代谢、MAPK等。【结论】APEC感染雏鸡后会引起机体炎症相关基因表达的变化,从中筛选出10个可能在炎症反应中具有重要影响的炎症相关基因。
- 王琦祁克宗涂健薛挺王惠珂徐柳柳
- 关键词:禽致病性大肠杆菌
- 禽致病性大肠杆菌PhoP/Q调控的毒力基因及肠道感染应答基因的筛选
- <正>研究目的禽致病性大肠杆菌(Avian pathogenic Escherichia coli,APEC)是人兽共患细菌病的潜在病原。Pho P/Q是最早被发现对APEC致病性及逃逸宿主防御反应起重要作用的二元调控系...
- 祁克宗王惠珂
- 文献传递
- 禽致病性大肠杆菌PhoP/Q调控的毒力基因及肠道感染应答基因的筛选
- 禽致病性大肠杆菌(Avian pathogenic Escherichia coli,APEC)是人兽共患细菌病的潜在病原.PhoP/Q是最早被发现对APEC致病性及逃逸宿主防御反应起重要作用的二元调控系统.为了进一步揭...
- 祁克宗王惠珂
- 关键词:禽致病性大肠杆菌差异基因
- 禽致病性大肠杆菌PhoP/Q调控的毒力基因及肠道感染应答基因的筛选
- 禽致病性大肠杆菌(Avian pathogenic Escherichia coli,APEC)的毒力因子致病性复杂。其可通过内毒素(LPS)损伤鸡肠道,破坏上皮组织,诱导应答基因的防御性表达,而应答基因的表达水平与AP...
- 王惠珂
- 关键词:禽致病性大肠杆菌肠道感染基因筛选
- 利用基因芯片筛选禽致病性大肠杆菌中与phoP/Q二元调控系统相关的耐药基因被引量:3
- 2017年
- 为筛选禽致病性大肠杆菌(APEC)中与phoP/Q二元调控系统相关的耐药基因表达谱情况并对耐药相关基因进行分析,本实验采用基因芯片技术对APEC野生株和△phoP/Q基因缺失突变株进行转录组的差异性比较,结果检测到713个差异表达基因,其中403个基因的表达水平上调,310个基因的表达水平下调。这些基因涉及生物过程、细胞组分、蛋白质分类及调控通路等功能,本研究着重从上述差异基因中筛选出了aphA、parE等耐药相关的功能基因。本研究对phoP/Q二元调控系统与APEC耐药调控的相关性进行了探索与分析,为进一步深入探寻APEC耐药性的调控机制提供了新的切入点与研究靶标。
- 薛媚祁克宗薛挺涂健王惠珂
- 关键词:基因芯片禽致病性大肠杆菌耐药基因
- 禽致病性大肠埃希菌及其PhoP/Q缺失株对鸡小肠内AvBD6的诱导表达
- 2017年
- 【目的】分析雏鸡感染禽致病性大肠埃希菌(Avian pathogenic Escherichia coli,APEC)及其PhoP/Q缺失株后β-防御素6(AvBD6)在小肠内的分布和表达规律。【方法】将14日龄雏鸡随机分为对照组、APEC攻毒组和PhoP/Q缺失株攻毒组,其中对照组雏鸡腿肌注射生理盐水0.5mL/只,APEC和PhoP/Q缺失株攻毒组雏鸡腿肌分别接种相同剂量1×106 CFU/mL的菌液,分别于攻毒后0,6,12,24,36和48h采集各组鸡小肠样品,用荧光定量PCR(FQPCR)方法对各组织内AvBD6mRNA的表达量进行检测,同时采用免疫组化(IHC)技术对AvBD6蛋白分布进行观察。【结果】FQ-PCR结果显示,感染后24~48h,APEC攻毒组雏鸡十二指肠、空肠、回肠的AvBD6mRNA表达量显著高于对照组(P<0.05),于48h达到峰值且显著高于0h(P<0.05);在同一时间下,PhoP/Q缺失株攻毒组AvBD6mRNA的表达量显著高于APEC攻毒组(P<0.05)。IHC结果显示,AvBD6主要分布于各小肠段的绒毛上皮细胞和肠腺部分。【结论】APEC能够诱导雏鸡肠道内AvBD6的表达,且PhoP/Q可能参与APEC调控AvBD6的抗感染作用。
- 李少参王惠珂祁克宗张煜薛挺涂健周秀红刘红梅
- 禽致病性大肠杆菌PhoP蛋白调控宿主菌DNA检测方法的建立与应用
- 2015年
- [目的]建立检测禽致病性大肠杆菌phoP蛋白调控宿主菌DNA的方法,为进一步研究phoP蛋白的调控因子奠定基础。[方法]将pho P基因克隆至p MD19-T载体,序列鉴定正确后转至表达载体pET32a,将重组质粒pET32a-phoP导入感受态细菌BL21(DE3),IPTG诱导表达,SDS-PAGE分析蛋白的大小,用Ni-NTA亲和层析柱纯化重组phoP蛋白。通过生物信息学分析法对phoP蛋白与DNA的结合基序进行预测,利用凝胶迁移试验(EMSA)鉴定该蛋白的结合活性。[结果]酶切及测序结果表明原核表达质粒构建正确;SDS-PAGE结果表明目的基因得到表达;重组目的蛋白相对分子质量约为42.9×103;用Ni-NTA亲和层析柱成功纯化获得了纯度大于90%的目的蛋白;凝胶迁移试验结果表明phoP蛋白能够结合血清毒力基因iss和溶血基因hly F启动子区。[结论]禽致病性大肠杆菌phoP重组蛋白成功表达且有结合iss和hly F基因启动子区的功能活性,说明phoP蛋白能够调控iss和hly F的表达。
- 王曼祁克宗涂健周秀红刘红梅王惠珂尹磊
- 关键词:禽致病性大肠杆菌
- 禽致病性大肠杆菌PhoP/Q调控的毒力基因及肠道感染应答基因的筛选
- 祁克宗王惠珂
- 基于RNA-Seq筛选禽致病性大肠杆菌损伤雏鸡小肠差异表达基因被引量:6
- 2016年
- 为筛选禽致病性大肠杆菌(APEC)感染雏鸡后其小肠损伤的差异表达基因,本研究利用APEC菌株经腿部肌肉途径接种两周龄雏鸡,对照组鸡以相同的途径注射相同体积的生理盐水,选取病变严重的肠道与对照组肠道,利用高通量RNA-Seq技术筛选出雏鸡小肠受APEC损伤后的差异表达基因,对其进行生物信息学GO功能分类和KEGG信号通路分析,并利用荧光定量PCR验证部分差异表达基因。结果显示差异变化在2倍以上的基因共有131个,其中74个上调表达,57个下调表达。GO功能分类结果显示,这些基因主要涉及到蛋白结合、免疫反应、转运活动等功能。KEGG分析表明这些差异表达基因参与PPAR、新陈代谢、细胞因子受体相互作用、Jak-STAT、RIG-I-样受体、吞噬体等信号通路。本研究为进一步研究APEC的致病作用及宿主抗病机制奠定了基础。
- 王惠珂李少参祁克宗薛挺涂健周秀红刘红梅
- 关键词:禽致病性大肠杆菌转录组测序差异表达基因