潘亮
- 作品数:5 被引量:10H指数:3
- 供职机构:扬州大学农学院更多>>
- 发文基金:江苏省“青蓝工程”基金国家教育部博士点基金江苏省自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 玉米淀粉合成相关基因ZmSSIIa的序列变异分析被引量:3
- 2014年
- 玉米淀粉合成酶Zm SSIIa在淀粉生物合成途径中主要作用是将支链淀粉的分支链由6~10个延长至12~25个,对于玉米籽粒产量和品质具有重要的影响。本研究在86个优异玉米自交系中对该基因进行基因序列定点捕获,并获得该基因全长为4836 bp的核苷酸序列。基因多态性分析发现,该基因座位上有78个SNP和19个Indel。玉米Zm SSIIa基因的编码区具有24个SNP,将该基因划分成9种编码区单倍型,并编码7种Zm SSIIa蛋白质。供试材料的群体中,Zm SSIIa基因至少经历8次重组,可能对单倍型的分化和连锁不平衡具有重要作用。中性进化测试表明该基因在供试群体中没有明显的人工选择。
- 杨泽峰张恩盈杜灿灿马思佳胡芸芸谢政文潘亮陈庆陈庆
- 关键词:玉米序列多态性单倍型
- 基于SNP分子标记连锁图谱的玉米农艺性状QTL定位
- <正>本研究以玉米自交系DH1M和T877杂交衍生的F_2群体为材料,利用覆盖玉米10条染色体的3072个SNP标记进行基因型检测和连锁图构建,以之进行该群体农艺性状的QTL定位。研究结果表明,3072个SNP中共有11...
- 许瀚元潘亮张恩盈杨泽峰徐辰武
- 关键词:玉米SNP
- 文献传递
- 玉米ELM1基因的序列变异及与株型和穗部相关性状的关联分析被引量:6
- 2014年
- 玉米elm1突变体使得光敏色素载色体合成受阻并导致光敏色素活性下降,从而使得突变体植株表现出对光的不敏感性。为研究玉米ELM1基因序列的多态性及其与主要农艺性状之间的关联,本研究对玉米ELM1基因在80个自交系中进行了目标序列重测序,并与株高和穗位高2个株型性状以及穗长、穗粗、轴粗、穗重、行粒数、穗行数和穗粒数7个穗部性状进行关联分析。ELM1基因在供试玉米自交系中共有85个变异,包括73个SNP和12个Indel。尽管该基因的编码区不含Indel,但15个SNP变异位点依然可以将编码区划分成7种单倍型,并编码6种ELM1蛋白质。关联分析发现,玉米ELM1基因中1个非同义突变位点与穗位高存在显著关联,另有2个非同义突变位点与行粒数存在显著关联。
- 杨泽峰张恩盈徐暑晖毛蓓丽潘亮陈庆徐辰武
- 关键词:玉米
- 玉米骨干亲本及其衍生系中Dwarf8基因的序列变异及与株高等性状的关联分析
- 2016年
- 玉米Dwarf8基因是显性矮化基因,由于其突变体在DELLA区的碱基缺失而使其呈组成型表达抑制GA响应,从而表现出植株矮小,种子发芽率低,叶片呈暗绿色等特性。对玉米Dwarf8基因在来源广泛的96份玉米自交系中进行了目标序列重测序,并与株高和穗位高2个株型性状以及穗长、穗粗、轴粗、穗质量、行粒数、穗行数和粒质量7个穗部性状进行关联分析。Dwarf8基因在供试玉米自交系中共有66个变异位点,包括18个SNP和48个In Del。在编码区发现24个变异位点,包括6个SNP和18个In Del位点。关联分析发现,玉米Dwarf8基因中1个非同义突变位点与株高显著关联,另外1个非同义突变位点与穗长显著关联。
- 胡雅潘亮徐辰武
- 关键词:玉米骨干亲本株高
- 玉米耐旱相关基因dbf1的序列变异分析被引量:3
- 2014年
- 玉米dbf1基因在干旱胁迫下的编码产物与DIP1蛋白相结合,调控植物激素脱落酸(ABA)响应基因rab17的表达,从而提高耐旱性。以B73的dbf1基因组序列为模板,对104个玉米自交系的dbf1基因进行测序,研究玉米dbf1基因的序列多态性。多态性分析表明,在全长为2 118 bp的序列中共发现48个SNP和12个In Del。尽管大部分变异位点集中在非编码区,但编码区的1个In Del和3个非同义突变位点的变异可以产生氨基酸序列改变。玉米dbf1基因的全长序列和编码区序列的变异位点可以分别将该基因划分成33和11种单倍型,并且编码7种蛋白质。在供试材料中,dbf1基因至少经历了9次重组,中性检测表明,该基因的进化没有偏离中性选择。
- 杨泽峰张恩盈蒋莹徐扬潘亮陈庆徐辰武
- 关键词:玉米DEL单倍型